109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13428 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1175  hypothetical protein  79.43 
 
 		 532 aa  741    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1192  hypothetical protein  79.43 
 
 		 529 aa  740    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1523  hypothetical protein  77.9 
 
 		 522 aa  717    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1202  hypothetical protein  79.43 
 
 		 529 aa  740    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.344019  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4898  hypothetical protein  74.25 
 
 		 531 aa  678    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.834206  normal  0.0834013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13428  hypothetical protein  100 
 
 		 527 aa  1015    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0923  hypothetical protein  57.95 
 
 		 527 aa  514  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1747  hypothetical protein  55.49 
 
 		 536 aa  504  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3156  UMUC domain protein DNA-repair protein  50.57 
 
 		 510 aa  412  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000974062  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3467  DNA-repair protein  48.35 
 
 		 528 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  normal  0.0126488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2945  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  44.49 
 
 		 505 aa  352  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.000000598538  decreased coverage  0.00000434939 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3240  hypothetical protein  48.71 
 
 		 524 aa  345  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488053  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2039  hypothetical protein  39.51 
 
 		 581 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.566112  normal  0.522751 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2288  DNA-repair protein  41.85 
 
 		 562 aa  303  7.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0994  hypothetical protein  39.96 
 
 		 527 aa  296  5e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15750  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.85 
 
 		 589 aa  278  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0334276  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21280  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  42.1 
 
 		 553 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00165363  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1896  putative DNA-directed DNA polymerase  39.03 
 
 		 520 aa  259  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.582074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5241  hypothetical protein  38.46 
 
 		 535 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0112063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1440  hypothetical protein  45.44 
 
 		 549 aa  251  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1186  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31.89 
 
 		 549 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000707508  normal  0.0119021 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  28.73 
 
 		 501 aa  91.3  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  30.63 
 
 		 529 aa  80.5  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2667  hypothetical protein  29.83 
 
 		 462 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1732  hypothetical protein  26.79 
 
 		 490 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0965901  hitchhiker  0.00613419 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4054  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  25.99 
 
 		 526 aa  73.6  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  22.31 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  26.26 
 
 		 477 aa  67  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  25.56 
 
 		 472 aa  66.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  27.57 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  24.87 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  28.72 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  26.59 
 
 		 589 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  26.67 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  26.08 
 
 		 545 aa  61.6  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2005  hypothetical protein  26.46 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3564  hypothetical protein  26.26 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  28.07 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  26.32 
 
 		 593 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.2 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1902  hypothetical protein  25.05 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1612  putative DNA-directed DNA polymerase  27.88 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  32.06 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  26.24 
 
 		 436 aa  55.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1120  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  26.77 
 
 		 515 aa  55.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  26.97 
 
 		 525 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  21.97 
 
 		 506 aa  55.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  26.27 
 
 		 459 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  26.27 
 
 		 459 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13520  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.01 
 
 		 433 aa  54.7  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  22.87 
 
 		 500 aa  54.3  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  27.46 
 
 		 489 aa  54.3  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  25.34 
 
 		 477 aa  53.9  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  27.14 
 
 		 480 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  26.36 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  24.28 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  24.76 
 
 		 413 aa  51.6  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  24.06 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3205  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  27.18 
 
 		 527 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.663167  normal  0.015197 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  21.58 
 
 		 354 aa  50.4  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  25.34 
 
 		 392 aa  50.4  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  26.62 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  23.74 
 
 		 407 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3095  DNA polymerase IV  29.89 
 
 		 454 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  27.57 
 
 		 410 aa  48.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3155  DNA polymerase IV  29.89 
 
 		 452 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.945689  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2201  hypothetical protein  30.33 
 
 		 555 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  28.69 
 
 		 481 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5725  hypothetical protein  28.51 
 
 		 468 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  25.19 
 
 		 410 aa  47.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  24 
 
 		 399 aa  47  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3115  DNA polymerase IV  29.35 
 
 		 452 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.75 
 
 		 548 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  25.29 
 
 		 492 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  24.21 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  22.95 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  23.43 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  23.93 
 
 		 453 aa  46.2  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  23.15 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  23.02 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3609  DNA-directed DNA polymerase  28.85 
 
 		 405 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  26.73 
 
 		 379 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3810  DNA polymerase IV  26.81 
 
 		 428 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0803828  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13073  DNA polymerase IV  26.14 
 
 		 346 aa  45.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.498558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4251  hypothetical protein  31.98 
 
 		 395 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240238  normal  0.380401 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2337  hypothetical protein  29.25 
 
 		 539 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30742  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0687  DNA-directed DNA polymerase  25.27 
 
 		 444 aa  45.4  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000344848  hitchhiker  0.00527115 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  26.02 
 
 		 409 aa  44.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  24.38 
 
 		 479 aa  44.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  30.23 
 
 		 474 aa  44.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2249  hypothetical protein  28.96 
 
 		 569 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0732725  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3002  DNA-directed DNA polymerase  31.82 
 
 		 449 aa  44.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  25.68 
 
 		 425 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  26.23 
 
 		 536 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  27.47 
 
 		 407 aa  44.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  28.9 
 
 		 472 aa  44.3  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  24.3 
 
 		 527 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1285  DNA polymerase IV  23.55 
 
 		 431 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25949  normal  0.0407739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4046  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  22.79 
 
 		 495 aa  43.9  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  27.23 
 
 		 383 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>