More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1210 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  100 
 
 		 412 aa  839    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  100 
 
 		 412 aa  839    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  90.75 
 
 		 412 aa  759    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  63.58 
 
 		 457 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  67.53 
 
 		 385 aa  435  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4394  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  63.26 
 
 		 394 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1176  NADH dehydrogenase subunit E  43.86 
 
 		 395 aa  299  5e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2395  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  65.37 
 
 		 222 aa  275  7e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0717093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  64.82 
 
 		 264 aa  271  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4629  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  62.56 
 
 		 229 aa  262  8.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3222  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  59.8 
 
 		 208 aa  246  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.237944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2003  NADH dehydrogenase subunit E  61.11 
 
 		 303 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2831  NADH dehydrogenase subunit E  58.1 
 
 		 228 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147014  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1313  NADH dehydrogenase subunit E  59.09 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0324148  normal  0.032376 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  58.08 
 
 		 398 aa  230  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1883  NADH dehydrogenase subunit E  54.72 
 
 		 250 aa  228  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3295  NADH dehydrogenase subunit E  58.29 
 
 		 249 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2577  NADH dehydrogenase subunit E  58.29 
 
 		 249 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251247  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1178  NADH dehydrogenase subunit E  58.59 
 
 		 303 aa  225  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2516  NADH dehydrogenase subunit E  58.59 
 
 		 303 aa  225  9e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4558  NADH dehydrogenase subunit E  57.64 
 
 		 203 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2882  NADH dehydrogenase subunit E  57.79 
 
 		 249 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2406  NADH dehydrogenase subunit E  55.78 
 
 		 265 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979437 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2216  NADH dehydrogenase subunit E  54.27 
 
 		 228 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2246  NADH dehydrogenase subunit E  52.65 
 
 		 239 aa  214  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0214593  normal  0.111261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1026  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  55.56 
 
 		 345 aa  212  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1359  NADH dehydrogenase subunit E  53.55 
 
 		 221 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.127402  normal  0.0368394 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1717  NADH dehydrogenase subunit E  54.9 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  54.46 
 
 		 385 aa  206  9e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0806  NADH dehydrogenase subunit E  53.99 
 
 		 237 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0801  NADH dehydrogenase subunit E  53.99 
 
 		 237 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0782  NADH dehydrogenase subunit E  53.92 
 
 		 225 aa  202  9e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.916923  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0893  NADH dehydrogenase subunit E  53.23 
 
 		 273 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2986  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  50 
 
 		 229 aa  189  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0736686  normal  0.383268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1306  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  52.36 
 
 		 222 aa  187  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  0.728232 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2296  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.5 
 
 		 222 aa  184  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  52.11 
 
 		 208 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  47.87 
 
 		 249 aa  177  4e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  45.15 
 
 		 260 aa  176  6e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  49.69 
 
 		 166 aa  173  5.999999999999999e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  47.47 
 
 		 180 aa  159  1e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  44.1 
 
 		 270 aa  158  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  43.26 
 
 		 181 aa  157  2e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.43 
 
 		 170 aa  154  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  43.72 
 
 		 239 aa  152  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0925  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.28 
 
 		 203 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  45.35 
 
 		 181 aa  147  4.0000000000000006e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.33 
 
 		 216 aa  146  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103945  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.51 
 
 		 165 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  47.22 
 
 		 174 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.51 
 
 		 161 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  47.22 
 
 		 174 aa  134  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_7050  predicted protein  40.33 
 
 		 217 aa  133  6.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000378621  hitchhiker  0.000000494703 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  46.85 
 
 		 175 aa  132  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  48.59 
 
 		 163 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1378  NADH dehydrogenase I chain E  41.46 
 
 		 177 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.41658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  48.59 
 
 		 163 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.64 
 
 		 166 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.75 
 
 		 176 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.68 
 
 		 166 aa  127  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0821  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.76 
 
 		 164 aa  126  9e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.452585  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  44.68 
 
 		 155 aa  124  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2156  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.8 
 
 		 224 aa  124  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  44.68 
 
 		 155 aa  123  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.67 
 
 		 168 aa  123  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1761  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.27 
 
 		 170 aa  123  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.39 
 
 		 170 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3083  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.38 
 
 		 174 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  45.21 
 
 		 168 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  41.1 
 
 		 158 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.14 
 
 		 174 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.21 
 
 		 230 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0273  NADH dehydrogenase subunit E  44.44 
 
 		 175 aa  114  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.55 
 
 		 176 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0244  NADH dehydrogenase subunit E  44.44 
 
 		 175 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.97 
 
 		 174 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1960  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.71 
 
 		 165 aa  113  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0953  NADH dehydrogenase subunit E  40 
 
 		 157 aa  112  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.544073 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.22 
 
 		 169 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  40.26 
 
 		 239 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  36.02 
 
 		 262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.69 
 
 		 159 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0992  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.5 
 
 		 161 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1278  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  34.76 
 
 		 230 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.468909 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01291  NADH dehydrogenase subunit E  43.75 
 
 		 175 aa  109  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17741  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  36.65 
 
 		 273 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3827  hypothetical protein  62.34 
 
 		 253 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.290909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4459  NADH dehydrogenase subunit E  35.44 
 
 		 305 aa  106  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2827  NADH dehydrogenase subunit E  41.67 
 
 		 175 aa  106  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.169197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0733  NADH dehydrogenase subunit E  41.89 
 
 		 161 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1825  NADH dehydrogenase subunit E  41.89 
 
 		 161 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1439  NADH dehydrogenase subunit E  41.89 
 
 		 161 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0487171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1303  NADH dehydrogenase subunit E  41.89 
 
 		 161 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1065  NADH dehydrogenase subunit E  41.89 
 
 		 161 aa  106  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.331293  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0417  NADH dehydrogenase subunit E  41.89 
 
 		 161 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1134  NADH dehydrogenase subunit E  41.89 
 
 		 161 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0930546  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1294  NADH dehydrogenase subunit E  41.89 
 
 		 161 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1505  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.4 
 
 		 175 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00485138 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1279  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.5 
 
 		 183 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1881  NADH dehydrogenase subunit E  38.36 
 
 		 253 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>