126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4537 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  884    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  63.89 
 
 		 392 aa  499  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  57.68 
 
 		 441 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  61.79 
 
 		 405 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4895  hypothetical protein  57.3 
 
 		 443 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.275823 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  41.57 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  37.04 
 
 		 476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  40.05 
 
 		 459 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  39.63 
 
 		 492 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  36.9 
 
 		 487 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  38.89 
 
 		 459 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  39.81 
 
 		 486 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  37.98 
 
 		 449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  31.75 
 
 		 506 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  38.56 
 
 		 460 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.73 
 
 		 527 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  36.82 
 
 		 491 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  36.58 
 
 		 491 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  36.82 
 
 		 491 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  36.58 
 
 		 488 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  36.58 
 
 		 488 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  36.82 
 
 		 491 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  38.06 
 
 		 495 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  38.39 
 
 		 495 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  36.97 
 
 		 491 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  37.27 
 
 		 498 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  33.65 
 
 		 489 aa  209  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  36.16 
 
 		 528 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  35.92 
 
 		 469 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  37.68 
 
 		 495 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  35.84 
 
 		 469 aa  203  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  37.03 
 
 		 463 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  37.11 
 
 		 483 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  37.03 
 
 		 498 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  38.86 
 
 		 593 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  33.88 
 
 		 523 aa  193  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  31.6 
 
 		 527 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  31.6 
 
 		 540 aa  193  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  36.14 
 
 		 589 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  34.1 
 
 		 479 aa  176  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4262  hypothetical protein  33.06 
 
 		 502 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  33.33 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  32.93 
 
 		 466 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  32.08 
 
 		 473 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  31.55 
 
 		 432 aa  144  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  34.16 
 
 		 472 aa  143  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4902  hypothetical protein  65.79 
 
 		 193 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.198658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  30.54 
 
 		 471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  32 
 
 		 471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  31.18 
 
 		 472 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  31.1 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  30.94 
 
 		 472 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  31.18 
 
 		 487 aa  136  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  33.33 
 
 		 505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  31.29 
 
 		 471 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31.03 
 
 		 472 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  31.04 
 
 		 476 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  33.18 
 
 		 467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  29.89 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  30.28 
 
 		 492 aa  117  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  32.53 
 
 		 547 aa  117  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  30.22 
 
 		 472 aa  117  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  28.29 
 
 		 472 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  28.64 
 
 		 472 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  27.13 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.33 
 
 		 473 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  27.48 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.5 
 
 		 499 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.53 
 
 		 503 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  28.38 
 
 		 500 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  26.2 
 
 		 500 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  26.59 
 
 		 473 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  27.92 
 
 		 467 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  27.18 
 
 		 534 aa  97.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.48 
 
 		 467 aa  97.4  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  26.37 
 
 		 471 aa  93.2  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  26.61 
 
 		 534 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  24.63 
 
 		 484 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  27.65 
 
 		 525 aa  89.7  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  25.59 
 
 		 471 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  27.53 
 
 		 471 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  29.16 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2801  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  25.17 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  27.31 
 
 		 477 aa  83.6  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.78 
 
 		 499 aa  83.2  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  25.64 
 
 		 536 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.07 
 
 		 548 aa  82.4  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  26.24 
 
 		 545 aa  80.1  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  25.68 
 
 		 499 aa  80.1  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  26.74 
 
 		 477 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5604  hypothetical protein  25 
 
 		 503 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770787 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  26.04 
 
 		 486 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  26.44 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  24.58 
 
 		 507 aa  76.6  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  25.8 
 
 		 522 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1830  hypothetical protein  25.16 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  24.26 
 
 		 507 aa  74.7  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1120  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  28.21 
 
 		 515 aa  74.3  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4290  hypothetical protein  27.49 
 
 		 506 aa  72.8  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3231  putative DNA repair enzyme  23.09 
 
 		 552 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>