209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5604 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  70.55 
 
 		 474 aa  689    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  73.89 
 
 		 472 aa  707    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5604  hypothetical protein  100 
 
 		 503 aa  996    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  55.62 
 
 		 507 aa  529  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  55.03 
 
 		 507 aa  529  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  54.64 
 
 		 486 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  52.68 
 
 		 522 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2801  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  54.65 
 
 		 452 aa  495  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  56.51 
 
 		 465 aa  485  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  47.89 
 
 		 474 aa  433  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  45.04 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4948  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  42.88 
 
 		 519 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.777522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  45.01 
 
 		 467 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  45.78 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  45.13 
 
 		 472 aa  364  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  45.47 
 
 		 471 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  42.03 
 
 		 472 aa  347  4e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  39.36 
 
 		 525 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  34.85 
 
 		 500 aa  280  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33.93 
 
 		 499 aa  270  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33.52 
 
 		 548 aa  269  7e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  35.1 
 
 		 529 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.33 
 
 		 499 aa  269  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  36.44 
 
 		 477 aa  268  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  35.62 
 
 		 477 aa  260  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.58 
 
 		 503 aa  259  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  36.05 
 
 		 480 aa  259  6e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  36.36 
 
 		 499 aa  258  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  35.67 
 
 		 471 aa  256  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  33.27 
 
 		 545 aa  253  6e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  33.96 
 
 		 471 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  33.88 
 
 		 483 aa  243  7.999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4290  hypothetical protein  36.45 
 
 		 506 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  32.55 
 
 		 501 aa  238  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2005  hypothetical protein  35.54 
 
 		 478 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  32.06 
 
 		 489 aa  236  9e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  36.38 
 
 		 433 aa  232  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1120  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  35.02 
 
 		 515 aa  227  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1902  hypothetical protein  34.3 
 
 		 478 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1072  hypothetical protein  32.66 
 
 		 488 aa  219  7e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.289779 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  32.64 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  33.21 
 
 		 534 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2667  hypothetical protein  33.83 
 
 		 462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  33.21 
 
 		 534 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  33.52 
 
 		 536 aa  216  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1732  hypothetical protein  34.24 
 
 		 490 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0965901  hitchhiker  0.00613419 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3564  hypothetical protein  34.21 
 
 		 488 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3231  putative DNA repair enzyme  32.55 
 
 		 552 aa  209  8e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1830  hypothetical protein  34.98 
 
 		 449 aa  191  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2013  hypothetical protein  36.71 
 
 		 562 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  29.94 
 
 		 473 aa  161  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  24.76 
 
 		 506 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  26.48 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  27.37 
 
 		 527 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  28.09 
 
 		 540 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  27.82 
 
 		 498 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  31.28 
 
 		 495 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  29.36 
 
 		 495 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.01 
 
 		 527 aa  110  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  27.31 
 
 		 491 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  27.31 
 
 		 488 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  27.31 
 
 		 488 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  24.11 
 
 		 487 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  27.1 
 
 		 491 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  27.1 
 
 		 491 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  27.1 
 
 		 491 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  24.27 
 
 		 479 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  26.42 
 
 		 523 aa  100  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  26.8 
 
 		 483 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  26.8 
 
 		 498 aa  100  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  26.33 
 
 		 528 aa  96.3  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  26.9 
 
 		 491 aa  96.3  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  27.16 
 
 		 471 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  27.75 
 
 		 437 aa  95.1  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  26.6 
 
 		 463 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  24.51 
 
 		 487 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  25.1 
 
 		 472 aa  92.8  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  23.29 
 
 		 476 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  24.06 
 
 		 473 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  28.15 
 
 		 467 aa  89.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  26.07 
 
 		 492 aa  87.4  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  27.67 
 
 		 589 aa  87  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  28.33 
 
 		 593 aa  87  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  25.64 
 
 		 486 aa  86.7  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  23.91 
 
 		 471 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  26.21 
 
 		 489 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  25.83 
 
 		 449 aa  84  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  25.22 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  26.1 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  25.64 
 
 		 476 aa  80.1  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  23.48 
 
 		 473 aa  79.7  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  23.29 
 
 		 471 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  25.64 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  29.27 
 
 		 495 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  23.03 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  24.83 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00039  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  21.95 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000511104  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0994  hypothetical protein  30.14 
 
 		 527 aa  74.3  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  23.09 
 
 		 472 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  26.57 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>