More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3222 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3222  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  100 
 
 
208 aa  435  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.237944  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  61.65 
 
 
264 aa  263  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4629  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  63.96 
 
 
229 aa  263  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  61.81 
 
 
385 aa  261  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4394  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  61.81 
 
 
394 aa  255  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2395  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  59.71 
 
 
222 aa  253  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0717093  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4558  NADH dehydrogenase subunit E  64.82 
 
 
203 aa  248  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  60.3 
 
 
412 aa  248  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  59.8 
 
 
412 aa  247  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  59.8 
 
 
412 aa  247  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2003  NADH dehydrogenase subunit E  61.81 
 
 
303 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277346  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  61.31 
 
 
457 aa  246  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  59.9 
 
 
398 aa  245  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1178  NADH dehydrogenase subunit E  60.3 
 
 
303 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2516  NADH dehydrogenase subunit E  60.3 
 
 
303 aa  244  8e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1313  NADH dehydrogenase subunit E  61.22 
 
 
402 aa  243  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0324148  normal  0.032376 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2882  NADH dehydrogenase subunit E  60.1 
 
 
249 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2216  NADH dehydrogenase subunit E  59.05 
 
 
228 aa  240  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1176  NADH dehydrogenase subunit E  61.73 
 
 
395 aa  239  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1359  NADH dehydrogenase subunit E  59.79 
 
 
221 aa  237  8e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.127402  normal  0.0368394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3295  NADH dehydrogenase subunit E  60.59 
 
 
249 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1883  NADH dehydrogenase subunit E  58.1 
 
 
250 aa  235  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2577  NADH dehydrogenase subunit E  58.22 
 
 
249 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251247  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2406  NADH dehydrogenase subunit E  58.13 
 
 
265 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979437 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2246  NADH dehydrogenase subunit E  56.57 
 
 
239 aa  229  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0214593  normal  0.111261 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0893  NADH dehydrogenase subunit E  57.49 
 
 
273 aa  225  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58748  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0782  NADH dehydrogenase subunit E  56.65 
 
 
225 aa  224  1e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.916923  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1717  NADH dehydrogenase subunit E  57.92 
 
 
266 aa  218  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  55.61 
 
 
385 aa  216  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2831  NADH dehydrogenase subunit E  56.06 
 
 
228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147014  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_004310  BR0806  NADH dehydrogenase subunit E  55.94 
 
 
237 aa  214  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0801  NADH dehydrogenase subunit E  55.94 
 
 
237 aa  214  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1356  NADH dehydrogenase subunit E  56.16 
 
 
388 aa  214  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1264  NADH dehydrogenase subunit E  55.67 
 
 
388 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1026  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  55.17 
 
 
345 aa  210  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1306  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  54.74 
 
 
222 aa  206  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  0.728232 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2986  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  52.58 
 
 
229 aa  198  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0736686  normal  0.383268 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2296  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.66 
 
 
222 aa  195  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  46.97 
 
 
208 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
181 aa  176  2e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.62 
 
 
216 aa  174  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103945  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  45.45 
 
 
249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0925  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  49.5 
 
 
203 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  50.31 
 
 
166 aa  169  2e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  43.88 
 
 
260 aa  166  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  43.1 
 
 
180 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  42.38 
 
 
270 aa  156  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  42.07 
 
 
181 aa  156  2e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  42.19 
 
 
239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.59 
 
 
170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.38 
 
 
165 aa  138  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1378  NADH dehydrogenase I chain E  39.61 
 
 
177 aa  132  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.41658  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.04 
 
 
161 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_7050  predicted protein  40.22 
 
 
217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000378621  hitchhiker  0.000000494703 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.26 
 
 
163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.26 
 
 
163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.27 
 
 
176 aa  122  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  40.65 
 
 
239 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.24 
 
 
166 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  37.33 
 
 
174 aa  115  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  37.33 
 
 
174 aa  115  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  42.14 
 
 
155 aa  115  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  42.14 
 
 
155 aa  115  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.19 
 
 
166 aa  112  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.14 
 
 
170 aa  111  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0821  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.42 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.452585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1347  NADH dehydrogenase subunit E  41.73 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00701728  normal  0.0175389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1153  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  38.67 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0733  NADH dehydrogenase subunit E  42.45 
 
 
161 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1134  NADH dehydrogenase subunit E  42.45 
 
 
161 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0930546  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1825  NADH dehydrogenase subunit E  42.45 
 
 
161 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1439  NADH dehydrogenase subunit E  42.45 
 
 
161 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0487171  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0417  NADH dehydrogenase subunit E  42.45 
 
 
161 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1303  NADH dehydrogenase subunit E  42.45 
 
 
161 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1065  NADH dehydrogenase subunit E  42.45 
 
 
161 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.331293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1294  NADH dehydrogenase subunit E  42.45 
 
 
161 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.74 
 
 
188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.47 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0367  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.36 
 
 
208 aa  108  5e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3210  NADH dehydrogenase subunit E  41.01 
 
 
161 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1278  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  32.93 
 
 
230 aa  108  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.468909 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1505  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.85 
 
 
175 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00485138 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  34.52 
 
 
175 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  39.71 
 
 
158 aa  106  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  34.13 
 
 
262 aa  106  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1279  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.97 
 
 
183 aa  106  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1032  NADH dehydrogenase subunit E  40.29 
 
 
161 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0249192  normal  0.0947418 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0271  NADH dehydrogenase subunit E  36.94 
 
 
269 aa  106  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0244  NADH dehydrogenase subunit E  37.28 
 
 
175 aa  105  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0273  NADH dehydrogenase subunit E  37.28 
 
 
175 aa  105  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0285  NADH-quinone oxidoreductase subunit E  37.5 
 
 
231 aa  105  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4485  NADH dehydrogenase subunit E  39.74 
 
 
287 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256998  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.9 
 
 
248 aa  104  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.941311 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5573  NADH dehydrogenase subunit E  39.57 
 
 
161 aa  104  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0826314  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2162  NADH dehydrogenase subunit E  39.57 
 
 
161 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1633  NADH dehydrogenase subunit E  39.57 
 
 
161 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2283  NADH dehydrogenase subunit E  39.57 
 
 
161 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960667  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2245  NADH dehydrogenase subunit E  39.57 
 
 
161 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254081  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.81 
 
 
176 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2269  NADH dehydrogenase subunit E  39.57 
 
 
161 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128082  normal  0.14114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>