72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4902 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4902  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  374  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.198658 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4895  hypothetical protein  90.91 
 
 		 443 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.275823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  66.67 
 
 		 405 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  65.79 
 
 		 445 aa  151  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  64.04 
 
 		 392 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  58.77 
 
 		 441 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  50.96 
 
 		 487 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  48.67 
 
 		 593 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  41.56 
 
 		 589 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  47.12 
 
 		 489 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  57.14 
 
 		 431 aa  98.2  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  50.96 
 
 		 528 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  45.89 
 
 		 491 aa  97.1  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  50 
 
 		 483 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  52.88 
 
 		 498 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  52.88 
 
 		 463 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  45.21 
 
 		 491 aa  95.1  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  45.21 
 
 		 488 aa  94.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  45.21 
 
 		 491 aa  95.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  45.21 
 
 		 488 aa  94.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  45.21 
 
 		 491 aa  95.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  45.21 
 
 		 491 aa  94.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  50.52 
 
 		 449 aa  92.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  49.12 
 
 		 498 aa  91.3  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  49.06 
 
 		 469 aa  91.3  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  49.06 
 
 		 469 aa  91.3  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  51.92 
 
 		 495 aa  91.3  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  51.92 
 
 		 495 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  49.04 
 
 		 527 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  45.79 
 
 		 486 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  50 
 
 		 495 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  33.93 
 
 		 506 aa  86.7  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  45.79 
 
 		 492 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  45.79 
 
 		 459 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  43.81 
 
 		 476 aa  85.9  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  44.86 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  47.06 
 
 		 460 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  45.19 
 
 		 523 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  43.27 
 
 		 527 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  43.27 
 
 		 540 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4262  hypothetical protein  43.33 
 
 		 502 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  39.83 
 
 		 472 aa  65.1  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  42.27 
 
 		 467 aa  64.3  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  37.93 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  41.67 
 
 		 536 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3231  putative DNA repair enzyme  40.59 
 
 		 552 aa  61.2  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  34.35 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  36.75 
 
 		 433 aa  59.3  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  42.05 
 
 		 472 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  38.3 
 
 		 534 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  38.3 
 
 		 534 aa  58.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  39.64 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  37.38 
 
 		 471 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  40.91 
 
 		 472 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  32.23 
 
 		 476 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  32.23 
 
 		 487 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  40.91 
 
 		 472 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  37 
 
 		 472 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  32.67 
 
 		 479 aa  56.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  34.4 
 
 		 432 aa  55.5  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  33.88 
 
 		 499 aa  54.3  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  45 
 
 		 437 aa  52  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  36 
 
 		 471 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  39.24 
 
 		 473 aa  48.1  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  36.05 
 
 		 492 aa  47.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  40.18 
 
 		 505 aa  45.1  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.59 
 
 		 473 aa  45.1  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  45 
 
 		 471 aa  44.7  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  34 
 
 		 469 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  42.86 
 
 		 547 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2101  hypothetical protein  28.75 
 
 		 684 aa  41.6  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2013  hypothetical protein  44.26 
 
 		 562 aa  41.2  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>