More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1365 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1565  response regulator receiver protein  99.13 
 
 		 808 aa  1558    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1365  response regulator receiver  100 
 
 		 808 aa  1569    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708627  normal  0.125949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3743  response regulator receiver protein  50.73 
 
 		 811 aa  654    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1310  response regulator receiver protein  80.94 
 
 		 834 aa  1190    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.805154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0276  response regulator receiver protein  48.41 
 
 		 809 aa  570  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0109  response regulator receiver protein  32.91 
 
 		 821 aa  210  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2043  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 		 691 aa  150  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4807  response regulator receiver protein  26.68 
 
 		 792 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 660 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 		 721 aa  145  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115994  normal  0.0775846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 		 653 aa  144  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  31.03 
 
 		 678 aa  144  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 		 766 aa  140  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4603  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 		 783 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3591  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 		 650 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2474  histidine kinase  33.59 
 
 		 559 aa  138  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.369133 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.37 
 
 		 651 aa  135  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6354  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 699 aa  134  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2691  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 		 639 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 		 642 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2057  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 		 774 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.906607  hitchhiker  0.00133985 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5576  histidine kinase  29.08 
 
 		 529 aa  126  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0252292 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 		 642 aa  126  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2956  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.46 
 
 		 650 aa  124  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.24 
 
 		 622 aa  124  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  30.24 
 
 		 622 aa  124  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 		 688 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0500187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  28.35 
 
 		 1164 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.35 
 
 		 1164 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 		 622 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36420  putative sensor/response regulator hybrid  27.84 
 
 		 699 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3125  putative sensor/response regulator hybrid  28.54 
 
 		 650 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70953  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 		 951 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48160  putative sensor/response regulator hybrid  29.89 
 
 		 858 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.53 
 
 		 701 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.64 
 
 		 927 aa  111  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5394  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  29.33 
 
 		 558 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0211479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  28.12 
 
 		 701 aa  110  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 		 628 aa  109  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 		 766 aa  110  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5110  histidine kinase  29.57 
 
 		 558 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  0.0814675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3860  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.72 
 
 		 520 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27 
 
 		 696 aa  102  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4151  sensor histidine kinase/response regulator hybrid  29.49 
 
 		 571 aa  102  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.579562  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.7 
 
 		 707 aa  101  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 		 720 aa  101  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3901  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 		 661 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0390399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0225  PAS  29.17 
 
 		 673 aa  98.6  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.06 
 
 		 705 aa  98.6  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5223  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 		 722 aa  98.6  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  25.94 
 
 		 676 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.07 
 
 		 688 aa  97.8  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121998  normal  0.468356 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6621  histidine kinase  28.92 
 
 		 552 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 688 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2251  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.03 
 
 		 721 aa  95.5  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0770498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2780  histidine kinase  29.82 
 
 		 558 aa  95.5  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 		 622 aa  94  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 		 548 aa  94.4  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3208  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.95 
 
 		 702 aa  93.2  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.88 
 
 		 837 aa  92.8  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3375  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.54 
 
 		 714 aa  92  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.84 
 
 		 899 aa  92  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  25.34 
 
 		 695 aa  92  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2610  histidine kinase  28.92 
 
 		 552 aa  91.3  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 712 aa  91.3  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.113069  normal  0.344517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  28.65 
 
 		 573 aa  91.3  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.21 
 
 		 943 aa  91.3  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.16 
 
 		 1011 aa  91.3  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0232  sensor histidine kinase  26.29 
 
 		 716 aa  90.9  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3343  histidine kinase  27.62 
 
 		 632 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0137  sensory box histidine kinase/response regulator  28.15 
 
 		 611 aa  89.7  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.51 
 
 		 704 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1307  sensory box histidine kinase/response regulator  28.15 
 
 		 611 aa  89.7  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 		 1415 aa  89.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.07 
 
 		 695 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4430  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.46 
 
 		 571 aa  88.6  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0163  sensory box histidine kinase/response regulator  27.9 
 
 		 611 aa  88.6  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  25.67 
 
 		 1065 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.43 
 
 		 1067 aa  88.6  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.02 
 
 		 944 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1041  sensory box histidine kinase/response regulator  27.9 
 
 		 611 aa  88.2  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.04 
 
 		 946 aa  88.2  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2778  Signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 611 aa  88.2  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2635  sensory box histidine kinase/response regulator  27.9 
 
 		 611 aa  88.2  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.68 
 
 		 551 aa  87.4  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.5 
 
 		 732 aa  87  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.51 
 
 		 827 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.6 
 
 		 588 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0474386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0508  histidine kinase  27.93 
 
 		 632 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.7 
 
 		 785 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2108  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.82 
 
 		 1014 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.659699  normal  0.848073 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  24.14 
 
 		 676 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.01 
 
 		 662 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1835  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.14 
 
 		 782 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  27.15 
 
 		 1427 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  27.96 
 
 		 571 aa  86.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.52 
 
 		 926 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.36 
 
 		 789 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.36 
 
 		 789 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.54 
 
 		 1013 aa  85.5  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>