143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1326 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  100 
 
 		 473 aa  962    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  32.51 
 
 		 548 aa  208  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  32.42 
 
 		 477 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  31.87 
 
 		 471 aa  191  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  33.65 
 
 		 467 aa  189  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  33.99 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  33.57 
 
 		 500 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  29.47 
 
 		 500 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  29.62 
 
 		 471 aa  187  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  32.4 
 
 		 472 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  31.19 
 
 		 474 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  29.03 
 
 		 501 aa  182  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  29.36 
 
 		 474 aa  180  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  30.94 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4948  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  30.15 
 
 		 519 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.777522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  31.87 
 
 		 472 aa  177  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.51 
 
 		 499 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  30.08 
 
 		 503 aa  177  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  31.19 
 
 		 483 aa  173  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  29.65 
 
 		 486 aa  173  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  32.72 
 
 		 471 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2801  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  30.51 
 
 		 452 aa  171  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  31.2 
 
 		 489 aa  171  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.97 
 
 		 499 aa  171  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1732  hypothetical protein  29.74 
 
 		 490 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0965901  hitchhiker  0.00613419 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  31.01 
 
 		 507 aa  169  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  31.06 
 
 		 507 aa  167  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5604  hypothetical protein  29.91 
 
 		 503 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770787 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  28.72 
 
 		 522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  30.8 
 
 		 472 aa  164  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1830  hypothetical protein  32 
 
 		 449 aa  162  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  29.66 
 
 		 525 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  30.61 
 
 		 480 aa  158  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2005  hypothetical protein  30.65 
 
 		 478 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  28.19 
 
 		 529 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  31.55 
 
 		 472 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1072  hypothetical protein  28.33 
 
 		 488 aa  150  7e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.289779 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4290  hypothetical protein  28.78 
 
 		 506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  29.07 
 
 		 472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2667  hypothetical protein  29.4 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  29.76 
 
 		 499 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  28.96 
 
 		 545 aa  145  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  28.76 
 
 		 465 aa  144  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  28.42 
 
 		 467 aa  143  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1120  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  29.38 
 
 		 515 aa  143  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3231  putative DNA repair enzyme  26.5 
 
 		 552 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  32.53 
 
 		 471 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1902  hypothetical protein  30.34 
 
 		 478 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  27.86 
 
 		 534 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  27.86 
 
 		 534 aa  136  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  27.78 
 
 		 473 aa  134  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  30.37 
 
 		 471 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  29.42 
 
 		 487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  28.9 
 
 		 476 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.2 
 
 		 467 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  27.95 
 
 		 492 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  25.71 
 
 		 506 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3564  hypothetical protein  29.78 
 
 		 488 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  30.69 
 
 		 473 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  27.27 
 
 		 479 aa  124  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  29.56 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  26.67 
 
 		 471 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  27.05 
 
 		 536 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  27.32 
 
 		 472 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.85 
 
 		 527 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  27.9 
 
 		 472 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  29.17 
 
 		 495 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  27.42 
 
 		 472 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  27.25 
 
 		 487 aa  114  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  27.33 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  30.12 
 
 		 437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  27.03 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  28.1 
 
 		 491 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  26.03 
 
 		 484 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  28.1 
 
 		 491 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28 
 
 		 472 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  27.87 
 
 		 491 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  27.87 
 
 		 488 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  27.87 
 
 		 488 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  28.1 
 
 		 491 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  27.41 
 
 		 489 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  26.6 
 
 		 540 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  26.6 
 
 		 527 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  27.67 
 
 		 459 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  27.86 
 
 		 469 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  27.74 
 
 		 486 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  26.35 
 
 		 528 aa  106  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  27.85 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  28.54 
 
 		 495 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  28.51 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  27.48 
 
 		 498 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  27.18 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  27.83 
 
 		 491 aa  104  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  30.92 
 
 		 460 aa  104  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  27.88 
 
 		 523 aa  100  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  29.24 
 
 		 472 aa  99.8  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  28.4 
 
 		 449 aa  98.2  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  24.08 
 
 		 589 aa  96.7  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2013  hypothetical protein  27.68 
 
 		 562 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  26.57 
 
 		 495 aa  95.5  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>