More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2633 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2633  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 515 aa  1052    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.192046  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2622  extracellular solute-binding protein  50 
 
 		 517 aa  537  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.558753  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3034  ABC peptide/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.55 
 
 		 519 aa  286  8e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3761  extracellular solute-binding protein  35.54 
 
 		 519 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4458  opine ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  30.67 
 
 		 526 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.124294  hitchhiker  0.0000632484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2475  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 521 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0955412  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4344  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 526 aa  146  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8162  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  30 
 
 		 522 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164688  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4335  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 526 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.83307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.02 
 
 		 520 aa  131  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 538 aa  126  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.17 
 
 		 532 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  26.58 
 
 		 509 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  25.51 
 
 		 515 aa  124  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 510 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 538 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 528 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3570  extracellular solute-binding protein family 5  24.81 
 
 		 506 aa  120  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.29 
 
 		 521 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  26.1 
 
 		 495 aa  117  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.64 
 
 		 510 aa  116  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 516 aa  116  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.29 
 
 		 521 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.29 
 
 		 521 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  25.78 
 
 		 541 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.29 
 
 		 521 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 521 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.68 
 
 		 534 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  26.49 
 
 		 540 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  26.52 
 
 		 539 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 540 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4050  extracellular solute-binding protein family 5  25.33 
 
 		 548 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.83 
 
 		 540 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.37 
 
 		 546 aa  110  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  25.85 
 
 		 514 aa  110  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  27.92 
 
 		 503 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4534  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  26.6 
 
 		 504 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 503 aa  109  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  25.69 
 
 		 516 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 511 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.19 
 
 		 535 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4355  extracellular solute-binding protein family 5  25.77 
 
 		 495 aa  108  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0355555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 528 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3619  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 495 aa  107  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 521 aa  106  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 533 aa  106  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 529 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 564 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 595 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  27.2 
 
 		 524 aa  104  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.12 
 
 		 532 aa  103  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 525 aa  103  8e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7644  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 		 528 aa  103  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.938913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 		 544 aa  103  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  26.75 
 
 		 532 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  23.79 
 
 		 544 aa  102  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 517 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  28.61 
 
 		 523 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 533 aa  101  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.6 
 
 		 528 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4049  twin-arginine translocation pathway signal  24.8 
 
 		 539 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.684503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 539 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.6 
 
 		 529 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 538 aa  100  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  24.45 
 
 		 516 aa  100  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.26 
 
 		 529 aa  100  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.6 
 
 		 528 aa  100  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 516 aa  100  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0816  extracellular solute-binding protein family 5  26.49 
 
 		 496 aa  100  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0887  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 496 aa  100  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.545524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  23.95 
 
 		 520 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4211  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 504 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  23.54 
 
 		 547 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  25.06 
 
 		 525 aa  99.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 505 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  25.79 
 
 		 533 aa  99.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  24.45 
 
 		 516 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  24.45 
 
 		 516 aa  99  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1660  extracellular solute-binding protein family 5  24.54 
 
 		 539 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40005  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3248  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  27.25 
 
 		 540 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 500 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.55 
 
 		 545 aa  99  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6191  extracellular solute-binding protein family 5  26.22 
 
 		 504 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172417  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.06 
 
 		 550 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2047  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 529 aa  98.6  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101703  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  23.74 
 
 		 516 aa  99  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 536 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 520 aa  98.2  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 529 aa  98.6  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.352303 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  24.24 
 
 		 516 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  21.92 
 
 		 528 aa  97.8  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 527 aa  97.8  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.92 
 
 		 528 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  21.92 
 
 		 528 aa  97.8  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>