More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2622 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2622  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 517 aa  1063    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.558753  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2633  twin-arginine translocation pathway signal  50.82 
 
 		 515 aa  527  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.192046  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3034  ABC peptide/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.45 
 
 		 519 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3761  extracellular solute-binding protein  35.5 
 
 		 519 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2475  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 		 521 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0955412  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4344  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 		 526 aa  143  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4458  opine ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  30.15 
 
 		 526 aa  143  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.124294  hitchhiker  0.0000632484 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.08 
 
 		 521 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.72 
 
 		 521 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.72 
 
 		 521 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.72 
 
 		 521 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.72 
 
 		 521 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8162  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  26.74 
 
 		 522 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164688  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.67 
 
 		 510 aa  126  9e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.73 
 
 		 512 aa  126  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 510 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 511 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 516 aa  124  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4335  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 526 aa  123  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.83307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 516 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  25.79 
 
 		 516 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26 
 
 		 516 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.04 
 
 		 516 aa  120  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.2 
 
 		 534 aa  120  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 525 aa  120  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  24.9 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  26.51 
 
 		 515 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  25.79 
 
 		 516 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  25.79 
 
 		 516 aa  118  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 521 aa  116  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.44 
 
 		 528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.47 
 
 		 529 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.44 
 
 		 528 aa  115  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.44 
 
 		 528 aa  115  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 541 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  25.44 
 
 		 516 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  25.52 
 
 		 516 aa  113  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.43 
 
 		 529 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  24.12 
 
 		 526 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.44 
 
 		 528 aa  113  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.44 
 
 		 528 aa  113  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.43 
 
 		 528 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 528 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25.59 
 
 		 520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26350  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.61 
 
 		 526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228589 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 522 aa  111  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 512 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 512 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  22.01 
 
 		 529 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 512 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  24.11 
 
 		 532 aa  110  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  23.82 
 
 		 535 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  23.15 
 
 		 544 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 		 595 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 521 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  23.98 
 
 		 544 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  25.59 
 
 		 509 aa  108  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  23.4 
 
 		 517 aa  107  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 		 535 aa  107  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 532 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.65 
 
 		 545 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 526 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 528 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 538 aa  105  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  24.64 
 
 		 502 aa  104  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.32 
 
 		 505 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  26.24 
 
 		 531 aa  103  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 535 aa  103  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  24.71 
 
 		 556 aa  103  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 515 aa  103  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  27.53 
 
 		 523 aa  103  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  24.79 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  24.66 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2124  hypothetical protein  27.76 
 
 		 566 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5088  extracellular solute-binding protein family 5  26.22 
 
 		 553 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.416607 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 540 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 528 aa  101  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0239  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 529 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0409  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.03 
 
 		 527 aa  100  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0352  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.03 
 
 		 527 aa  100  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3804  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 501 aa  100  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000726853  hitchhiker  0.0000406829 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  24.85 
 
 		 503 aa  100  9e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.67 
 
 		 504 aa  99.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  22.68 
 
 		 541 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1850  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 499 aa  99.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 493 aa  99.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 510 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2203  extracellular solute-binding protein family 5  25.47 
 
 		 531 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 526 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  25.29 
 
 		 631 aa  99  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  24.38 
 
 		 520 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  24.47 
 
 		 546 aa  98.6  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.96 
 
 		 524 aa  98.2  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5018  extracellular solute-binding protein family 5  25.94 
 
 		 526 aa  97.8  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0327585 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  24.32 
 
 		 557 aa  97.8  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  23.98 
 
 		 499 aa  97.4  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  23.82 
 
 		 517 aa  97.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 538 aa  97.1  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3049  extracellular solute-binding protein family 5  24.78 
 
 		 503 aa  97.1  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>