More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4459 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4459  NADH dehydrogenase subunit E  100 
 
 
305 aa  620  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4061  NADH dehydrogenase subunit E  92.79 
 
 
317 aa  511  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732889  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1278  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  61.67 
 
 
230 aa  305  8.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.468909 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  65.09 
 
 
262 aa  285  9e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  61.95 
 
 
273 aa  279  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07420  NADH dehydrogenase subunit E  52.3 
 
 
319 aa  261  8.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0368218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  59.11 
 
 
294 aa  259  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4554  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  59.46 
 
 
341 aa  256  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0473  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  59.8 
 
 
302 aa  248  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0285  NADH-quinone oxidoreductase subunit E  59.07 
 
 
231 aa  247  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  59.45 
 
 
239 aa  246  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13170  NADH dehydrogenase subunit E  58.62 
 
 
252 aa  245  8e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  55.98 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.941311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4414  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  53.09 
 
 
240 aa  241  9e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1881  NADH dehydrogenase subunit E  54.35 
 
 
253 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.54783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0588  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit- like protein  54.63 
 
 
219 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4485  NADH dehydrogenase subunit E  57.77 
 
 
287 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256998  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  63.79 
 
 
228 aa  235  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3225  NADH dehydrogenase subunit E  58.02 
 
 
283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0065484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0978  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  56.54 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6678  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  55.61 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03200  NADH dehydrogenase subunit E  52.36 
 
 
253 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0271  NADH dehydrogenase subunit E  55.24 
 
 
269 aa  229  5e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1546  NADH dehydrogenase subunit E  56.46 
 
 
294 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67963  normal  0.132733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1576  NADH dehydrogenase subunit E  55.98 
 
 
294 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.685824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1600  NADH dehydrogenase subunit E  55.98 
 
 
294 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.737975  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0524  NADH dehydrogenase subunit E  53.08 
 
 
263 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0543  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.04 
 
 
269 aa  224  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3172  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  57.51 
 
 
237 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.12 
 
 
706 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  37.43 
 
 
239 aa  135  8e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.29 
 
 
170 aa  133  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  38.31 
 
 
166 aa  131  1.0000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.85 
 
 
165 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0367  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.86 
 
 
208 aa  130  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  38.18 
 
 
249 aa  127  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  44.12 
 
 
167 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  44.85 
 
 
167 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.22 
 
 
170 aa  122  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  32.54 
 
 
260 aa  122  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  44.12 
 
 
167 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_7050  predicted protein  37.43 
 
 
217 aa  122  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000378621  hitchhiker  0.000000494703 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  36.31 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.44 
 
 
161 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.51 
 
 
163 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.51 
 
 
163 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.21 
 
 
166 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3252  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.34 
 
 
166 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1312  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.11 
 
 
160 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  35.8 
 
 
180 aa  119  7e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  37.04 
 
 
208 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.69 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5176  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.65 
 
 
163 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  38.46 
 
 
181 aa  117  3e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  33.97 
 
 
181 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0965  NADH dehydrogenase subunit E  42.03 
 
 
168 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489365  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.19 
 
 
188 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0931  NADH dehydrogenase subunit E  38.75 
 
 
168 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2809  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.13 
 
 
165 aa  113  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2831  NADH dehydrogenase subunit E  34.36 
 
 
228 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147014  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.85 
 
 
385 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3083  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.82 
 
 
174 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  39.71 
 
 
158 aa  112  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.46 
 
 
175 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  36.08 
 
 
175 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1428  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.15 
 
 
165 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464968  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  36.81 
 
 
174 aa  111  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.66 
 
 
174 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1497  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.71 
 
 
162 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.358345  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.06 
 
 
176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.01 
 
 
174 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.82 
 
 
163 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.82 
 
 
163 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  36.11 
 
 
174 aa  110  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0953  NADH dehydrogenase subunit E  41.18 
 
 
157 aa  109  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.544073 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1047  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.5 
 
 
168 aa  109  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.44 
 
 
412 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2986  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.53 
 
 
229 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0736686  normal  0.383268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.44 
 
 
412 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1306  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.33 
 
 
222 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  0.728232 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1176  NADH dehydrogenase subunit E  30.06 
 
 
395 aa  106  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1873  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  38.52 
 
 
188 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4355  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.81 
 
 
171 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.81 
 
 
171 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4200  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.81 
 
 
171 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.59 
 
 
412 aa  105  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0913  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.9 
 
 
203 aa  105  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  37.75 
 
 
155 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4558  NADH dehydrogenase subunit E  35.98 
 
 
203 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2269  NADH dehydrogenase subunit E  41.27 
 
 
161 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128082  normal  0.14114 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2005  NADH dehydrogenase subunit E  40.48 
 
 
161 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583559  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1633  NADH dehydrogenase subunit E  41.27 
 
 
161 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1347  NADH dehydrogenase subunit E  40.48 
 
 
161 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00701728  normal  0.0175389 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2245  NADH dehydrogenase subunit E  41.27 
 
 
161 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254081  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1746  NADH dehydrogenase subunit E  38.97 
 
 
159 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2246  NADH dehydrogenase subunit E  29.45 
 
 
239 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0214593  normal  0.111261 
 
 
-
 
NC_004310  BR0806  NADH dehydrogenase subunit E  32.35 
 
 
237 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2156  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.58 
 
 
224 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1505  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.65 
 
 
175 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00485138 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0801  NADH dehydrogenase subunit E  32.35 
 
 
237 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>