More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1613 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  100 
 
 
193 aa  404  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.945573 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0482  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42 
 
 
162 aa  118  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.37 
 
 
176 aa  116  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.89 
 
 
170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  35.09 
 
 
239 aa  108  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1278  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  38.16 
 
 
230 aa  108  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.468909 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1393  formate dehydrogenase subunit gamma  38.93 
 
 
159 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  33.96 
 
 
273 aa  104  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  34.18 
 
 
262 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.18 
 
 
165 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_004310  BR0806  NADH dehydrogenase subunit E  34.73 
 
 
237 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4629  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.42 
 
 
229 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0801  NADH dehydrogenase subunit E  34.73 
 
 
237 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0911  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  35.37 
 
 
162 aa  102  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0933  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.37 
 
 
162 aa  102  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  33.13 
 
 
239 aa  100  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0029  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.29 
 
 
156 aa  99.8  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0588  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit- like protein  35.62 
 
 
219 aa  99.4  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0913  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.81 
 
 
203 aa  99.4  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0285  NADH-quinone oxidoreductase subunit E  33.95 
 
 
231 aa  99.4  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1873  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  37.68 
 
 
188 aa  98.2  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1279  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.42 
 
 
183 aa  97.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.94 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03200  NADH dehydrogenase subunit E  31.64 
 
 
253 aa  97.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  33.93 
 
 
385 aa  95.5  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4414  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.38 
 
 
240 aa  95.5  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2236  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  31.47 
 
 
163 aa  95.5  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1717  NADH dehydrogenase subunit E  35.63 
 
 
266 aa  95.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  31.1 
 
 
166 aa  94.7  6e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1858  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  32.86 
 
 
160 aa  94.7  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3292  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  34.51 
 
 
177 aa  94.7  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1026  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.13 
 
 
345 aa  94.7  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0553  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  38.97 
 
 
169 aa  94.7  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469844  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0271  NADH dehydrogenase subunit E  32.9 
 
 
269 aa  94.7  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.33 
 
 
294 aa  94.4  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0916  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.21 
 
 
162 aa  94  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0722  formate dehydrogenase subunit gamma  34.78 
 
 
156 aa  94.4  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3638  formate dehydrogenase subunit gamma  35 
 
 
159 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  39.1 
 
 
398 aa  92.8  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1264  NADH dehydrogenase subunit E  31.79 
 
 
388 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  29.61 
 
 
180 aa  92.4  4e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1356  NADH dehydrogenase subunit E  32.35 
 
 
388 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4912  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.27 
 
 
157 aa  92  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.317339  normal  0.210379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.08 
 
 
166 aa  92  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1312  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  30.19 
 
 
160 aa  92  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0473  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.71 
 
 
302 aa  92  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3351  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  35.51 
 
 
173 aa  91.7  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.044773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1706  formate dehydrogenase subunit gamma  35.29 
 
 
160 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.5 
 
 
248 aa  91.3  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.941311 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  29.78 
 
 
181 aa  91.3  7e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07420  NADH dehydrogenase subunit E  34.25 
 
 
319 aa  91.3  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0368218 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2296  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  30.41 
 
 
222 aa  91.3  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  30.19 
 
 
188 aa  91.3  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  35.86 
 
 
706 aa  91.3  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.77 
 
 
161 aa  90.5  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3172  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.5 
 
 
237 aa  90.9  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2899  formate dehydrogenase subunit gamma  32.39 
 
 
159 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4061  NADH dehydrogenase subunit E  32.05 
 
 
317 aa  90.5  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732889  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0342  NADH dehydrogenase I, E subunit  34.06 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.702916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2986  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  30.6 
 
 
229 aa  90.1  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0736686  normal  0.383268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4558  NADH dehydrogenase subunit E  36.09 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4022  formate dehydrogenase subunit gamma  35.46 
 
 
163 aa  89.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0833  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit  30.38 
 
 
163 aa  90.1  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4867  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  33.33 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00194122 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3225  NADH dehydrogenase subunit E  34.59 
 
 
283 aa  89.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0065484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.75 
 
 
385 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4394  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.63 
 
 
394 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0338  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.57 
 
 
165 aa  90.1  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113802  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4404  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  33.33 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1807  formate dehydrogenase subunit gamma  35.29 
 
 
160 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24583  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4459  NADH dehydrogenase subunit E  31.71 
 
 
305 aa  89.4  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3927  formate dehydrogenase subunit gamma  34.31 
 
 
159 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1313  NADH dehydrogenase subunit E  35.15 
 
 
402 aa  89.4  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0324148  normal  0.032376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3654  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.81 
 
 
161 aa  89.4  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1881  NADH dehydrogenase subunit E  31.11 
 
 
253 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.54783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2385  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  34.25 
 
 
156 aa  89.4  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.708436  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2183  formate dehydrogenase subunit gamma  33.82 
 
 
160 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.124709  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0803  formate dehydrogenase subunit gamma  31.47 
 
 
156 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0625  formate dehydrogenase subunit gamma  33.57 
 
 
156 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3481  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  31.39 
 
 
176 aa  89  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3554  formate dehydrogenase subunit gamma  33.82 
 
 
160 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0543  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  30.51 
 
 
269 aa  88.6  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0988  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  31.48 
 
 
157 aa  88.6  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0524  NADH dehydrogenase subunit E  32.92 
 
 
263 aa  88.6  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2560  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  33.33 
 
 
167 aa  88.2  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125635  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.65 
 
 
170 aa  88.2  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3134  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  32.86 
 
 
171 aa  87.8  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0282366  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0782  NADH dehydrogenase subunit E  32.4 
 
 
225 aa  87.8  9e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.916923  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13170  NADH dehydrogenase subunit E  29.24 
 
 
252 aa  87  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.33 
 
 
228 aa  87  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02960  NADH dehydrogenase I subunit E  34.53 
 
 
136 aa  87  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  31.29 
 
 
264 aa  87  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4240  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  34.57 
 
 
168 aa  87  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0617  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  34.29 
 
 
179 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390132  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2752  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  33.82 
 
 
173 aa  87  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0899324 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2216  NADH dehydrogenase subunit E  34.3 
 
 
228 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01790  NADH dehydrogenase I subunit E  31.21 
 
 
167 aa  87  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  30.22 
 
 
162 aa  86.7  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0558  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.25 
 
 
161 aa  86.3  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.808339  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2246  NADH dehydrogenase subunit E  33.53 
 
 
239 aa  86.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0214593  normal  0.111261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>