164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1383 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  87.35 
 
 		 589 aa  1037    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  100 
 
 		 593 aa  1189    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  44.72 
 
 		 491 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  41.83 
 
 		 491 aa  265  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  44.72 
 
 		 491 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  35.76 
 
 		 527 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  44.72 
 
 		 491 aa  264  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  44.72 
 
 		 488 aa  264  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  44.72 
 
 		 488 aa  264  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  44.72 
 
 		 491 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  44.77 
 
 		 498 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  45.43 
 
 		 495 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  43.8 
 
 		 495 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  44.77 
 
 		 483 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  44.77 
 
 		 498 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  45.04 
 
 		 495 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  44.35 
 
 		 463 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  34.95 
 
 		 506 aa  243  9e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  37.08 
 
 		 487 aa  239  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  39 
 
 		 492 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  42.36 
 
 		 459 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  39.81 
 
 		 486 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  40.63 
 
 		 489 aa  233  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  42.07 
 
 		 459 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  36.81 
 
 		 527 aa  217  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  36.81 
 
 		 540 aa  216  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  37.94 
 
 		 528 aa  210  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  32.97 
 
 		 547 aa  206  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  36.84 
 
 		 479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  38.86 
 
 		 445 aa  198  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  40.28 
 
 		 523 aa  194  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  41.92 
 
 		 392 aa  183  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  36.92 
 
 		 441 aa  182  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  38.34 
 
 		 405 aa  180  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  40.11 
 
 		 466 aa  178  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  36.04 
 
 		 467 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  29.46 
 
 		 476 aa  161  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  37.46 
 
 		 432 aa  158  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  31.71 
 
 		 492 aa  150  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  36.42 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  35.62 
 
 		 505 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4895  hypothetical protein  36.66 
 
 		 443 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.275823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  33.86 
 
 		 449 aa  137  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  35.96 
 
 		 437 aa  137  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  32.57 
 
 		 473 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  31.27 
 
 		 472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  32.98 
 
 		 473 aa  131  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  28.28 
 
 		 487 aa  127  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  31.88 
 
 		 472 aa  127  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  32.17 
 
 		 472 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  31.88 
 
 		 472 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  27.83 
 
 		 476 aa  125  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  32.65 
 
 		 472 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  27.98 
 
 		 471 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  30.51 
 
 		 471 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  28.5 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  34.49 
 
 		 469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  34.19 
 
 		 469 aa  118  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  28.43 
 
 		 460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  25.89 
 
 		 480 aa  107  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4262  hypothetical protein  30.62 
 
 		 502 aa  103  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  29.19 
 
 		 469 aa  103  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.19 
 
 		 548 aa  100  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1870  hypothetical protein  30.11 
 
 		 440 aa  99.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1545  hypothetical protein  30.11 
 
 		 470 aa  99.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402889 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4902  hypothetical protein  48.67 
 
 		 193 aa  98.6  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.198658 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1834  hypothetical protein  31.32 
 
 		 478 aa  98.2  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159073 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  25.96 
 
 		 483 aa  97.8  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  27.01 
 
 		 499 aa  97.1  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  27.09 
 
 		 471 aa  95.5  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  26.61 
 
 		 471 aa  92.8  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  29.43 
 
 		 467 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  29.59 
 
 		 500 aa  90.5  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2101  hypothetical protein  25.51 
 
 		 684 aa  90.1  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  30.03 
 
 		 471 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  25.9 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  25.44 
 
 		 433 aa  83.2  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  22.54 
 
 		 499 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  24.58 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  25.28 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  24.05 
 
 		 484 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1830  hypothetical protein  27.98 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  26.74 
 
 		 525 aa  78.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  26.04 
 
 		 486 aa  79  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2801  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  23.88 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  25.59 
 
 		 536 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  26.37 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5604  hypothetical protein  27.99 
 
 		 503 aa  76.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770787 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  24.79 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4290  hypothetical protein  26.27 
 
 		 506 aa  75.5  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  25.14 
 
 		 501 aa  75.5  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  28.76 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  23.53 
 
 		 499 aa  73.9  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  26.27 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3231  putative DNA repair enzyme  25.45 
 
 		 552 aa  70.9  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  24.35 
 
 		 534 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  24.09 
 
 		 534 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  24.8 
 
 		 477 aa  68.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  23.14 
 
 		 503 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  23.56 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>