125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1202 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1175  hypothetical protein  99.81 
 
 		 532 aa  1030    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1192  hypothetical protein  100 
 
 		 529 aa  1032    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1523  hypothetical protein  85.41 
 
 		 522 aa  803    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1202  hypothetical protein  100 
 
 		 529 aa  1032    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.344019  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4898  hypothetical protein  82.55 
 
 		 531 aa  768    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.834206  normal  0.0834013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13428  hypothetical protein  79.43 
 
 		 527 aa  757    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0923  hypothetical protein  59.92 
 
 		 527 aa  541  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1747  hypothetical protein  55.82 
 
 		 536 aa  521  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3156  UMUC domain protein DNA-repair protein  52.78 
 
 		 510 aa  440  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000974062  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3467  DNA-repair protein  49.72 
 
 		 528 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  normal  0.0126488 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3240  hypothetical protein  50.65 
 
 		 524 aa  359  8e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488053  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2945  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  43.4 
 
 		 505 aa  355  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.000000598538  decreased coverage  0.00000434939 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2288  DNA-repair protein  42.93 
 
 		 562 aa  326  6e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2039  hypothetical protein  40.88 
 
 		 581 aa  317  5e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.566112  normal  0.522751 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0994  hypothetical protein  41.42 
 
 		 527 aa  301  3e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15750  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.21 
 
 		 589 aa  293  4e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0334276  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1896  putative DNA-directed DNA polymerase  41.01 
 
 		 520 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.582074  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21280  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  42.5 
 
 		 553 aa  282  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00165363  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1440  hypothetical protein  45.7 
 
 		 549 aa  274  3e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5241  hypothetical protein  39.49 
 
 		 535 aa  263  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0112063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1186  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33.21 
 
 		 549 aa  231  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000707508  normal  0.0119021 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  26.12 
 
 		 501 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4054  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  27.32 
 
 		 526 aa  82.4  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1612  putative DNA-directed DNA polymerase  30.86 
 
 		 517 aa  74.7  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  28.57 
 
 		 529 aa  74.3  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  26.3 
 
 		 477 aa  73.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.09 
 
 		 473 aa  70.5  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  23.33 
 
 		 499 aa  70.5  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1120  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  27.66 
 
 		 515 aa  70.1  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  25.68 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  29.23 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  25.68 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2667  hypothetical protein  25.81 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  26.1 
 
 		 471 aa  66.6  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  26.32 
 
 		 486 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  25.11 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  26.29 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2005  hypothetical protein  27.34 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  24.63 
 
 		 471 aa  63.9  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  25.1 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  24.86 
 
 		 545 aa  63.2  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  25.4 
 
 		 487 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  28.52 
 
 		 480 aa  62.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  23.57 
 
 		 500 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  21.95 
 
 		 506 aa  61.6  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3564  hypothetical protein  25.92 
 
 		 488 aa  60.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1902  hypothetical protein  26.62 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  25.88 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  27.12 
 
 		 408 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  27.64 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  24.11 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  23.81 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  26.91 
 
 		 593 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1732  hypothetical protein  25.4 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0965901  hitchhiker  0.00613419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  26.63 
 
 		 589 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  24.24 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  29.08 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  29.32 
 
 		 472 aa  57  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  27.27 
 
 		 507 aa  57  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  26.11 
 
 		 525 aa  56.6  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  28.14 
 
 		 507 aa  55.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  31.28 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3205  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  24.33 
 
 		 527 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.663167  normal  0.015197 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  23.58 
 
 		 527 aa  53.9  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  23.51 
 
 		 540 aa  54.3  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  23.88 
 
 		 476 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  26.46 
 
 		 534 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  26.8 
 
 		 534 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  26.15 
 
 		 489 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  25.52 
 
 		 472 aa  52.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28877  DNA repair protein  24.62 
 
 		 1118 aa  51.2  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.765985 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  23.66 
 
 		 499 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  29.41 
 
 		 410 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  27.12 
 
 		 500 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  26.83 
 
 		 436 aa  50.4  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4251  hypothetical protein  32.99 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240238  normal  0.380401 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  25.45 
 
 		 392 aa  49.7  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  29.53 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  22.68 
 
 		 487 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1370  DNA-directed DNA polymerase  23.71 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.67195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.03 
 
 		 548 aa  49.3  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00039  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  22.12 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000511104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  22.99 
 
 		 479 aa  48.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  24.64 
 
 		 407 aa  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  25.09 
 
 		 469 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  29.3 
 
 		 472 aa  48.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4290  hypothetical protein  26.93 
 
 		 506 aa  47.4  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  27.59 
 
 		 386 aa  47.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  24.55 
 
 		 410 aa  47.4  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  23.57 
 
 		 489 aa  47  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2013  hypothetical protein  30.69 
 
 		 562 aa  47  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  24.76 
 
 		 445 aa  47  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13520  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.22 
 
 		 433 aa  46.6  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  26.43 
 
 		 441 aa  47  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  26.52 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3095  DNA polymerase IV  31.71 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3155  DNA polymerase IV  31.71 
 
 		 452 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.945689  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  29.77 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4919  DNA-directed DNA polymerase  21.39 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3115  DNA polymerase IV  31.71 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>