128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0517 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  798    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  61.79 
 
 		 445 aa  468  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  58.9 
 
 		 392 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4895  hypothetical protein  59.81 
 
 		 443 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.275823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  52.96 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  41.51 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  39.16 
 
 		 449 aa  229  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  36.78 
 
 		 476 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  35.64 
 
 		 487 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  37.1 
 
 		 491 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  37.1 
 
 		 491 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  36.86 
 
 		 491 aa  215  9e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  36.86 
 
 		 488 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  36.86 
 
 		 488 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  37.1 
 
 		 491 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  37.93 
 
 		 495 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  39.27 
 
 		 469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  37.91 
 
 		 460 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  37.04 
 
 		 469 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  37.84 
 
 		 491 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  35.21 
 
 		 489 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  37.44 
 
 		 495 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  30.73 
 
 		 506 aa  206  8e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  37.19 
 
 		 463 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  36.95 
 
 		 498 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  36.95 
 
 		 483 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  35.8 
 
 		 459 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  35.8 
 
 		 492 aa  200  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  37.93 
 
 		 498 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  35.03 
 
 		 527 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  35.06 
 
 		 459 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  34.84 
 
 		 486 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  32.18 
 
 		 540 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  32.18 
 
 		 527 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  32.79 
 
 		 523 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  36.21 
 
 		 495 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  38.34 
 
 		 593 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  37.5 
 
 		 589 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  34.93 
 
 		 528 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  36.45 
 
 		 479 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4262  hypothetical protein  37.92 
 
 		 502 aa  170  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  33.42 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4902  hypothetical protein  66.67 
 
 		 193 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.198658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  33.92 
 
 		 473 aa  146  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  31.76 
 
 		 471 aa  142  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  33.42 
 
 		 472 aa  139  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  33.92 
 
 		 437 aa  133  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  32.35 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  30.62 
 
 		 487 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  32.94 
 
 		 466 aa  130  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  32.17 
 
 		 471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  30.22 
 
 		 476 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  34.74 
 
 		 505 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  31.93 
 
 		 469 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  33.43 
 
 		 547 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  30.35 
 
 		 473 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  33.33 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  29.87 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  29.02 
 
 		 472 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  31.34 
 
 		 492 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  29.84 
 
 		 472 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  29.76 
 
 		 472 aa  96.3  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  29.57 
 
 		 472 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  29.91 
 
 		 472 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.22 
 
 		 499 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  26.57 
 
 		 471 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  26.6 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  25.81 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  28.27 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  25.3 
 
 		 472 aa  81.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  23.7 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  25.48 
 
 		 500 aa  80.1  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.63 
 
 		 503 aa  80.1  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00039  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  22.96 
 
 		 484 aa  79.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000511104  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  26.46 
 
 		 499 aa  79.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  26.19 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.27 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  27.68 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  27.66 
 
 		 536 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  26.28 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  27.45 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4290  hypothetical protein  28.1 
 
 		 506 aa  74.3  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.05 
 
 		 499 aa  73.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  27.53 
 
 		 525 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  27.74 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  26.06 
 
 		 522 aa  70.5  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  27.08 
 
 		 507 aa  70.1  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4948  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  27.18 
 
 		 519 aa  70.1  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.777522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  24.37 
 
 		 545 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.52 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3231  putative DNA repair enzyme  27.52 
 
 		 552 aa  65.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  29.08 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1029  aspartate decarboxylase  32.86 
 
 		 541 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5604  hypothetical protein  22.7 
 
 		 503 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770787 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1830  hypothetical protein  24.24 
 
 		 449 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  27.44 
 
 		 534 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  25.97 
 
 		 507 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1120  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  26.35 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  24.47 
 
 		 472 aa  59.7  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1834  hypothetical protein  30.39 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159073 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>