142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1941 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  100 
 
 
479 aa  947    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  38.15 
 
 
495 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  38.37 
 
 
495 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  37.25 
 
 
491 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  37.65 
 
 
491 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  37.25 
 
 
491 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  37.65 
 
 
488 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  37.65 
 
 
488 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  37.25 
 
 
491 aa  239  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  37.72 
 
 
498 aa  237  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  38 
 
 
498 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  37.68 
 
 
491 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  39.15 
 
 
483 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  39.02 
 
 
463 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  39.61 
 
 
432 aa  229  7e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  31.97 
 
 
506 aa  226  6e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  39.42 
 
 
505 aa  221  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  37.15 
 
 
495 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  39.75 
 
 
467 aa  217  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  30.97 
 
 
487 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  33.6 
 
 
473 aa  210  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  32.65 
 
 
540 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  32.65 
 
 
527 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  33.47 
 
 
489 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  32.93 
 
 
492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  34.43 
 
 
547 aa  199  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  36.84 
 
 
593 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33.01 
 
 
527 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  35.73 
 
 
589 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  33.48 
 
 
459 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  32.16 
 
 
528 aa  192  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  32.79 
 
 
486 aa  190  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  33.26 
 
 
459 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  32.13 
 
 
523 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  33.81 
 
 
487 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  36.65 
 
 
469 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  36.43 
 
 
469 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  36.44 
 
 
466 aa  179  9e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  34.1 
 
 
445 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  36.45 
 
 
405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  35.6 
 
 
492 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  35.71 
 
 
473 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  35.52 
 
 
437 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  31.71 
 
 
471 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  34.71 
 
 
441 aa  171  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  32.19 
 
 
476 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  34.77 
 
 
472 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  33.33 
 
 
471 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  34.55 
 
 
472 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  34.01 
 
 
472 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33.94 
 
 
472 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  33.75 
 
 
392 aa  160  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  31.67 
 
 
476 aa  159  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  32.34 
 
 
472 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  33.33 
 
 
471 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  32.21 
 
 
469 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  28.6 
 
 
467 aa  151  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  32.42 
 
 
431 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  31.75 
 
 
460 aa  145  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  25.65 
 
 
484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.78 
 
 
503 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.08 
 
 
499 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4895  hypothetical protein  34.65 
 
 
443 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.275823 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.37 
 
 
467 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  28.72 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.47 
 
 
499 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  30.21 
 
 
477 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  30.29 
 
 
548 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  29.13 
 
 
449 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  24.4 
 
 
500 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.27 
 
 
473 aa  120  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  29.32 
 
 
472 aa  118  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  27.07 
 
 
472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1545  hypothetical protein  29.6 
 
 
470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  30.19 
 
 
500 aa  113  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  30.19 
 
 
467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  28.17 
 
 
507 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1830  hypothetical protein  30.82 
 
 
449 aa  111  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  26.88 
 
 
471 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  28.07 
 
 
507 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1870  hypothetical protein  29.55 
 
 
440 aa  107  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1029  aspartate decarboxylase  25.68 
 
 
541 aa  104  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  28.97 
 
 
471 aa  103  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  25 
 
 
474 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4262  hypothetical protein  31.19 
 
 
502 aa  103  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  25.84 
 
 
529 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  28.27 
 
 
472 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  24.95 
 
 
472 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  29.15 
 
 
545 aa  100  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4948  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  27.18 
 
 
519 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.777522  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  27.66 
 
 
536 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  24.63 
 
 
474 aa  100  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1120  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  27.33 
 
 
515 aa  99.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1834  hypothetical protein  28.96 
 
 
478 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159073 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  26.15 
 
 
522 aa  99  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  28.1 
 
 
534 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  26.87 
 
 
477 aa  97.8  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2005  hypothetical protein  26.32 
 
 
478 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  28.51 
 
 
472 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  27.55 
 
 
534 aa  97.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0727599 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>