194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2337 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2249  hypothetical protein  89.67 
 
 		 569 aa  772    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0732725  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1611  hypothetical protein  86.49 
 
 		 551 aa  694    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2337  hypothetical protein  100 
 
 		 539 aa  982    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30742  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2201  hypothetical protein  61.19 
 
 		 555 aa  528  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  30.17 
 
 		 471 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  31.2 
 
 		 507 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  29.25 
 
 		 471 aa  123  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  30.33 
 
 		 473 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  28.33 
 
 		 471 aa  120  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  33.03 
 
 		 500 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  30.84 
 
 		 507 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  32.73 
 
 		 472 aa  117  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.97 
 
 		 499 aa  117  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  29.68 
 
 		 499 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2801  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  28.03 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  29.72 
 
 		 548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  29.21 
 
 		 472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  28.65 
 
 		 486 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  33.67 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  29.56 
 
 		 471 aa  110  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.28 
 
 		 499 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  28.93 
 
 		 471 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  31.47 
 
 		 479 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.11 
 
 		 503 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  28.68 
 
 		 487 aa  107  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  31.25 
 
 		 472 aa  106  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  27.97 
 
 		 474 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  30.08 
 
 		 525 aa  104  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  32.34 
 
 		 471 aa  104  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  29.03 
 
 		 529 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  30.76 
 
 		 491 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  30.76 
 
 		 491 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  30.39 
 
 		 491 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  30.76 
 
 		 491 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  30.39 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  30.39 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  30.71 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  26.11 
 
 		 500 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  29.78 
 
 		 483 aa  100  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  29.48 
 
 		 545 aa  99.4  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  30.76 
 
 		 495 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  30 
 
 		 472 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  29.21 
 
 		 469 aa  99  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  30.12 
 
 		 465 aa  98.6  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2005  hypothetical protein  31.89 
 
 		 478 aa  98.2  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  29.81 
 
 		 472 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  32.28 
 
 		 472 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1902  hypothetical protein  31.11 
 
 		 478 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  26.07 
 
 		 473 aa  96.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3205  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  27.74 
 
 		 527 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.663167  normal  0.015197 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  29.86 
 
 		 472 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4054  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  29.35 
 
 		 526 aa  94  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.84 
 
 		 472 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  28.87 
 
 		 522 aa  92.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  28.68 
 
 		 489 aa  92  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  27.63 
 
 		 476 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  28.32 
 
 		 476 aa  90.1  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2013  hypothetical protein  30.58 
 
 		 562 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  30.18 
 
 		 480 aa  89  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  25.93 
 
 		 589 aa  89  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4948  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  28.35 
 
 		 519 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.777522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  30.2 
 
 		 495 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  28.68 
 
 		 498 aa  87.8  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  32.2 
 
 		 491 aa  88.2  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3564  hypothetical protein  30.23 
 
 		 488 aa  87  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  29.19 
 
 		 467 aa  86.3  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1732  hypothetical protein  28.34 
 
 		 490 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0965901  hitchhiker  0.00613419 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.54 
 
 		 527 aa  86.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0923  hypothetical protein  30.39 
 
 		 527 aa  86.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0994  hypothetical protein  28.65 
 
 		 527 aa  85.9  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  29.08 
 
 		 536 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  30.02 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  32.8 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  27.78 
 
 		 433 aa  83.2  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  28.83 
 
 		 474 aa  82.4  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3231  putative DNA repair enzyme  29.22 
 
 		 552 aa  82.4  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  29.36 
 
 		 534 aa  80.5  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  28.49 
 
 		 492 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  30.28 
 
 		 441 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  28.38 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  23.69 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  28.47 
 
 		 534 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  24.23 
 
 		 506 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  27.54 
 
 		 472 aa  77.8  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5604  hypothetical protein  26.53 
 
 		 503 aa  77  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  28.99 
 
 		 483 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  28.99 
 
 		 498 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  25.93 
 
 		 593 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  23.17 
 
 		 484 aa  75.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00039  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  21.16 
 
 		 484 aa  75.5  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000511104  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13428  hypothetical protein  31.95 
 
 		 527 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  28.54 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  26.41 
 
 		 487 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3156  UMUC domain protein DNA-repair protein  28.93 
 
 		 510 aa  73.6  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000974062  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  28.84 
 
 		 449 aa  73.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  29.07 
 
 		 486 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3467  DNA-repair protein  32.45 
 
 		 528 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  normal  0.0126488 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.65 
 
 		 473 aa  72.8  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  23.47 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  28.32 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>