More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4629 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4629  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  100 
 
 
229 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  68.21 
 
 
264 aa  278  4e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  65.02 
 
 
385 aa  275  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2395  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  65.82 
 
 
222 aa  274  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0717093  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  64.04 
 
 
457 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  64.04 
 
 
412 aa  271  6e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4394  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  63.05 
 
 
394 aa  267  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3222  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  63.96 
 
 
208 aa  263  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.237944  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  62.56 
 
 
412 aa  263  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  62.56 
 
 
412 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1359  NADH dehydrogenase subunit E  58.05 
 
 
221 aa  248  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.127402  normal  0.0368394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2831  NADH dehydrogenase subunit E  58.94 
 
 
228 aa  239  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147014  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2406  NADH dehydrogenase subunit E  62 
 
 
265 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3295  NADH dehydrogenase subunit E  55.26 
 
 
249 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4558  NADH dehydrogenase subunit E  60.2 
 
 
203 aa  231  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1883  NADH dehydrogenase subunit E  59.61 
 
 
250 aa  229  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  56.85 
 
 
398 aa  228  6e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2216  NADH dehydrogenase subunit E  58.62 
 
 
228 aa  225  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2882  NADH dehydrogenase subunit E  54.42 
 
 
249 aa  224  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2577  NADH dehydrogenase subunit E  58.29 
 
 
249 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251247  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1313  NADH dehydrogenase subunit E  56.85 
 
 
402 aa  218  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0324148  normal  0.032376 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1176  NADH dehydrogenase subunit E  54.27 
 
 
395 aa  209  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2986  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  55.79 
 
 
229 aa  208  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0736686  normal  0.383268 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1178  NADH dehydrogenase subunit E  54.31 
 
 
303 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2516  NADH dehydrogenase subunit E  54.31 
 
 
303 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2003  NADH dehydrogenase subunit E  54.31 
 
 
303 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277346  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0806  NADH dehydrogenase subunit E  54.59 
 
 
237 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0801  NADH dehydrogenase subunit E  54.59 
 
 
237 aa  206  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2246  NADH dehydrogenase subunit E  54.31 
 
 
239 aa  205  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0214593  normal  0.111261 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  54.59 
 
 
385 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0782  NADH dehydrogenase subunit E  55.22 
 
 
225 aa  204  1e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.916923  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0893  NADH dehydrogenase subunit E  50.85 
 
 
273 aa  201  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58748  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1356  NADH dehydrogenase subunit E  51.07 
 
 
388 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1264  NADH dehydrogenase subunit E  51.07 
 
 
388 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1717  NADH dehydrogenase subunit E  48.95 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1306  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  51.04 
 
 
222 aa  191  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  0.728232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1026  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  51.94 
 
 
345 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2296  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.89 
 
 
222 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  50.84 
 
 
260 aa  178  5.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  46.94 
 
 
208 aa  175  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  48.39 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.39 
 
 
216 aa  169  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103945  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0925  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  49.74 
 
 
203 aa  166  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  48.78 
 
 
166 aa  165  6.9999999999999995e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  44.67 
 
 
270 aa  155  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  42.02 
 
 
239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  48.3 
 
 
170 aa  151  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  44.51 
 
 
181 aa  150  2e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  47.74 
 
 
180 aa  149  3e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  45.51 
 
 
181 aa  149  4e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_7050  predicted protein  40.2 
 
 
217 aa  141  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000378621  hitchhiker  0.000000494703 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1378  NADH dehydrogenase I chain E  45.7 
 
 
177 aa  139  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.41658  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.84 
 
 
161 aa  136  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.51 
 
 
166 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.32 
 
 
170 aa  132  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  40.49 
 
 
174 aa  131  6.999999999999999e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  40.49 
 
 
174 aa  131  7.999999999999999e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.21 
 
 
176 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.46 
 
 
165 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.16 
 
 
166 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.75 
 
 
176 aa  118  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  42.55 
 
 
155 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  42.55 
 
 
155 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.55 
 
 
163 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.55 
 
 
163 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0821  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.36 
 
 
164 aa  116  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.452585  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.77 
 
 
169 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  36.63 
 
 
262 aa  115  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  35.5 
 
 
273 aa  114  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  36.53 
 
 
175 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.36 
 
 
168 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  38.61 
 
 
239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  41.38 
 
 
158 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1505  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.67 
 
 
175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00485138 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1428  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.74 
 
 
165 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464968  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1960  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.97 
 
 
165 aa  108  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1761  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.54 
 
 
170 aa  108  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3252  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.36 
 
 
166 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.85 
 
 
163 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1881  NADH dehydrogenase subunit E  36.42 
 
 
253 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.54783 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.85 
 
 
163 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1312  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.29 
 
 
160 aa  106  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2156  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.01 
 
 
224 aa  106  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4414  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.74 
 
 
240 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3506  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.65 
 
 
182 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0285  NADH-quinone oxidoreductase subunit E  36.65 
 
 
231 aa  104  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0271  NADH dehydrogenase subunit E  36.84 
 
 
269 aa  105  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42 
 
 
174 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4485  NADH dehydrogenase subunit E  37.5 
 
 
287 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256998  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0367  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.35 
 
 
208 aa  104  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.86 
 
 
230 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0273  NADH dehydrogenase subunit E  39.58 
 
 
175 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  37.42 
 
 
193 aa  103  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.945573 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0244  NADH dehydrogenase subunit E  39.58 
 
 
175 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03200  NADH dehydrogenase subunit E  33.16 
 
 
253 aa  102  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2827  NADH dehydrogenase subunit E  38.46 
 
 
175 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.169197  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.82 
 
 
159 aa  102  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0524  NADH dehydrogenase subunit E  34.97 
 
 
263 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13170  NADH dehydrogenase subunit E  33.33 
 
 
252 aa  101  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4459  NADH dehydrogenase subunit E  33.33 
 
 
305 aa  101  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>