80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1440 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1440  hypothetical protein  100 
 
 		 549 aa  1019    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2039  hypothetical protein  52.78 
 
 		 581 aa  466  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.566112  normal  0.522751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21280  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  58.16 
 
 		 553 aa  463  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00165363  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2288  DNA-repair protein  50.53 
 
 		 562 aa  395  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3467  DNA-repair protein  48.66 
 
 		 528 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  normal  0.0126488 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1747  hypothetical protein  44.96 
 
 		 536 aa  332  8e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3240  hypothetical protein  49.19 
 
 		 524 aa  323  5e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488053  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0923  hypothetical protein  42.93 
 
 		 527 aa  316  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2945  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  43.25 
 
 		 505 aa  316  7e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.000000598538  decreased coverage  0.00000434939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3156  UMUC domain protein DNA-repair protein  44.36 
 
 		 510 aa  312  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000974062  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1175  hypothetical protein  45.19 
 
 		 532 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1192  hypothetical protein  45.19 
 
 		 529 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1202  hypothetical protein  45.19 
 
 		 529 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.344019  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4898  hypothetical protein  45.74 
 
 		 531 aa  306  6e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.834206  normal  0.0834013 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0994  hypothetical protein  41.56 
 
 		 527 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1523  hypothetical protein  44.93 
 
 		 522 aa  302  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13428  hypothetical protein  44.46 
 
 		 527 aa  301  2e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15750  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.68 
 
 		 589 aa  300  4e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0334276  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1896  putative DNA-directed DNA polymerase  41.16 
 
 		 520 aa  274  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.582074  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1186  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.89 
 
 		 549 aa  271  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000707508  normal  0.0119021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5241  hypothetical protein  41.18 
 
 		 535 aa  252  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0112063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  27.59 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  27.02 
 
 		 593 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  34.16 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  26.6 
 
 		 589 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4054  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  26.67 
 
 		 526 aa  58.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4251  hypothetical protein  35.82 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240238  normal  0.380401 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2201  hypothetical protein  29.7 
 
 		 555 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  23.96 
 
 		 503 aa  53.9  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  30.62 
 
 		 486 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2249  hypothetical protein  38.46 
 
 		 569 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0732725  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  29.6 
 
 		 369 aa  52  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2337  hypothetical protein  38.46 
 
 		 539 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30742  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.37 
 
 		 473 aa  51.2  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  27.57 
 
 		 471 aa  51.2  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  28.57 
 
 		 507 aa  50.4  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  25.26 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  27.57 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  34.8 
 
 		 418 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  27.63 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  34.8 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  35.29 
 
 		 418 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  25.91 
 
 		 409 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  26.64 
 
 		 408 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  35.64 
 
 		 399 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  23.19 
 
 		 371 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  25.24 
 
 		 407 aa  48.9  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  23.64 
 
 		 390 aa  48.5  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  26.64 
 
 		 383 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  26.64 
 
 		 361 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1612  putative DNA-directed DNA polymerase  27.98 
 
 		 517 aa  47.8  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  20.68 
 
 		 499 aa  47.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  29.78 
 
 		 409 aa  47.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  26.69 
 
 		 429 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  28.99 
 
 		 472 aa  47.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  26.94 
 
 		 409 aa  47.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4046  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  28.62 
 
 		 495 aa  47.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  26.14 
 
 		 429 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  27.54 
 
 		 406 aa  47.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  27.27 
 
 		 392 aa  47  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  25.29 
 
 		 477 aa  47  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  33.45 
 
 		 466 aa  46.6  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  28.71 
 
 		 540 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  25 
 
 		 529 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  31.06 
 
 		 472 aa  46.2  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  29.21 
 
 		 527 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  22.22 
 
 		 409 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  28.3 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  27.52 
 
 		 501 aa  45.4  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  31.31 
 
 		 523 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1611  hypothetical protein  37.63 
 
 		 551 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  22.73 
 
 		 409 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  26.77 
 
 		 449 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  28.24 
 
 		 472 aa  45.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2667  hypothetical protein  29.33 
 
 		 462 aa  44.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  25.91 
 
 		 379 aa  44.3  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  24.71 
 
 		 477 aa  44.3  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  24.66 
 
 		 506 aa  44.3  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  22.91 
 
 		 417 aa  43.9  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  27.23 
 
 		 418 aa  43.5  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>