157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15750 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_15750  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  100 
 
 		 589 aa  1122    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0334276  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3156  UMUC domain protein DNA-repair protein  42.43 
 
 		 510 aa  317  4e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000974062  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2039  hypothetical protein  37.97 
 
 		 581 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.566112  normal  0.522751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3467  DNA-repair protein  40.07 
 
 		 528 aa  302  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  normal  0.0126488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2945  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  38.16 
 
 		 505 aa  297  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.000000598538  decreased coverage  0.00000434939 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2288  DNA-repair protein  40.17 
 
 		 562 aa  284  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1175  hypothetical protein  41.11 
 
 		 532 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1192  hypothetical protein  41.11 
 
 		 529 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1202  hypothetical protein  41.11 
 
 		 529 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.344019  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0923  hypothetical protein  38.8 
 
 		 527 aa  281  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13428  hypothetical protein  39.74 
 
 		 527 aa  274  3e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3240  hypothetical protein  38.71 
 
 		 524 aa  272  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488053  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21280  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.95 
 
 		 553 aa  270  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00165363  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1523  hypothetical protein  39.02 
 
 		 522 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4898  hypothetical protein  39 
 
 		 531 aa  258  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.834206  normal  0.0834013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1747  hypothetical protein  35.03 
 
 		 536 aa  251  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0994  hypothetical protein  36.96 
 
 		 527 aa  249  8e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1440  hypothetical protein  41.22 
 
 		 549 aa  246  8e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1186  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31.36 
 
 		 549 aa  205  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000707508  normal  0.0119021 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1896  putative DNA-directed DNA polymerase  33.68 
 
 		 520 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.582074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5241  hypothetical protein  32.71 
 
 		 535 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0112063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  25.27 
 
 		 406 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  28.27 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  27.27 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3159  DNA-directed DNA polymerase  27.56 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.382923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  26.05 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  27.98 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  26.84 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4251  hypothetical protein  32.51 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240238  normal  0.380401 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  25.58 
 
 		 409 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  30 
 
 		 472 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  27 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  28.57 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  27.74 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  25.3 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5822  DNA polymerase IV  30.2 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  30.35 
 
 		 489 aa  57.4  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  27.78 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  27.78 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  27.78 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0008  DNA-directed DNA polymerase  28.45 
 
 		 385 aa  57  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  27.24 
 
 		 501 aa  57  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3696  DNA-directed DNA polymerase  26.24 
 
 		 422 aa  56.6  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0931583  normal  0.897611 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  27.12 
 
 		 593 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  27.13 
 
 		 471 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3489  DNA-directed DNA polymerase  29.77 
 
 		 394 aa  55.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  25.48 
 
 		 390 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  26.19 
 
 		 408 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  24.53 
 
 		 467 aa  55.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  29.69 
 
 		 483 aa  55.1  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  26.62 
 
 		 589 aa  55.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2649  DNA-directed DNA polymerase  26.14 
 
 		 403 aa  54.7  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  26.7 
 
 		 507 aa  54.7  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  28.25 
 
 		 472 aa  54.7  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  24.65 
 
 		 409 aa  54.7  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  27.78 
 
 		 473 aa  54.3  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3095  DNA polymerase IV  33.52 
 
 		 454 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3155  DNA polymerase IV  33.52 
 
 		 452 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.945689  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3115  DNA polymerase IV  33.52 
 
 		 452 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1128  DNA polymerase IV  28.46 
 
 		 429 aa  53.9  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456598  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  23.14 
 
 		 409 aa  53.5  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  28.68 
 
 		 480 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  26.01 
 
 		 384 aa  53.5  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  27.38 
 
 		 379 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  26.02 
 
 		 408 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7420  DNA polymerase IV  27.24 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108606  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1647  DNA-directed DNA polymerase  25.31 
 
 		 432 aa  52.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1234  DNA-directed DNA polymerase  28.61 
 
 		 396 aa  52.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3642  DNA polymerase IV  39.77 
 
 		 455 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  26.94 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  27.47 
 
 		 507 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2201  hypothetical protein  35.24 
 
 		 555 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3422  DNA polymerase IV  25.1 
 
 		 360 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  26.97 
 
 		 410 aa  52  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2123  UMUC-like DNA-repair protein  23.87 
 
 		 387 aa  51.6  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48636  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  24.3 
 
 		 345 aa  51.6  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2771  DNA polymerase IV  31.87 
 
 		 453 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.259095  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  27.82 
 
 		 407 aa  51.6  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0937  DNA-directed DNA polymerase  28.62 
 
 		 436 aa  51.6  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5871  DNA-directed DNA polymerase  26.37 
 
 		 381 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.937041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  29.69 
 
 		 529 aa  51.2  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  27.8 
 
 		 486 aa  50.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1612  putative DNA-directed DNA polymerase  26.95 
 
 		 517 aa  51.2  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  22.64 
 
 		 408 aa  50.8  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  25.43 
 
 		 389 aa  50.8  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.84 
 
 		 499 aa  50.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11570  DNA polymerase IV  30.77 
 
 		 463 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13520  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.61 
 
 		 433 aa  50.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1812  DNA polymerase IV  30.19 
 
 		 355 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1859  DNA polymerase IV  30.19 
 
 		 355 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  27.16 
 
 		 386 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1793  DNA polymerase IV  30.19 
 
 		 355 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624184  normal  0.997558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4310  DNA polymerase IV  29.86 
 
 		 357 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  29.34 
 
 		 499 aa  50.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  29.04 
 
 		 472 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  25.28 
 
 		 415 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0931  DNA polymerase IV  22.26 
 
 		 353 aa  48.9  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.643762  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2037  DNA polymerase IV  29.38 
 
 		 354 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279292 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  23.23 
 
 		 359 aa  49.3  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2052  DNA polymerase IV  26.59 
 
 		 407 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217696  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>