More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1347 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1347  NADH dehydrogenase subunit E  100 
 
 
161 aa  335  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00701728  normal  0.0175389 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3210  NADH dehydrogenase subunit E  98.76 
 
 
161 aa  332  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2005  NADH dehydrogenase subunit E  95.65 
 
 
161 aa  324  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583559  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5573  NADH dehydrogenase subunit E  90.06 
 
 
161 aa  308  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0826314  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2283  NADH dehydrogenase subunit E  89.44 
 
 
161 aa  306  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960667  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2162  NADH dehydrogenase subunit E  89.44 
 
 
161 aa  306  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2269  NADH dehydrogenase subunit E  89.44 
 
 
161 aa  306  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128082  normal  0.14114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1633  NADH dehydrogenase subunit E  89.44 
 
 
161 aa  306  9e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2245  NADH dehydrogenase subunit E  89.44 
 
 
161 aa  306  9e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1294  NADH dehydrogenase subunit E  88.2 
 
 
161 aa  305  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1825  NADH dehydrogenase subunit E  88.2 
 
 
161 aa  305  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1439  NADH dehydrogenase subunit E  88.2 
 
 
161 aa  305  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0487171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1303  NADH dehydrogenase subunit E  88.2 
 
 
161 aa  305  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1065  NADH dehydrogenase subunit E  88.2 
 
 
161 aa  305  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.331293  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0417  NADH dehydrogenase subunit E  88.2 
 
 
161 aa  305  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1134  NADH dehydrogenase subunit E  88.2 
 
 
161 aa  305  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0930546  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0733  NADH dehydrogenase subunit E  88.2 
 
 
161 aa  305  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1032  NADH dehydrogenase subunit E  88.2 
 
 
161 aa  304  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0249192  normal  0.0947418 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  72.67 
 
 
158 aa  247  5e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0931  NADH dehydrogenase subunit E  74.21 
 
 
168 aa  247  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  71.7 
 
 
167 aa  244  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0965  NADH dehydrogenase subunit E  72.33 
 
 
168 aa  243  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489365  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  70.44 
 
 
167 aa  242  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  70.44 
 
 
167 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1746  NADH dehydrogenase subunit E  67.08 
 
 
159 aa  229  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0953  NADH dehydrogenase subunit E  65.19 
 
 
157 aa  216  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.544073 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  62.26 
 
 
168 aa  208  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1047  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  62.66 
 
 
168 aa  207  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0825  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  60.76 
 
 
167 aa  203  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3252  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  57.86 
 
 
166 aa  192  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  56.6 
 
 
163 aa  190  9e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  56.6 
 
 
163 aa  190  9e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  55.56 
 
 
159 aa  187  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1428  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  55.35 
 
 
165 aa  185  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464968  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1505  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  55.06 
 
 
175 aa  184  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00485138 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  53.42 
 
 
175 aa  184  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2809  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  54.04 
 
 
165 aa  179  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1497  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  55.35 
 
 
162 aa  179  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.358345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5176  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  52.83 
 
 
163 aa  178  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3506  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  54.25 
 
 
182 aa  174  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  51.61 
 
 
155 aa  164  5e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  51.61 
 
 
155 aa  163  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1407  putative NADH dehydrogenase I (chain E) oxidoreductase protein  49.32 
 
 
162 aa  159  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  49.38 
 
 
175 aa  159  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.54 
 
 
163 aa  153  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.54 
 
 
163 aa  153  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  47.44 
 
 
174 aa  151  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  46.79 
 
 
174 aa  149  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.06 
 
 
168 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.58 
 
 
176 aa  144  6e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.2 
 
 
166 aa  142  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.88 
 
 
165 aa  142  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0821  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.06 
 
 
164 aa  141  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.452585  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0273  NADH dehydrogenase subunit E  45.75 
 
 
175 aa  140  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0244  NADH dehydrogenase subunit E  45.75 
 
 
175 aa  141  5e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.43 
 
 
170 aa  137  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  43.4 
 
 
166 aa  135  2e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2827  NADH dehydrogenase subunit E  42.86 
 
 
175 aa  135  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.169197  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1960  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.86 
 
 
165 aa  134  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.4 
 
 
161 aa  133  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1761  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.21 
 
 
170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.12 
 
 
166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  45 
 
 
181 aa  130  6e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  43.48 
 
 
181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01291  NADH dehydrogenase subunit E  40.99 
 
 
175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17741  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.12 
 
 
188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  42.86 
 
 
239 aa  127  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2156  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  50.36 
 
 
224 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  46.04 
 
 
270 aa  126  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  45.71 
 
 
180 aa  123  9e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2296  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.96 
 
 
222 aa  122  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.36 
 
 
171 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4200  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.36 
 
 
171 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4355  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.36 
 
 
171 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1378  NADH dehydrogenase I chain E  40.76 
 
 
177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.41658  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  42.86 
 
 
249 aa  116  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3189  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.92 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42 
 
 
169 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0632  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.92 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1627  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.92 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  40.29 
 
 
208 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0992  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.63 
 
 
161 aa  115  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2986  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.07 
 
 
229 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0736686  normal  0.383268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.57 
 
 
264 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1306  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.12 
 
 
222 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  0.728232 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2395  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.53 
 
 
222 aa  112  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0717093  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  42.14 
 
 
260 aa  111  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3222  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.73 
 
 
208 aa  110  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.237944  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2831  NADH dehydrogenase subunit E  43.26 
 
 
228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147014  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1873  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  35.53 
 
 
188 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  46.03 
 
 
262 aa  108  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1279  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.57 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.56 
 
 
174 aa  107  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.19 
 
 
385 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.75 
 
 
176 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1359  NADH dehydrogenase subunit E  38.71 
 
 
221 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.127402  normal  0.0368394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  42.86 
 
 
273 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4394  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.71 
 
 
394 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.26 
 
 
170 aa  105  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.09 
 
 
412 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>