136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0203 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  988    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  60.94 
 
 		 489 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  53.96 
 
 		 492 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  55.44 
 
 		 486 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  56.3 
 
 		 459 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  55.87 
 
 		 459 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  53.35 
 
 		 491 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  52.94 
 
 		 491 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  53.35 
 
 		 491 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  53.35 
 
 		 491 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  53.96 
 
 		 491 aa  481  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  53.01 
 
 		 495 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  53.06 
 
 		 488 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  53.06 
 
 		 488 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  52.82 
 
 		 495 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  52.91 
 
 		 498 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  53.86 
 
 		 483 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  50.9 
 
 		 498 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  53.02 
 
 		 463 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  52.22 
 
 		 495 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  40.98 
 
 		 527 aa  372  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  40.98 
 
 		 540 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  40.46 
 
 		 523 aa  348  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.04 
 
 		 527 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  40.83 
 
 		 528 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  33 
 
 		 506 aa  281  3e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  37.47 
 
 		 589 aa  243  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  37.08 
 
 		 593 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  37.53 
 
 		 441 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  36.9 
 
 		 445 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  37.97 
 
 		 392 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  33.88 
 
 		 547 aa  233  7.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4895  hypothetical protein  38.76 
 
 		 443 aa  221  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.275823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  35.64 
 
 		 405 aa  217  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  34.32 
 
 		 466 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  30.97 
 
 		 479 aa  211  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  31.9 
 
 		 476 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  34.79 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  34.13 
 
 		 431 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  32.76 
 
 		 505 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  34.7 
 
 		 467 aa  183  7e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  34.17 
 
 		 472 aa  179  8e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  36.3 
 
 		 437 aa  178  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  33.49 
 
 		 449 aa  176  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  31.85 
 
 		 471 aa  163  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  31.04 
 
 		 469 aa  163  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  30.11 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  30.82 
 
 		 469 aa  162  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  31.64 
 
 		 471 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  29.94 
 
 		 487 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  27.79 
 
 		 473 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  29.52 
 
 		 460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  29.45 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  29.18 
 
 		 471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  30.83 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  29.07 
 
 		 473 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  29.01 
 
 		 476 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  30.15 
 
 		 472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  29.9 
 
 		 472 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  29.9 
 
 		 472 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  28.96 
 
 		 467 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  28.96 
 
 		 500 aa  124  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.55 
 
 		 503 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4262  hypothetical protein  30.23 
 
 		 502 aa  120  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  28.81 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  27.84 
 
 		 472 aa  116  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  28.87 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.07 
 
 		 548 aa  115  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  23.98 
 
 		 500 aa  113  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  21.98 
 
 		 484 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  22.36 
 
 		 499 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  27.1 
 
 		 507 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  25.27 
 
 		 472 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.25 
 
 		 473 aa  107  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  22.24 
 
 		 467 aa  107  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  26.78 
 
 		 472 aa  106  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  23.83 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  27.96 
 
 		 507 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  24.69 
 
 		 486 aa  101  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  22.34 
 
 		 499 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  25.36 
 
 		 477 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4290  hypothetical protein  27.53 
 
 		 506 aa  99.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  25.68 
 
 		 499 aa  99.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4902  hypothetical protein  50.96 
 
 		 193 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.198658 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  25.32 
 
 		 474 aa  97.4  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  25.05 
 
 		 489 aa  95.9  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  26.34 
 
 		 536 aa  95.1  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  25.31 
 
 		 483 aa  91.7  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  24.16 
 
 		 477 aa  91.7  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1545  hypothetical protein  26.89 
 
 		 470 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402889 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  26.28 
 
 		 465 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3231  putative DNA repair enzyme  24.47 
 
 		 552 aa  89.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1870  hypothetical protein  27.83 
 
 		 440 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  25.16 
 
 		 472 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1072  hypothetical protein  25.65 
 
 		 488 aa  89  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.289779 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  23.97 
 
 		 545 aa  86.7  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  26.11 
 
 		 525 aa  86.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1830  hypothetical protein  24.77 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5604  hypothetical protein  23.95 
 
 		 503 aa  84.7  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770787 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4948  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  23.99 
 
 		 519 aa  84.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.777522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>