166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2288 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2288  DNA-repair protein  100 
 
 		 562 aa  1060    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2039  hypothetical protein  45.73 
 
 		 581 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.566112  normal  0.522751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21280  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  48.69 
 
 		 553 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00165363  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3467  DNA-repair protein  46.95 
 
 		 528 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  normal  0.0126488 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3240  hypothetical protein  47.15 
 
 		 524 aa  355  8.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488053  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1440  hypothetical protein  50.36 
 
 		 549 aa  351  2e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1747  hypothetical protein  42.43 
 
 		 536 aa  333  5e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3156  UMUC domain protein DNA-repair protein  45.34 
 
 		 510 aa  332  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000974062  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0923  hypothetical protein  41.38 
 
 		 527 aa  322  9.000000000000001e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2945  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  40.99 
 
 		 505 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.000000598538  decreased coverage  0.00000434939 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1192  hypothetical protein  42.93 
 
 		 529 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1202  hypothetical protein  42.93 
 
 		 529 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.344019  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1175  hypothetical protein  42.93 
 
 		 532 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1523  hypothetical protein  43.17 
 
 		 522 aa  312  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13428  hypothetical protein  41.85 
 
 		 527 aa  311  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15750  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  39.97 
 
 		 589 aa  304  4.0000000000000003e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0334276  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4898  hypothetical protein  41.99 
 
 		 531 aa  298  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.834206  normal  0.0834013 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1896  putative DNA-directed DNA polymerase  39.35 
 
 		 520 aa  288  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.582074  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0994  hypothetical protein  40.54 
 
 		 527 aa  280  5e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1186  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33.86 
 
 		 549 aa  245  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000707508  normal  0.0119021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5241  hypothetical protein  38.69 
 
 		 535 aa  240  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0112063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  27.27 
 
 		 414 aa  83.2  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  28.84 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  27.23 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  26.36 
 
 		 409 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  28.89 
 
 		 410 aa  70.1  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  28.46 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  25.49 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  24.41 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  32.12 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  25.1 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  27.59 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  29.76 
 
 		 405 aa  62  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2332  DNA-directed DNA polymerase  29.72 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353166  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  30.12 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  28.69 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  28.69 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  30.14 
 
 		 395 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  26.96 
 
 		 413 aa  60.1  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  28.69 
 
 		 361 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  29.88 
 
 		 419 aa  60.1  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  27 
 
 		 593 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1612  putative DNA-directed DNA polymerase  30.21 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  24.68 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  25.81 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2201  hypothetical protein  40 
 
 		 555 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  28.29 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2507  DNA-directed DNA polymerase  22.26 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  26.83 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  28.43 
 
 		 507 aa  57  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2052  DNA polymerase IV  28.93 
 
 		 407 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  26.26 
 
 		 589 aa  57  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  24.83 
 
 		 477 aa  56.6  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1128  DNA polymerase IV  28.1 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456598  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  29.01 
 
 		 384 aa  57  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0385  DNA polymerase IV  27.02 
 
 		 417 aa  56.6  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.434794  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  31.92 
 
 		 431 aa  55.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1397  DNA polymerase IV  28.7 
 
 		 354 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  24.17 
 
 		 371 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  23.85 
 
 		 395 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2667  hypothetical protein  27.05 
 
 		 462 aa  56.2  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  27.05 
 
 		 436 aa  55.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  26.27 
 
 		 413 aa  54.7  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  26.42 
 
 		 529 aa  54.7  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  28.53 
 
 		 507 aa  54.7  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0949  DNA polymerase IV  26.15 
 
 		 359 aa  54.3  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  26.19 
 
 		 352 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  25.1 
 
 		 409 aa  53.9  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2021  DNA polymerase IV  30.04 
 
 		 357 aa  53.9  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28877  DNA repair protein  26.76 
 
 		 1118 aa  53.9  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.765985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2005  hypothetical protein  27.15 
 
 		 478 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  26.3 
 
 		 471 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  26.5 
 
 		 408 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2249  hypothetical protein  30.09 
 
 		 569 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0732725  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  26.04 
 
 		 430 aa  52.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  30.12 
 
 		 472 aa  52  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3002  DNA-directed DNA polymerase  28.16 
 
 		 449 aa  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  29.67 
 
 		 417 aa  52  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2337  hypothetical protein  34.92 
 
 		 539 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30742  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1195  DNA polymerase IV  26.77 
 
 		 353 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52310  DNA polymerase IV  29.65 
 
 		 349 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.88026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  26.55 
 
 		 406 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0947  DNA polymerase IV  25.19 
 
 		 359 aa  50.8  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11570  DNA polymerase IV  29.47 
 
 		 463 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4587  DNA polymerase IV  29.65 
 
 		 349 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.099232  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  27.44 
 
 		 422 aa  50.8  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3784  DNA-directed DNA polymerase  23.77 
 
 		 352 aa  50.8  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.466948  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3990  DNA polymerase IV  26.96 
 
 		 353 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1114  DNA polymerase IV  25.57 
 
 		 357 aa  50.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  32.26 
 
 		 418 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  30 
 
 		 472 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  27.63 
 
 		 410 aa  50.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0985  DNA polymerase IV  25.38 
 
 		 359 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2619  DNA polymerase IV  29.73 
 
 		 403 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1727  DNA polymerase IV  29.73 
 
 		 404 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2751  DNA polymerase IV  29.73 
 
 		 404 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  26.87 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0931  DNA polymerase IV  21.62 
 
 		 353 aa  48.9  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.643762  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3155  DNA polymerase IV  29.67 
 
 		 452 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.945689  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2236  DNA polymerase IV  29.73 
 
 		 400 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.783166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>