More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1176 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1176  NADH dehydrogenase subunit E  100 
 
 
395 aa  803    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1313  NADH dehydrogenase subunit E  63.22 
 
 
402 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0324148  normal  0.032376 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  62.09 
 
 
398 aa  481  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2003  NADH dehydrogenase subunit E  66.78 
 
 
303 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277346  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2516  NADH dehydrogenase subunit E  67.86 
 
 
303 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1178  NADH dehydrogenase subunit E  67.72 
 
 
303 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2246  NADH dehydrogenase subunit E  69.53 
 
 
239 aa  340  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0214593  normal  0.111261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.68 
 
 
412 aa  296  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.86 
 
 
412 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.86 
 
 
412 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.56 
 
 
457 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4558  NADH dehydrogenase subunit E  62.31 
 
 
203 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0893  NADH dehydrogenase subunit E  59.6 
 
 
273 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58748  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1883  NADH dehydrogenase subunit E  57.64 
 
 
250 aa  242  7.999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2406  NADH dehydrogenase subunit E  59.07 
 
 
265 aa  242  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979437 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2216  NADH dehydrogenase subunit E  57.92 
 
 
228 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3222  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  61.73 
 
 
208 aa  239  8e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.237944  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0801  NADH dehydrogenase subunit E  56.22 
 
 
237 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0806  NADH dehydrogenase subunit E  56.22 
 
 
237 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  59 
 
 
385 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  59.3 
 
 
385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3295  NADH dehydrogenase subunit E  58.38 
 
 
249 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2882  NADH dehydrogenase subunit E  57.36 
 
 
249 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  57.14 
 
 
264 aa  231  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1356  NADH dehydrogenase subunit E  57.29 
 
 
388 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0782  NADH dehydrogenase subunit E  57.07 
 
 
225 aa  229  8e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.916923  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1717  NADH dehydrogenase subunit E  58.42 
 
 
266 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1026  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  56.65 
 
 
345 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2577  NADH dehydrogenase subunit E  56.85 
 
 
249 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251247  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4394  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.18 
 
 
394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1264  NADH dehydrogenase subunit E  56.78 
 
 
388 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2831  NADH dehydrogenase subunit E  57.65 
 
 
228 aa  224  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147014  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2395  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  55.9 
 
 
222 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0717093  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4629  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  54.27 
 
 
229 aa  209  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1359  NADH dehydrogenase subunit E  50.26 
 
 
221 aa  196  9e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.127402  normal  0.0368394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2986  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.18 
 
 
229 aa  172  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0736686  normal  0.383268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  46.28 
 
 
208 aa  171  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  44.39 
 
 
249 aa  169  7e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44 
 
 
216 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103945  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1306  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.36 
 
 
222 aa  162  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  0.728232 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  45.4 
 
 
166 aa  159  1e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2296  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.35 
 
 
222 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  38.86 
 
 
270 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.03 
 
 
170 aa  143  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  38.04 
 
 
239 aa  140  3e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  38.73 
 
 
260 aa  139  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0925  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.31 
 
 
203 aa  135  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  39.63 
 
 
181 aa  130  3e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.76 
 
 
163 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1378  NADH dehydrogenase I chain E  40 
 
 
177 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.41658  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.76 
 
 
163 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  38.79 
 
 
180 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  40.12 
 
 
181 aa  127  4.0000000000000003e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.63 
 
 
165 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  71.62 
 
 
258 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.91 
 
 
161 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_7050  predicted protein  37.91 
 
 
217 aa  119  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000378621  hitchhiker  0.000000494703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.63 
 
 
166 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  38.78 
 
 
174 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  38.78 
 
 
174 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  39.74 
 
 
155 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  40.43 
 
 
155 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.41 
 
 
169 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  34.36 
 
 
273 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.24 
 
 
166 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.41 
 
 
170 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1279  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.84 
 
 
183 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0821  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.58 
 
 
164 aa  110  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.452585  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  42.4 
 
 
158 aa  109  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  34.52 
 
 
175 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  32.12 
 
 
262 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.11 
 
 
174 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  33.33 
 
 
239 aa  106  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.24 
 
 
176 aa  106  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.74 
 
 
174 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4459  NADH dehydrogenase subunit E  30.06 
 
 
305 aa  106  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1278  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  29.09 
 
 
230 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.468909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.43 
 
 
176 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.12 
 
 
159 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0244  NADH dehydrogenase subunit E  41.38 
 
 
175 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1881  NADH dehydrogenase subunit E  34.44 
 
 
253 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.54783 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0273  NADH dehydrogenase subunit E  41.38 
 
 
175 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1873  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  33.33 
 
 
188 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01291  NADH dehydrogenase subunit E  42.07 
 
 
175 aa  103  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17741  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1314  hypothetical protein  45.08 
 
 
239 aa  103  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0719888  normal  0.0263324 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0367  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35 
 
 
208 aa  102  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.77 
 
 
230 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1312  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.75 
 
 
160 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.81 
 
 
168 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4061  NADH dehydrogenase subunit E  29.01 
 
 
317 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732889  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2156  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.22 
 
 
224 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1761  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.89 
 
 
170 aa  102  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2827  NADH dehydrogenase subunit E  37.97 
 
 
175 aa  100  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.169197  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4485  NADH dehydrogenase subunit E  33.77 
 
 
287 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256998  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  35 
 
 
168 aa  98.2  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.59 
 
 
188 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1960  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.17 
 
 
165 aa  95.1  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1177  hypothetical protein  64.79 
 
 
250 aa  95.5  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0930686  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0913  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  30.18 
 
 
203 aa  94  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3083  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  30.43 
 
 
174 aa  92.8  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>