154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3205 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3205  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  100 
 
 		 527 aa  1021    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.663167  normal  0.015197 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  27.64 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.52 
 
 		 499 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  23.9 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  23.09 
 
 		 506 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  23.9 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4046  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  25.46 
 
 		 495 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  27.29 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  23.26 
 
 		 467 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  26.85 
 
 		 492 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  26.41 
 
 		 472 aa  72.8  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  23.66 
 
 		 487 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  26.34 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  23.5 
 
 		 589 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  24.95 
 
 		 529 aa  69.3  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  26.64 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  21.24 
 
 		 499 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3467  DNA-repair protein  28.35 
 
 		 528 aa  67.8  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  normal  0.0126488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5241  hypothetical protein  30.07 
 
 		 535 aa  67.8  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0112063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  25.56 
 
 		 479 aa  67  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  25.75 
 
 		 449 aa  66.6  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  25.58 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5725  hypothetical protein  26.77 
 
 		 468 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1029  aspartate decarboxylase  21.81 
 
 		 541 aa  65.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  30.61 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  25.94 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  23.5 
 
 		 593 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  23.02 
 
 		 500 aa  63.5  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  25.14 
 
 		 500 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  23.98 
 
 		 409 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  22.16 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4948  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  24.91 
 
 		 519 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.777522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2667  hypothetical protein  25.9 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  28.15 
 
 		 395 aa  62  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1732  hypothetical protein  24.36 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0965901  hitchhiker  0.00613419 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.3 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  23.38 
 
 		 548 aa  61.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2201  hypothetical protein  30.42 
 
 		 555 aa  61.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  24.05 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  22.07 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  23.73 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  31.16 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2337  hypothetical protein  28.21 
 
 		 539 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30742  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  26.43 
 
 		 486 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  24.92 
 
 		 436 aa  60.1  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  25.39 
 
 		 471 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  25.36 
 
 		 384 aa  60.1  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  29.55 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1830  hypothetical protein  24.35 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  30.29 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.72 
 
 		 527 aa  58.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  23.54 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  23.51 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  24.95 
 
 		 545 aa  57.8  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  25 
 
 		 400 aa  57  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  23.99 
 
 		 477 aa  56.2  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  25.61 
 
 		 469 aa  55.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3240  hypothetical protein  30.3 
 
 		 524 aa  56.2  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488053  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  25.25 
 
 		 467 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  24.15 
 
 		 491 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  24.15 
 
 		 488 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  24.15 
 
 		 488 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  25.75 
 
 		 491 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1902  hypothetical protein  25 
 
 		 478 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  25.75 
 
 		 491 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2005  hypothetical protein  28.18 
 
 		 478 aa  53.5  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  22.27 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  25.99 
 
 		 491 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  23.17 
 
 		 410 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  24.17 
 
 		 399 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  25.75 
 
 		 491 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  24.27 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  24.89 
 
 		 430 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  28.68 
 
 		 424 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  27.2 
 
 		 460 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  26.28 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  26.98 
 
 		 423 aa  52  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  21.7 
 
 		 407 aa  51.2  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2507  DNA-directed DNA polymerase  21.61 
 
 		 358 aa  51.2  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247622  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  27.97 
 
 		 417 aa  51.6  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  24.58 
 
 		 489 aa  51.6  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  28.46 
 
 		 402 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  21.96 
 
 		 385 aa  50.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3564  hypothetical protein  24.9 
 
 		 488 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  26.03 
 
 		 414 aa  50.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  23.49 
 
 		 390 aa  50.4  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0500  UMUC domain protein DNA-repair protein  23.77 
 
 		 417 aa  50.4  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2945  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  27.67 
 
 		 505 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.000000598538  decreased coverage  0.00000434939 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1611  hypothetical protein  27.32 
 
 		 551 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  23.88 
 
 		 477 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  25.3 
 
 		 495 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  24.31 
 
 		 472 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  21.73 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  24.66 
 
 		 480 aa  50.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  25.1 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  24.48 
 
 		 433 aa  49.3  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  27.9 
 
 		 505 aa  49.3  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  31.86 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  25 
 
 		 431 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0994  hypothetical protein  25.17 
 
 		 527 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>