137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2745 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  83.5 
 
 		 491 aa  761    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  91.16 
 
 		 498 aa  808    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  83.64 
 
 		 491 aa  737    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  91.51 
 
 		 483 aa  763    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  98.99 
 
 		 495 aa  944    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  91.97 
 
 		 498 aa  793    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  83.1 
 
 		 491 aa  760    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  83 
 
 		 488 aa  756    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  83.5 
 
 		 491 aa  761    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  83.3 
 
 		 491 aa  758    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  83 
 
 		 488 aa  756    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  91.72 
 
 		 495 aa  788    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  92.22 
 
 		 463 aa  750    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  100 
 
 		 495 aa  952    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  56 
 
 		 489 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  54.02 
 
 		 487 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  54.71 
 
 		 492 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  54.07 
 
 		 486 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  55.27 
 
 		 459 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  54.41 
 
 		 459 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  45.56 
 
 		 540 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  45.56 
 
 		 527 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  46.2 
 
 		 523 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  46.34 
 
 		 528 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  44.49 
 
 		 527 aa  347  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  38.96 
 
 		 589 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  35.7 
 
 		 506 aa  302  7.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  45.31 
 
 		 593 aa  272  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  38.65 
 
 		 479 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  39.59 
 
 		 441 aa  243  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  38.65 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  38.64 
 
 		 445 aa  231  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  37 
 
 		 547 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  37.84 
 
 		 466 aa  223  8e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  40.52 
 
 		 467 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  37.44 
 
 		 405 aa  217  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  39.13 
 
 		 431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  34.93 
 
 		 476 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4895  hypothetical protein  38.86 
 
 		 443 aa  196  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.275823 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  38.24 
 
 		 505 aa  193  8e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  37.41 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  36.4 
 
 		 472 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  33.67 
 
 		 473 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  39.49 
 
 		 437 aa  184  5.0000000000000004e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  36.43 
 
 		 473 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  35.27 
 
 		 469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  35.49 
 
 		 469 aa  180  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  33.67 
 
 		 487 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  34.11 
 
 		 449 aa  173  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  34.34 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  35.57 
 
 		 492 aa  167  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  33.85 
 
 		 471 aa  166  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  33.11 
 
 		 460 aa  164  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  31.98 
 
 		 471 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  33.33 
 
 		 471 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  32.19 
 
 		 476 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.41 
 
 		 472 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  32.76 
 
 		 507 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  33.02 
 
 		 500 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  32.22 
 
 		 472 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  33.76 
 
 		 467 aa  144  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  33.26 
 
 		 472 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  33.26 
 
 		 472 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  33.03 
 
 		 472 aa  143  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  31.42 
 
 		 507 aa  139  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  31.66 
 
 		 472 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  27.13 
 
 		 467 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  29.77 
 
 		 486 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.53 
 
 		 499 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  30.49 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  24.21 
 
 		 484 aa  131  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.62 
 
 		 499 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  33.76 
 
 		 471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  29.08 
 
 		 474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  30.65 
 
 		 472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1545  hypothetical protein  31.25 
 
 		 470 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402889 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1870  hypothetical protein  31.92 
 
 		 440 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  29.89 
 
 		 465 aa  124  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  25 
 
 		 500 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4262  hypothetical protein  31.07 
 
 		 502 aa  122  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  29.87 
 
 		 545 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.73 
 
 		 503 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  29.51 
 
 		 522 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.16 
 
 		 467 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.96 
 
 		 473 aa  119  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  30.66 
 
 		 525 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  29.54 
 
 		 471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  28.33 
 
 		 474 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  28.49 
 
 		 529 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2801  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  28.95 
 
 		 452 aa  117  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5604  hypothetical protein  29.95 
 
 		 503 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770787 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  28.75 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  30.09 
 
 		 483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.79 
 
 		 548 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  28.21 
 
 		 499 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  27.78 
 
 		 472 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  29.8 
 
 		 489 aa  110  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4290  hypothetical protein  29.51 
 
 		 506 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  28.18 
 
 		 472 aa  108  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  27.97 
 
 		 477 aa  107  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>