165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0070 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  100 
 
 
483 aa  957    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  87.06 
 
 
489 aa  836    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  46.83 
 
 
529 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  47.7 
 
 
545 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  46.38 
 
 
480 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1902  hypothetical protein  47 
 
 
478 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2005  hypothetical protein  45.64 
 
 
478 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1120  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  45.87 
 
 
515 aa  362  1e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3564  hypothetical protein  46.5 
 
 
488 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2667  hypothetical protein  46.25 
 
 
462 aa  359  5e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1732  hypothetical protein  45.14 
 
 
490 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0965901  hitchhiker  0.00613419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  43.63 
 
 
471 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  42.23 
 
 
501 aa  353  5e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  43.09 
 
 
477 aa  335  9e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  43.01 
 
 
472 aa  332  8e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  40.34 
 
 
471 aa  330  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  41.34 
 
 
548 aa  318  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1072  hypothetical protein  43.18 
 
 
488 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.289779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  41.95 
 
 
500 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  37.74 
 
 
486 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  41.95 
 
 
467 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  41.63 
 
 
471 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  39.92 
 
 
525 aa  272  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  39.12 
 
 
507 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  38.49 
 
 
472 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  38.16 
 
 
522 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  38.65 
 
 
507 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  38.76 
 
 
472 aa  256  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2801  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  37.1 
 
 
452 aa  256  7e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  35.6 
 
 
474 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4948  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  35.4 
 
 
519 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.777522  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  35.52 
 
 
499 aa  251  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4290  hypothetical protein  39.42 
 
 
506 aa  249  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  36.94 
 
 
474 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  34.1 
 
 
500 aa  247  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  36.46 
 
 
465 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  38.92 
 
 
472 aa  241  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.66 
 
 
503 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  35.85 
 
 
477 aa  238  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33.26 
 
 
499 aa  237  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  34.29 
 
 
472 aa  236  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5604  hypothetical protein  34.54 
 
 
503 aa  230  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000770787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  32.78 
 
 
499 aa  229  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2013  hypothetical protein  34.55 
 
 
562 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1830  hypothetical protein  36.48 
 
 
449 aa  214  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  34.28 
 
 
433 aa  202  9e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  34.05 
 
 
536 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  33.01 
 
 
534 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  32.68 
 
 
534 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3231  putative DNA repair enzyme  32.31 
 
 
552 aa  189  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31.19 
 
 
473 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  29.35 
 
 
527 aa  124  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  29.2 
 
 
469 aa  120  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  28.45 
 
 
487 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  29.24 
 
 
473 aa  113  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  30.45 
 
 
492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  30.11 
 
 
495 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  30.28 
 
 
492 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  29.68 
 
 
491 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  29.68 
 
 
491 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  29.92 
 
 
471 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  29.68 
 
 
491 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  29.45 
 
 
491 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  29.45 
 
 
488 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  29.45 
 
 
488 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  24.12 
 
 
467 aa  106  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  29.66 
 
 
495 aa  106  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  26.15 
 
 
589 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  28.54 
 
 
472 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  30.08 
 
 
459 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  29.25 
 
 
471 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  28.34 
 
 
476 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  30.25 
 
 
437 aa  103  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  29.38 
 
 
473 aa  103  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  30.28 
 
 
486 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  29.88 
 
 
459 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  29.11 
 
 
471 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  28.1 
 
 
472 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  31.36 
 
 
528 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  29.66 
 
 
498 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  29.63 
 
 
449 aa  100  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  28.93 
 
 
472 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  25.53 
 
 
506 aa  100  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.54 
 
 
472 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  29.46 
 
 
431 aa  98.6  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  28.15 
 
 
495 aa  95.5  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  23.32 
 
 
467 aa  94  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  27.7 
 
 
472 aa  93.2  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  28.6 
 
 
483 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  25.31 
 
 
487 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  28.6 
 
 
498 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  29.89 
 
 
432 aa  92.4  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  28.6 
 
 
463 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  27.85 
 
 
491 aa  90.9  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  27.7 
 
 
479 aa  90.5  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  27.02 
 
 
489 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  27.17 
 
 
476 aa  87.4  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  27.76 
 
 
392 aa  87  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  28.82 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  29.16 
 
 
445 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>