More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5241 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5241  hypothetical protein  100 
 
 		 535 aa  1022    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0112063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3467  DNA-repair protein  44.53 
 
 		 528 aa  331  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  normal  0.0126488 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3240  hypothetical protein  44.55 
 
 		 524 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488053  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2945  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  40.71 
 
 		 505 aa  319  9e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.000000598538  decreased coverage  0.00000434939 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0994  hypothetical protein  40.7 
 
 		 527 aa  312  7.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0923  hypothetical protein  41.06 
 
 		 527 aa  304  3.0000000000000004e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1175  hypothetical protein  40.51 
 
 		 532 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24995  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1202  hypothetical protein  40.51 
 
 		 529 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.344019  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1192  hypothetical protein  40.51 
 
 		 529 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13428  hypothetical protein  39.42 
 
 		 527 aa  282  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1747  hypothetical protein  38.56 
 
 		 536 aa  278  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1523  hypothetical protein  40.69 
 
 		 522 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3156  UMUC domain protein DNA-repair protein  40.92 
 
 		 510 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000974062  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2288  DNA-repair protein  40.07 
 
 		 562 aa  270  5e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4898  hypothetical protein  41.36 
 
 		 531 aa  266  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.834206  normal  0.0834013 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1896  putative DNA-directed DNA polymerase  37.43 
 
 		 520 aa  261  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.582074  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2039  hypothetical protein  37.97 
 
 		 581 aa  250  5e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.566112  normal  0.522751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21280  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  39.88 
 
 		 553 aa  248  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00165363  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1440  hypothetical protein  40.82 
 
 		 549 aa  233  9e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15750  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.8 
 
 		 589 aa  220  6e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0334276  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1186  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31.64 
 
 		 549 aa  192  9e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000707508  normal  0.0119021 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  33.02 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  27.6 
 
 		 409 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  30.35 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  31.35 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  26.61 
 
 		 409 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  28.44 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  30.23 
 
 		 529 aa  77.8  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2507  DNA-directed DNA polymerase  25.1 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  29.07 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  32.03 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  29.07 
 
 		 408 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  29.07 
 
 		 361 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3205  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  30.07 
 
 		 527 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.663167  normal  0.015197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  25.2 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  31.62 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  32.51 
 
 		 474 aa  73.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  28.35 
 
 		 479 aa  73.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  28.68 
 
 		 379 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4919  DNA-directed DNA polymerase  26.05 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  30.95 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  29.17 
 
 		 507 aa  70.5  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.57 
 
 		 548 aa  70.1  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  30.18 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  30.5 
 
 		 386 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  32.4 
 
 		 472 aa  69.7  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1203  DNA polymerase IV  28.95 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  28.63 
 
 		 352 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  27.67 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1232  DNA polymerase IV  28.95 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46587  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  28.29 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  28.52 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  26.18 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6871  DNA-directed DNA polymerase  22.89 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4251  hypothetical protein  39.79 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240238  normal  0.380401 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1128  DNA polymerase IV  29.52 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456598  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4215  DNA polymerase IV  28.95 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  30.13 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2619  DNA polymerase IV  30.57 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1727  DNA polymerase IV  30.57 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2751  DNA polymerase IV  30.57 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1508  DNA polymerase IV  30.57 
 
 		 400 aa  67  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2675  DNA polymerase IV  30.57 
 
 		 406 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2236  DNA polymerase IV  30.57 
 
 		 400 aa  67  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.783166  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3083  DNA polymerase IV  30.57 
 
 		 400 aa  67  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2052  DNA polymerase IV  29.07 
 
 		 407 aa  67  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2332  DNA-directed DNA polymerase  30.29 
 
 		 353 aa  67  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353166  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  35.89 
 
 		 431 aa  67  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3990  DNA polymerase IV  28.37 
 
 		 353 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1397  DNA polymerase IV  28.84 
 
 		 354 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1195  DNA polymerase IV  28.07 
 
 		 353 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  25.8 
 
 		 400 aa  66.6  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  21.33 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  28.12 
 
 		 507 aa  65.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3784  DNA-directed DNA polymerase  26.89 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.466948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  25.13 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  29.3 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  26.67 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.52 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  28.04 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  26.56 
 
 		 471 aa  63.9  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37100  DNA polymerase IV  31 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52310  DNA polymerase IV  30.57 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.88026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  34 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4587  DNA polymerase IV  30.57 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.099232  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  31.33 
 
 		 422 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  25.59 
 
 		 499 aa  62.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10700  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.22 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00310871  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  32.8 
 
 		 489 aa  62.4  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1120  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  27.36 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4012  DNA polymerase IV  28.07 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333158  normal  0.93726 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  21.48 
 
 		 354 aa  62.8  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0928  DNA-directed DNA polymerase  27.14 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  26.88 
 
 		 391 aa  62  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  26.97 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  26.97 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  31.79 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  25.68 
 
 		 593 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  31.05 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  27.31 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>