115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4262 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4262  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  961    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  45.93 
 
 		 469 aa  323  4e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  45.54 
 
 		 469 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  49.46 
 
 		 460 aa  319  9e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  42.8 
 
 		 449 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  40.73 
 
 		 431 aa  229  7e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  37.99 
 
 		 476 aa  219  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  36.16 
 
 		 392 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  38.36 
 
 		 405 aa  212  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  36.34 
 
 		 441 aa  203  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  33.47 
 
 		 445 aa  196  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  30.5 
 
 		 506 aa  178  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  34.39 
 
 		 523 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  32.98 
 
 		 527 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4895  hypothetical protein  36.04 
 
 		 443 aa  166  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.275823 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  31.09 
 
 		 459 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  30.8 
 
 		 487 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  30.46 
 
 		 492 aa  160  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  30.72 
 
 		 540 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  30.72 
 
 		 527 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  30.54 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  27.66 
 
 		 589 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  32.1 
 
 		 495 aa  156  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  32.54 
 
 		 491 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  32.54 
 
 		 491 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  32.54 
 
 		 488 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  32.54 
 
 		 491 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  32.54 
 
 		 488 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  31.32 
 
 		 489 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  32.18 
 
 		 498 aa  151  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  34.32 
 
 		 491 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  32.43 
 
 		 495 aa  150  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  32.61 
 
 		 486 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  34.15 
 
 		 528 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  32.26 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  32.26 
 
 		 498 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  32.04 
 
 		 463 aa  143  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  33.11 
 
 		 479 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  32.7 
 
 		 491 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  32.16 
 
 		 495 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  31.36 
 
 		 593 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  32.44 
 
 		 466 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  35.57 
 
 		 547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  31.24 
 
 		 432 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  30.26 
 
 		 437 aa  103  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  30.49 
 
 		 487 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  30.23 
 
 		 471 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  32.4 
 
 		 505 aa  98.2  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  29.96 
 
 		 473 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  28.19 
 
 		 473 aa  96.7  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  31.55 
 
 		 471 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  30.12 
 
 		 471 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  29.39 
 
 		 476 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  31 
 
 		 469 aa  88.6  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  29.09 
 
 		 472 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  27.89 
 
 		 525 aa  86.7  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.73 
 
 		 472 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  29.2 
 
 		 472 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  29.38 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  26.11 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  30.6 
 
 		 472 aa  81.3  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  25.94 
 
 		 492 aa  80.1  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  28.09 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  28.09 
 
 		 472 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5604  hypothetical protein  27.15 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770787 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4902  hypothetical protein  43.93 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.198658 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  28.05 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  28.49 
 
 		 534 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  26.73 
 
 		 474 aa  71.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1029  aspartate decarboxylase  22.52 
 
 		 541 aa  70.9  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  25.76 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  26.95 
 
 		 507 aa  70.1  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  24.85 
 
 		 474 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  27.92 
 
 		 534 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  29.51 
 
 		 536 aa  67  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  29.53 
 
 		 472 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  23.88 
 
 		 472 aa  66.6  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  25.48 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  23.59 
 
 		 473 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  25.65 
 
 		 522 aa  65.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.94 
 
 		 548 aa  65.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2013  hypothetical protein  27.85 
 
 		 562 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  22.34 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  26.42 
 
 		 507 aa  63.5  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  26.23 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  27.89 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  28.45 
 
 		 500 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  25.84 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  24.79 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4290  hypothetical protein  28.48 
 
 		 506 aa  60.1  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  28.15 
 
 		 467 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  29.82 
 
 		 471 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  25.54 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  23.39 
 
 		 503 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2801  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  24.95 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  25.77 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4948  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  27.04 
 
 		 519 aa  57  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.777522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  22.57 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1864  hypothetical protein  30.97 
 
 		 763 aa  55.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1120  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  27.74 
 
 		 515 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.881049 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>