More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4807 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4807  response regulator receiver protein  100 
 
 		 792 aa  1528    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0109  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 821 aa  385  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1310  response regulator receiver protein  27.19 
 
 		 834 aa  158  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.805154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1565  response regulator receiver protein  26.85 
 
 		 808 aa  138  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1365  response regulator receiver  26.85 
 
 		 808 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708627  normal  0.125949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3743  response regulator receiver protein  28.16 
 
 		 811 aa  109  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0276  response regulator receiver protein  27.99 
 
 		 809 aa  102  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2956  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.49 
 
 		 650 aa  100  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.34 
 
 		 651 aa  93.6  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.37 
 
 		 688 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0500187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  25.21 
 
 		 1164 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.21 
 
 		 1164 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5110  histidine kinase  28.65 
 
 		 558 aa  88.6  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  0.0814675 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5394  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  28.38 
 
 		 558 aa  88.6  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0211479 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2043  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 		 691 aa  88.2  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6354  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.73 
 
 		 699 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 		 927 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.26 
 
 		 951 aa  85.1  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.34 
 
 		 721 aa  83.2  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115994  normal  0.0775846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.18 
 
 		 660 aa  82  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.44 
 
 		 642 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.91 
 
 		 807 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.93 
 
 		 642 aa  77.4  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4603  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.27 
 
 		 783 aa  74.7  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2474  histidine kinase  27.03 
 
 		 559 aa  73.9  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.369133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3125  putative sensor/response regulator hybrid  24.66 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70953  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3591  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.82 
 
 		 650 aa  70.1  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2691  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.72 
 
 		 639 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.18 
 
 		 943 aa  68.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.36 
 
 		 681 aa  68.6  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.746553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.36 
 
 		 874 aa  67  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  23.48 
 
 		 622 aa  67  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0018  ATPase domain-containing protein  26.16 
 
 		 681 aa  67  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.434302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0038  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.34 
 
 		 681 aa  67  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0323591 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.48 
 
 		 622 aa  67  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  25.14 
 
 		 812 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4430  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.36 
 
 		 571 aa  66.6  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5576  histidine kinase  25.69 
 
 		 529 aa  65.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0252292 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  20.6 
 
 		 953 aa  65.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.8 
 
 		 766 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.47 
 
 		 1215 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.01 
 
 		 696 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.22 
 
 		 701 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2780  histidine kinase  27.52 
 
 		 558 aa  65.5  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.27 
 
 		 628 aa  65.1  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36420  putative sensor/response regulator hybrid  24.42 
 
 		 699 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2357  histidine kinase  24.62 
 
 		 533 aa  64.3  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0826278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.46 
 
 		 655 aa  63.9  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0134  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.72 
 
 		 682 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.574481  normal  0.0374693 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.11 
 
 		 795 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.477207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48160  putative sensor/response regulator hybrid  26.24 
 
 		 858 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  24 
 
 		 646 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  23.67 
 
 		 678 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  24 
 
 		 646 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.14 
 
 		 551 aa  61.6  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2172  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.9 
 
 		 658 aa  61.6  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.62 
 
 		 702 aa  61.6  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.14 
 
 		 508 aa  61.2  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.14 
 
 		 653 aa  60.8  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  24.93 
 
 		 701 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.32 
 
 		 1076 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0930  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.63 
 
 		 736 aa  60.1  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.165473  normal  0.215499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.93 
 
 		 1381 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.15 
 
 		 643 aa  59.7  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4234  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 761 aa  59.3  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.86 
 
 		 966 aa  58.9  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.86 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2229  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.51 
 
 		 553 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.638317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.18 
 
 		 703 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3901  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 		 661 aa  57.8  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0390399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0542  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.27 
 
 		 1050 aa  58.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.757487  normal  0.763027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.49 
 
 		 864 aa  57.8  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  23.03 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.94 
 
 		 622 aa  57.8  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.2 
 
 		 889 aa  57.8  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  24.53 
 
 		 936 aa  57.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  25.66 
 
 		 695 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  25.36 
 
 		 695 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.57 
 
 		 1053 aa  57.4  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.52 
 
 		 845 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.85 
 
 		 1105 aa  56.6  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4235  sensor histidine kinase  29.78 
 
 		 754 aa  56.6  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507157  normal  0.848747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.41 
 
 		 766 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.73 
 
 		 926 aa  55.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 		 573 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.49 
 
 		 1095 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2057  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.68 
 
 		 774 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.906607  hitchhiker  0.00133985 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1228  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.4 
 
 		 769 aa  55.1  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30700  putative sensor/response regulator hybrid  35.48 
 
 		 992 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.716544  hitchhiker  0.000396049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.13 
 
 		 673 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1031  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.37 
 
 		 689 aa  55.1  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.09 
 
 		 743 aa  54.7  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3223  histidine kinase  29.61 
 
 		 594 aa  54.7  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00047761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.29 
 
 		 859 aa  54.7  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1998  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 120 aa  54.7  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000230643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  24.27 
 
 		 847 aa  54.7  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.57 
 
 		 796 aa  54.3  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3589  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.07 
 
 		 652 aa  54.3  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.74 
 
 		 853 aa  54.3  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4110  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 126 aa  54.3  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>