147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0923 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0923  hypothetical protein  100 
 
 		 527 aa  1011    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1747  hypothetical protein  56.51 
 
 		 536 aa  541  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1523  hypothetical protein  60.15 
 
 		 522 aa  514  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13428  hypothetical protein  58.14 
 
 		 527 aa  503  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1175  hypothetical protein  59.92 
 
 		 532 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1192  hypothetical protein  59.92 
 
 		 529 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1202  hypothetical protein  59.92 
 
 		 529 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.344019  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4898  hypothetical protein  59.07 
 
 		 531 aa  488  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.834206  normal  0.0834013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3156  UMUC domain protein DNA-repair protein  50.38 
 
 		 510 aa  428  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000974062  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3467  DNA-repair protein  48.82 
 
 		 528 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  normal  0.0126488 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3240  hypothetical protein  47.77 
 
 		 524 aa  353  4e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488053  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2039  hypothetical protein  40.59 
 
 		 581 aa  324  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.566112  normal  0.522751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2945  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  40.49 
 
 		 505 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.000000598538  decreased coverage  0.00000434939 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2288  DNA-repair protein  41.74 
 
 		 562 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0994  hypothetical protein  41.06 
 
 		 527 aa  306  6e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21280  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  41.35 
 
 		 553 aa  280  5e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00165363  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15750  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.91 
 
 		 589 aa  280  5e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0334276  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1896  putative DNA-directed DNA polymerase  38.76 
 
 		 520 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.582074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5241  hypothetical protein  39.67 
 
 		 535 aa  266  7e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0112063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1440  hypothetical protein  42.99 
 
 		 549 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1186  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31.83 
 
 		 549 aa  213  7.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000707508  normal  0.0119021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  28.22 
 
 		 529 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.19 
 
 		 499 aa  84  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  26.21 
 
 		 501 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  28 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  24.26 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1732  hypothetical protein  25.73 
 
 		 490 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0965901  hitchhiker  0.00613419 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2667  hypothetical protein  25.69 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  29.74 
 
 		 545 aa  70.9  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2005  hypothetical protein  33.84 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  26.86 
 
 		 489 aa  69.7  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  27.23 
 
 		 500 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5725  hypothetical protein  30.08 
 
 		 468 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1120  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  26.11 
 
 		 515 aa  67.8  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  28.51 
 
 		 480 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  32.94 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  27.99 
 
 		 507 aa  64.3  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  31.68 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  22.33 
 
 		 487 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  27.38 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  27.21 
 
 		 486 aa  63.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.88 
 
 		 548 aa  63.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  30.43 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  25.74 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  24.21 
 
 		 471 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  27.18 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  28.14 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  25.19 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  27.98 
 
 		 525 aa  59.7  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  25.45 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1902  hypothetical protein  26.9 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  25.75 
 
 		 534 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  26.47 
 
 		 536 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  28.9 
 
 		 522 aa  58.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4054  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  23.83 
 
 		 526 aa  58.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  24.53 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  30.94 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4251  hypothetical protein  32.8 
 
 		 395 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240238  normal  0.380401 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.7 
 
 		 473 aa  56.6  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3564  hypothetical protein  30 
 
 		 488 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2801  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  29.54 
 
 		 452 aa  55.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.15 
 
 		 503 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  32.18 
 
 		 441 aa  54.7  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  24.4 
 
 		 479 aa  54.7  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  27.11 
 
 		 506 aa  54.3  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.63 
 
 		 499 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  30.11 
 
 		 410 aa  53.9  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  29.65 
 
 		 492 aa  53.5  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  23.4 
 
 		 589 aa  53.9  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  23.19 
 
 		 459 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4290  hypothetical protein  28.44 
 
 		 506 aa  53.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  27.33 
 
 		 499 aa  52.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  24.14 
 
 		 486 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00039  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  22.93 
 
 		 484 aa  53.5  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000511104  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  26.28 
 
 		 477 aa  52.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28877  DNA repair protein  24.78 
 
 		 1118 aa  52  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.765985 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  29.67 
 
 		 474 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  23.01 
 
 		 593 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  23.42 
 
 		 459 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3231  putative DNA repair enzyme  24.92 
 
 		 552 aa  51.6  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2013  hypothetical protein  30.19 
 
 		 562 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  23.72 
 
 		 407 aa  51.2  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  28.69 
 
 		 467 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1740  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.62 
 
 		 393 aa  50.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3235  DNA-directed DNA polymerase  21.75 
 
 		 380 aa  50.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  25.44 
 
 		 409 aa  50.4  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  27.49 
 
 		 474 aa  50.4  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2337  hypothetical protein  29.61 
 
 		 539 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30742  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4046  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  24.59 
 
 		 495 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2332  DNA-directed DNA polymerase  25.61 
 
 		 353 aa  49.7  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  22.64 
 
 		 409 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  23.54 
 
 		 492 aa  50.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  25.25 
 
 		 467 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  24.41 
 
 		 408 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  30 
 
 		 418 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  24.03 
 
 		 352 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  29.52 
 
 		 420 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  26.88 
 
 		 488 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  26.88 
 
 		 488 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  26.88 
 
 		 491 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>