19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1612 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1612  putative DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 517 aa  967    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1192  hypothetical protein  30.98 
 
 		 529 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1202  hypothetical protein  30.98 
 
 		 529 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.344019  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1175  hypothetical protein  30.98 
 
 		 532 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1523  hypothetical protein  29.3 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2945  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  29.79 
 
 		 505 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.000000598538  decreased coverage  0.00000434939 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4898  hypothetical protein  28.29 
 
 		 531 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.834206  normal  0.0834013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2288  DNA-repair protein  32.45 
 
 		 562 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3467  DNA-repair protein  33.74 
 
 		 528 aa  65.1  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  normal  0.0126488 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3240  hypothetical protein  31.35 
 
 		 524 aa  63.9  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488053  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1896  putative DNA-directed DNA polymerase  29.19 
 
 		 520 aa  63.5  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.582074  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13428  hypothetical protein  37.5 
 
 		 527 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0994  hypothetical protein  26.19 
 
 		 527 aa  60.8  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15750  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.25 
 
 		 589 aa  58.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0334276  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0923  hypothetical protein  31.86 
 
 		 527 aa  54.7  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2039  hypothetical protein  41.67 
 
 		 581 aa  53.5  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.566112  normal  0.522751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21280  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  30.35 
 
 		 553 aa  52.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00165363  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3156  UMUC domain protein DNA-repair protein  30.49 
 
 		 510 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000974062  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1440  hypothetical protein  27.96 
 
 		 549 aa  45.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>