More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0109 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0109  response regulator receiver protein  100 
 
 
821 aa  1562    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4807  response regulator receiver protein  40.77 
 
 
792 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1565  response regulator receiver protein  33.21 
 
 
808 aa  244  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1365  response regulator receiver  33.16 
 
 
808 aa  244  6e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708627  normal  0.125949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3743  response regulator receiver protein  32.24 
 
 
811 aa  234  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1310  response regulator receiver protein  31.76 
 
 
834 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.805154  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0276  response regulator receiver protein  33.16 
 
 
809 aa  189  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.01 
 
 
660 aa  134  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4603  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.56 
 
 
783 aa  131  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.7 
 
 
651 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2043  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.13 
 
 
691 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10086  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 
927 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  26.06 
 
 
1164 aa  111  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.06 
 
 
1164 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.84 
 
 
707 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2956  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.7 
 
 
650 aa  108  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753222  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5394  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  28.3 
 
 
558 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0211479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 
688 aa  107  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0500187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6354  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.49 
 
 
699 aa  107  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2474  histidine kinase  28.57 
 
 
559 aa  107  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.369133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.51 
 
 
705 aa  107  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  26.4 
 
 
678 aa  106  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.04 
 
 
642 aa  104  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5110  histidine kinase  28.18 
 
 
558 aa  104  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  0.0814675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.45 
 
 
704 aa  104  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.4 
 
 
951 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  26.89 
 
 
695 aa  101  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.53 
 
 
628 aa  100  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5576  histidine kinase  27.4 
 
 
529 aa  100  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0252292 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.62 
 
 
721 aa  100  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115994  normal  0.0775846 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.55 
 
 
766 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.3 
 
 
695 aa  97.8  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.33 
 
 
642 aa  97.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750197  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.47 
 
 
899 aa  96.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.58 
 
 
1415 aa  96.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4430  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.8 
 
 
571 aa  96.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3208  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.32 
 
 
702 aa  95.5  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  26.69 
 
 
701 aa  94.7  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.44 
 
 
688 aa  94.4  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3591  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.81 
 
 
650 aa  94  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.28 
 
 
943 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4750  histidine kinase  27.99 
 
 
670 aa  93.2  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2108  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.49 
 
 
1014 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.659699  normal  0.848073 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.61 
 
 
795 aa  91.3  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36420  putative sensor/response regulator hybrid  26.48 
 
 
699 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426849  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.05 
 
 
622 aa  91.7  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3125  putative sensor/response regulator hybrid  27.07 
 
 
650 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70953  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.31 
 
 
943 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48160  putative sensor/response regulator hybrid  25.55 
 
 
858 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2251  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.58 
 
 
721 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0770498  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.4 
 
 
712 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.113069  normal  0.344517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.33 
 
 
696 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.18 
 
 
1013 aa  88.6  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.53 
 
 
944 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0092  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.45 
 
 
742 aa  88.2  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5223  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.72 
 
 
722 aa  88.2  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 
701 aa  87.8  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2691  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.35 
 
 
639 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.82 
 
 
581 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0247  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 
640 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.74 
 
 
1426 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.33 
 
 
1011 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.4 
 
 
821 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2057  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.84 
 
 
774 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.906607  hitchhiker  0.00133985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.89 
 
 
703 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  25.07 
 
 
1427 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.93 
 
 
508 aa  86.7  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  27.45 
 
 
1299 aa  86.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 
688 aa  86.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121998  normal  0.468356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.95 
 
 
1076 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.7 
 
 
653 aa  85.9  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 
926 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.41 
 
 
822 aa  85.5  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1031  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.23 
 
 
689 aa  85.1  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.53 
 
 
692 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3343  histidine kinase  25.54 
 
 
632 aa  85.1  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.17 
 
 
814 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.72 
 
 
946 aa  84.7  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1929  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.6 
 
 
853 aa  84.7  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0225  PAS  26.78 
 
 
673 aa  84.3  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0508  histidine kinase  25.54 
 
 
632 aa  84.3  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4421  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.34 
 
 
783 aa  84.3  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.89 
 
 
822 aa  84.3  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.54 
 
 
809 aa  84.3  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4051  PAS sensor protein  28.34 
 
 
783 aa  84.3  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.688401  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4260  sensor histidine kinase/response regulator  22.01 
 
 
669 aa  83.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.58 
 
 
1215 aa  84  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  24.64 
 
 
622 aa  83.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.64 
 
 
622 aa  83.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0232  sensor histidine kinase  26.78 
 
 
716 aa  83.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786809  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.95 
 
 
837 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  24.73 
 
 
727 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4151  sensor histidine kinase/response regulator hybrid  26.06 
 
 
571 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.579562  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2780  histidine kinase  27.12 
 
 
558 aa  82.8  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1446  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.99 
 
 
811 aa  82.4  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  25.4 
 
 
892 aa  82.4  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.94 
 
 
795 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.477207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.1 
 
 
888 aa  82  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.89 
 
 
655 aa  82  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.65 
 
 
740 aa  82.4  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>