50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5725 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5725  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  921    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0923  hypothetical protein  30.08 
 
 		 527 aa  67  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3205  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  26.77 
 
 		 527 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.663167  normal  0.015197 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2945  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  30.06 
 
 		 505 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.000000598538  decreased coverage  0.00000434939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.09 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3467  DNA-repair protein  28.94 
 
 		 528 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  normal  0.0126488 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  28.12 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  28.91 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0994  hypothetical protein  31.03 
 
 		 527 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  26.86 
 
 		 466 aa  52.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  26.83 
 
 		 413 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  25.21 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  29.26 
 
 		 472 aa  51.6  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  28.89 
 
 		 418 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  26.58 
 
 		 391 aa  50.4  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  23.55 
 
 		 406 aa  50.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7420  DNA polymerase IV  26.63 
 
 		 429 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108606  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.59 
 
 		 499 aa  50.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4054  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  27.84 
 
 		 526 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  27.66 
 
 		 499 aa  49.7  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  26.3 
 
 		 431 aa  48.5  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  28.64 
 
 		 477 aa  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  26.34 
 
 		 477 aa  48.5  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1747  hypothetical protein  27.94 
 
 		 536 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  24.3 
 
 		 414 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13428  hypothetical protein  26.89 
 
 		 527 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  26.36 
 
 		 420 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3156  UMUC domain protein DNA-repair protein  27.24 
 
 		 510 aa  47  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000974062  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  25.39 
 
 		 410 aa  47  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  24.36 
 
 		 390 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  25.58 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  22.13 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  26.69 
 
 		 529 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2005  hypothetical protein  30.81 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03909  deoxycytidyl transferase (Eurofung)  23.57 
 
 		 1139 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.310555 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0324  DNA-directed DNA polymerase  26.13 
 
 		 405 aa  44.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.86513 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  26.21 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  31.65 
 
 		 399 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  25.49 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  24.47 
 
 		 402 aa  44.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4251  hypothetical protein  28.03 
 
 		 395 aa  44.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240238  normal  0.380401 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  26.11 
 
 		 474 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.64 
 
 		 415 aa  44.3  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  25.42 
 
 		 422 aa  43.9  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  26.8 
 
 		 359 aa  43.9  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  28.46 
 
 		 467 aa  43.9  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3355  DNA polymerase IV  24.27 
 
 		 358 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0935  DNA polymerase IV  24.69 
 
 		 358 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  23.63 
 
 		 408 aa  43.5  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  24.14 
 
 		 408 aa  43.1  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>