More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0524 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0524  NADH dehydrogenase subunit E  100 
 
 
263 aa  537  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4414  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  62.4 
 
 
240 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  66.99 
 
 
248 aa  295  4e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.941311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0473  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  67.8 
 
 
302 aa  288  6e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  66.67 
 
 
239 aa  286  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  73.14 
 
 
228 aa  284  8e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0285  NADH-quinone oxidoreductase subunit E  66.01 
 
 
231 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3225  NADH dehydrogenase subunit E  55.56 
 
 
283 aa  276  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0065484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0588  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit- like protein  62.19 
 
 
219 aa  275  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0543  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  57.39 
 
 
269 aa  272  3e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  64.22 
 
 
294 aa  272  5.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07420  NADH dehydrogenase subunit E  58.77 
 
 
319 aa  271  7e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0368218 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0271  NADH dehydrogenase subunit E  63.82 
 
 
269 aa  271  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13170  NADH dehydrogenase subunit E  60.1 
 
 
252 aa  257  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4485  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
287 aa  244  8e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256998  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  54.95 
 
 
262 aa  239  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1881  NADH dehydrogenase subunit E  54.5 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.54783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  56.02 
 
 
273 aa  232  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1576  NADH dehydrogenase subunit E  51.81 
 
 
294 aa  232  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.685824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1600  NADH dehydrogenase subunit E  51.81 
 
 
294 aa  232  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.737975  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1546  NADH dehydrogenase subunit E  56.65 
 
 
294 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67963  normal  0.132733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4554  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  54.63 
 
 
341 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1278  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  54.84 
 
 
230 aa  226  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.468909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4061  NADH dehydrogenase subunit E  52.58 
 
 
317 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732889  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4459  NADH dehydrogenase subunit E  53.08 
 
 
305 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6678  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  50.86 
 
 
254 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03200  NADH dehydrogenase subunit E  52.09 
 
 
253 aa  217  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0978  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  52.61 
 
 
249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3172  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  60.48 
 
 
237 aa  211  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.37 
 
 
706 aa  205  7e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0367  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.9 
 
 
208 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.67 
 
 
165 aa  126  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1312  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.56 
 
 
160 aa  126  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.03 
 
 
170 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1873  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  39.49 
 
 
188 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.85 
 
 
161 aa  122  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1279  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.94 
 
 
183 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.18 
 
 
230 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2156  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.74 
 
 
224 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.14 
 
 
188 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  35.26 
 
 
166 aa  114  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.62 
 
 
174 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  40.62 
 
 
167 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.9 
 
 
174 aa  112  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0482  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.97 
 
 
162 aa  112  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  40 
 
 
167 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  40 
 
 
167 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  34.78 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3083  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.36 
 
 
174 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.03 
 
 
166 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4740  NADH dehydrogenase subunit E  39.38 
 
 
162 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.42 
 
 
169 aa  108  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1295  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  38 
 
 
160 aa  108  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  35.26 
 
 
175 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.19 
 
 
208 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1329  NADH dehydrogenase subunit E  42.34 
 
 
157 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116663  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0913  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.41 
 
 
203 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  34.59 
 
 
239 aa  108  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1350  NADH dehydrogenase subunit E  42.34 
 
 
157 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.150858 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  36.3 
 
 
162 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2703  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  38.46 
 
 
151 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  36.77 
 
 
158 aa  106  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0953  NADH dehydrogenase subunit E  38.46 
 
 
157 aa  106  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.544073 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1602  NADP-reducing hydrogenase chain A  36.6 
 
 
173 aa  105  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.77 
 
 
163 aa  105  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.77 
 
 
163 aa  105  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0338  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.67 
 
 
165 aa  105  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113802  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2236  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.55 
 
 
163 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.33 
 
 
170 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  37.2 
 
 
249 aa  105  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1153  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.48 
 
 
212 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  34.18 
 
 
181 aa  104  1e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4355  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.16 
 
 
171 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.16 
 
 
171 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0096  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.3 
 
 
162 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108902 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1636  NADP-reducing hydrogenase chain A  36.73 
 
 
172 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000374752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4200  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.16 
 
 
171 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2809  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.97 
 
 
165 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  37.18 
 
 
174 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.97 
 
 
264 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  37.18 
 
 
174 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1505  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.6 
 
 
175 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00485138 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.65 
 
 
163 aa  102  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.65 
 
 
163 aa  102  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3368  NADH dehydrogenase I, E subunit  36.76 
 
 
165 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1047  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.8 
 
 
168 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.48 
 
 
175 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.54 
 
 
176 aa  102  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2269  NADH dehydrogenase subunit E  36.71 
 
 
161 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128082  normal  0.14114 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.44 
 
 
176 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1633  NADH dehydrogenase subunit E  36.71 
 
 
161 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2245  NADH dehydrogenase subunit E  36.71 
 
 
161 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254081  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1428  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.4 
 
 
165 aa  102  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464968  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1347  NADH dehydrogenase subunit E  41.3 
 
 
161 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00701728  normal  0.0175389 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  33.33 
 
 
270 aa  102  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  34.51 
 
 
155 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  34.51 
 
 
155 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.55 
 
 
385 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5176  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.27 
 
 
163 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4629  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.97 
 
 
229 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.172215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>