130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1743 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  838    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  45.12 
 
 		 437 aa  271  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  40 
 
 		 479 aa  229  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  40.69 
 
 		 467 aa  208  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  39.21 
 
 		 469 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  38.21 
 
 		 473 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  39.4 
 
 		 491 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  39.4 
 
 		 491 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  39.15 
 
 		 491 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  39.15 
 
 		 488 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  39.4 
 
 		 491 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  39.15 
 
 		 488 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  36.09 
 
 		 472 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  34.79 
 
 		 487 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  35.5 
 
 		 471 aa  193  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  35.09 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  35.75 
 
 		 471 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  37.41 
 
 		 471 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  35.75 
 
 		 472 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  35.59 
 
 		 472 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  35.34 
 
 		 472 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  35.42 
 
 		 472 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  38.15 
 
 		 495 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  38.25 
 
 		 491 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  33.96 
 
 		 476 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  33.82 
 
 		 473 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  37.66 
 
 		 495 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  33.02 
 
 		 489 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  38.73 
 
 		 463 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  38.48 
 
 		 483 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  38.48 
 
 		 498 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  32.49 
 
 		 392 aa  167  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  36.74 
 
 		 498 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  34.01 
 
 		 441 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  34.47 
 
 		 547 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  37.04 
 
 		 593 aa  160  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  35.08 
 
 		 589 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  33.42 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  37.22 
 
 		 492 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  27.78 
 
 		 506 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  37.91 
 
 		 466 aa  153  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  34.46 
 
 		 505 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  32.74 
 
 		 492 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  37.44 
 
 		 495 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  33.25 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  32.48 
 
 		 459 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  32.03 
 
 		 540 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  32.74 
 
 		 459 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  32.03 
 
 		 527 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33.72 
 
 		 527 aa  150  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  31.26 
 
 		 528 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  33.33 
 
 		 523 aa  146  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  31.55 
 
 		 445 aa  144  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  28.95 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  28.28 
 
 		 476 aa  133  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  27.72 
 
 		 467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  31.47 
 
 		 431 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  32.35 
 
 		 469 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  33.26 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4895  hypothetical protein  31.56 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.275823 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  31.35 
 
 		 472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  31.38 
 
 		 472 aa  121  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.12 
 
 		 503 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.98 
 
 		 467 aa  119  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  30.07 
 
 		 548 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  29.05 
 
 		 471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1834  hypothetical protein  35.57 
 
 		 478 aa  116  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159073 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  30.95 
 
 		 472 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.4 
 
 		 499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  25.65 
 
 		 500 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  29.56 
 
 		 473 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.3 
 
 		 499 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4948  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  27.04 
 
 		 519 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.777522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  27.04 
 
 		 507 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  27.85 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2801  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  28.89 
 
 		 452 aa  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  28.19 
 
 		 472 aa  103  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  30.22 
 
 		 467 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  29.63 
 
 		 477 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  29.74 
 
 		 500 aa  100  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  27.44 
 
 		 499 aa  100  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  29.88 
 
 		 471 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  27.45 
 
 		 501 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  28.17 
 
 		 465 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  26.9 
 
 		 525 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  27.7 
 
 		 507 aa  97.8  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  26.86 
 
 		 484 aa  97.4  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  27.36 
 
 		 474 aa  97.1  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  26.85 
 
 		 474 aa  97.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1072  hypothetical protein  29.57 
 
 		 488 aa  95.1  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.289779 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  28.27 
 
 		 477 aa  92.8  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  30.35 
 
 		 483 aa  92.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  28.38 
 
 		 460 aa  92.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2667  hypothetical protein  27.05 
 
 		 462 aa  92  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  26.77 
 
 		 536 aa  90.5  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  26.53 
 
 		 472 aa  90.5  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  26.97 
 
 		 529 aa  90.5  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  26.75 
 
 		 534 aa  90.1  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  26.96 
 
 		 534 aa  90.1  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1902  hypothetical protein  27.17 
 
 		 478 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>