138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6157 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  80.92 
 
 
491 aa  741    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  100 
 
 
498 aa  959    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  80.32 
 
 
491 aa  709    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  90.89 
 
 
483 aa  757    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  91.77 
 
 
495 aa  826    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  91.37 
 
 
498 aa  786    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  80.52 
 
 
491 aa  739    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  80.4 
 
 
488 aa  735    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  80.92 
 
 
491 aa  741    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  80.72 
 
 
491 aa  739    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  80.4 
 
 
488 aa  735    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  89.56 
 
 
495 aa  765    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  91.79 
 
 
463 aa  746    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  91.16 
 
 
495 aa  802    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  55.07 
 
 
489 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  52.3 
 
 
487 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  53.39 
 
 
492 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  55.25 
 
 
459 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  54.51 
 
 
459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  53.43 
 
 
486 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  44.17 
 
 
540 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  44.17 
 
 
527 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  45.73 
 
 
523 aa  368  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  45.85 
 
 
528 aa  348  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  44.27 
 
 
527 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  35.02 
 
 
506 aa  280  4e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  43.86 
 
 
593 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  42.54 
 
 
589 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  38.4 
 
 
479 aa  247  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  39.13 
 
 
441 aa  232  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  38.15 
 
 
392 aa  232  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  36.68 
 
 
547 aa  232  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  37.95 
 
 
445 aa  226  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  37.81 
 
 
466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  41.12 
 
 
467 aa  217  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  37.93 
 
 
405 aa  213  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  37.84 
 
 
431 aa  207  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  33.48 
 
 
476 aa  194  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4895  hypothetical protein  39.5 
 
 
443 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.275823 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  36.93 
 
 
432 aa  184  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  35.19 
 
 
469 aa  183  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  35.81 
 
 
472 aa  182  9.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  35.41 
 
 
469 aa  182  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  37.42 
 
 
505 aa  182  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  36.45 
 
 
449 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  35.89 
 
 
473 aa  176  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  38.3 
 
 
437 aa  171  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  33.81 
 
 
469 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  32.24 
 
 
487 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  32.8 
 
 
473 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  34.14 
 
 
460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  34.68 
 
 
492 aa  160  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  32.79 
 
 
471 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  31.77 
 
 
471 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  31.22 
 
 
476 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  34.65 
 
 
471 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  32.95 
 
 
507 aa  146  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31.71 
 
 
472 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  32.5 
 
 
500 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  32.43 
 
 
507 aa  140  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.44 
 
 
499 aa  140  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  33.62 
 
 
467 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  32.64 
 
 
472 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  31.25 
 
 
472 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  31.25 
 
 
472 aa  133  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  31.25 
 
 
472 aa  133  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  25.64 
 
 
484 aa  131  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  33.54 
 
 
471 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  31.03 
 
 
472 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  29.41 
 
 
474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  28.93 
 
 
486 aa  128  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1545  hypothetical protein  31.01 
 
 
470 aa  127  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402889 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1870  hypothetical protein  31.92 
 
 
440 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  31.81 
 
 
472 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  25.37 
 
 
500 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  26.76 
 
 
467 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4262  hypothetical protein  31.76 
 
 
502 aa  124  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  30.53 
 
 
433 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.36 
 
 
499 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2801  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  29.23 
 
 
452 aa  121  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  30.8 
 
 
465 aa  120  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  28.69 
 
 
474 aa  120  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  31.21 
 
 
525 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  28.65 
 
 
499 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  29.75 
 
 
471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.9 
 
 
467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  28 
 
 
471 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  30.02 
 
 
522 aa  114  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  29.38 
 
 
477 aa  113  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.1 
 
 
548 aa  113  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  30.49 
 
 
483 aa  111  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.89 
 
 
473 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1834  hypothetical protein  31.65 
 
 
478 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159073 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5604  hypothetical protein  28.38 
 
 
503 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000770787 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  28.6 
 
 
472 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4290  hypothetical protein  28.81 
 
 
506 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  27.65 
 
 
477 aa  107  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  28.29 
 
 
534 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4948  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  28.37 
 
 
519 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.777522  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  28.09 
 
 
534 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>