More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3083 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3083  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  100 
 
 
174 aa  352  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  61.49 
 
 
174 aa  215  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  60.34 
 
 
174 aa  212  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  61.63 
 
 
230 aa  211  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  40.97 
 
 
166 aa  136  1e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.47 
 
 
165 aa  134  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.24 
 
 
169 aa  134  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  36.52 
 
 
270 aa  127  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.71 
 
 
161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.79 
 
 
170 aa  124  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  40 
 
 
273 aa  124  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  39.75 
 
 
260 aa  121  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  39.74 
 
 
174 aa  121  4e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  39.74 
 
 
174 aa  121  4e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.97 
 
 
163 aa  120  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.97 
 
 
163 aa  120  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.38 
 
 
412 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.94 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.38 
 
 
412 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  34.23 
 
 
155 aa  118  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.5 
 
 
176 aa  117  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  34.46 
 
 
155 aa  117  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.12 
 
 
412 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2395  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.27 
 
 
222 aa  117  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0717093  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  36.25 
 
 
239 aa  117  7.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  35.03 
 
 
175 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  39.22 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2827  NADH dehydrogenase subunit E  39.49 
 
 
175 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.169197  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.12 
 
 
385 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4394  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.26 
 
 
394 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01291  NADH dehydrogenase subunit E  39.49 
 
 
175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17741  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1378  NADH dehydrogenase I chain E  37.24 
 
 
177 aa  114  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.41658  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.85 
 
 
166 aa  114  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  41.91 
 
 
158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2156  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40 
 
 
224 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0271  NADH dehydrogenase subunit E  41.38 
 
 
269 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  39.33 
 
 
168 aa  114  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  34.23 
 
 
181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.84 
 
 
264 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38 
 
 
170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4459  NADH dehydrogenase subunit E  37.82 
 
 
305 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1278  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  37.01 
 
 
230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.468909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4061  NADH dehydrogenase subunit E  36.69 
 
 
317 aa  112  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732889  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  34.93 
 
 
180 aa  112  3e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0273  NADH dehydrogenase subunit E  39.49 
 
 
175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0244  NADH dehydrogenase subunit E  39.49 
 
 
175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.9 
 
 
168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.69 
 
 
166 aa  111  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0524  NADH dehydrogenase subunit E  36.36 
 
 
263 aa  111  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  41.79 
 
 
181 aa  111  6e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0473  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.36 
 
 
302 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1960  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.67 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.53 
 
 
188 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  35.09 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.26 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4355  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.29 
 
 
171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.29 
 
 
171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4200  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.29 
 
 
171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1359  NADH dehydrogenase subunit E  36.26 
 
 
221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.127402  normal  0.0368394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4414  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.71 
 
 
240 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  35.09 
 
 
167 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2236  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.42 
 
 
163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07420  NADH dehydrogenase subunit E  39.6 
 
 
319 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0368218 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  34.5 
 
 
167 aa  107  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.04 
 
 
457 aa  107  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  35.8 
 
 
249 aa  107  8.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3252  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.24 
 
 
166 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0096  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.6 
 
 
162 aa  106  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1428  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.24 
 
 
165 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464968  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1761  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.62 
 
 
170 aa  105  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0543  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.24 
 
 
269 aa  105  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.08 
 
 
208 aa  105  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0285  NADH-quinone oxidoreductase subunit E  39.22 
 
 
231 aa  105  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.51 
 
 
248 aa  104  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.941311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2831  NADH dehydrogenase subunit E  34.88 
 
 
228 aa  104  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147014  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_7050  predicted protein  41.22 
 
 
217 aa  103  8e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000378621  hitchhiker  0.000000494703 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0821  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34 
 
 
164 aa  103  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.452585  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.5 
 
 
163 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1924  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.36 
 
 
172 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.362282  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0367  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.9 
 
 
208 aa  102  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.91 
 
 
216 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103945  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0931  NADH dehydrogenase subunit E  35 
 
 
168 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0632  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.11 
 
 
154 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1627  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.11 
 
 
154 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3189  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.11 
 
 
154 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1881  NADH dehydrogenase subunit E  37.01 
 
 
253 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.54783 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.5 
 
 
163 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0965  NADH dehydrogenase subunit E  38.97 
 
 
168 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489365  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1032  NADH dehydrogenase subunit E  40.29 
 
 
161 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0249192  normal  0.0947418 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0176  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.69 
 
 
165 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0338  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.55 
 
 
165 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113802  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  31.68 
 
 
398 aa  102  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1633  NADH dehydrogenase subunit E  39.57 
 
 
161 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2245  NADH dehydrogenase subunit E  39.57 
 
 
161 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254081  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2269  NADH dehydrogenase subunit E  39.57 
 
 
161 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128082  normal  0.14114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2162  NADH dehydrogenase subunit E  39.57 
 
 
161 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1497  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.67 
 
 
162 aa  101  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.358345  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2283  NADH dehydrogenase subunit E  39.57 
 
 
161 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960667  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5573  NADH dehydrogenase subunit E  39.57 
 
 
161 aa  101  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0826314  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1439  NADH dehydrogenase subunit E  40.29 
 
 
161 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0487171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>