More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1320 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  100 
 
 
174 aa  357  5e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  92.53 
 
 
174 aa  333  5e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  67.63 
 
 
230 aa  244  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3083  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  60.34 
 
 
174 aa  212  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  41.89 
 
 
166 aa  142  3e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.81 
 
 
161 aa  140  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  42.11 
 
 
270 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  41.98 
 
 
239 aa  136  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.62 
 
 
165 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1312  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.13 
 
 
160 aa  135  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.44 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.44 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  40.38 
 
 
174 aa  132  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  40.38 
 
 
174 aa  132  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.18 
 
 
169 aa  130  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0367  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.24 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.52 
 
 
170 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  42.11 
 
 
167 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  42.11 
 
 
167 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  42.11 
 
 
167 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  42.86 
 
 
181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  41.22 
 
 
155 aa  125  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  41.5 
 
 
155 aa  125  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  42 
 
 
175 aa  124  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  40.67 
 
 
158 aa  123  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1378  NADH dehydrogenase I chain E  43.84 
 
 
177 aa  123  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.41658  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.83 
 
 
170 aa  123  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.37 
 
 
176 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  40.27 
 
 
260 aa  123  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.14 
 
 
216 aa  122  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103945  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.59 
 
 
166 aa  121  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2296  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.24 
 
 
222 aa  121  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.74 
 
 
159 aa  120  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07420  NADH dehydrogenase subunit E  39.86 
 
 
319 aa  120  9e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0368218 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0931  NADH dehydrogenase subunit E  41.45 
 
 
168 aa  120  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1881  NADH dehydrogenase subunit E  40.36 
 
 
253 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.54783 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0965  NADH dehydrogenase subunit E  43.24 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2156  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.14 
 
 
224 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  39.62 
 
 
273 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.14 
 
 
385 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  43.33 
 
 
168 aa  119  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0285  NADH-quinone oxidoreductase subunit E  40.13 
 
 
231 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1047  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.97 
 
 
168 aa  119  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.48 
 
 
176 aa  117  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.14 
 
 
412 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  39.46 
 
 
180 aa  117  7e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1746  NADH dehydrogenase subunit E  42.38 
 
 
159 aa  117  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.14 
 
 
412 aa  117  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1960  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.38 
 
 
165 aa  117  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.58 
 
 
228 aa  116  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0271  NADH dehydrogenase subunit E  39.86 
 
 
269 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3822  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.97 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.144781  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  39.24 
 
 
262 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.86 
 
 
294 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.44 
 
 
412 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1016  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.43 
 
 
168 aa  115  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.664946  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  43.26 
 
 
181 aa  115  3e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.42 
 
 
166 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4394  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.67 
 
 
394 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1356  NADH dehydrogenase subunit E  39.86 
 
 
157 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  41.03 
 
 
249 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13170  NADH dehydrogenase subunit E  40.14 
 
 
252 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  39.63 
 
 
208 aa  114  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.78 
 
 
168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0825  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.2 
 
 
167 aa  114  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.83 
 
 
457 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0473  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.19 
 
 
302 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1025  Fe-hydrogenase, gamma subunit  39.19 
 
 
148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3225  NADH dehydrogenase subunit E  38.93 
 
 
283 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0065484 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0543  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.91 
 
 
269 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0913  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.82 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1873  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  35.62 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2005  NADH dehydrogenase subunit E  38.56 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583559  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0524  NADH dehydrogenase subunit E  35.9 
 
 
263 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2269  NADH dehydrogenase subunit E  39.87 
 
 
161 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128082  normal  0.14114 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0953  NADH dehydrogenase subunit E  38.89 
 
 
157 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.544073 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0154  NADH dehydrogenase subunit E  38.36 
 
 
173 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1633  NADH dehydrogenase subunit E  39.87 
 
 
161 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2245  NADH dehydrogenase subunit E  39.87 
 
 
161 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254081  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  38.62 
 
 
239 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2162  NADH dehydrogenase subunit E  39.87 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5573  NADH dehydrogenase subunit E  39.87 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0826314  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0576  NADH dehydrogenase subunit E  41.67 
 
 
169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1696  NADH dehydrogenase subunit E  45.97 
 
 
170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.142144  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2283  NADH dehydrogenase subunit E  39.87 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960667  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01291  NADH dehydrogenase subunit E  42.86 
 
 
175 aa  111  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17741  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.93 
 
 
175 aa  111  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.78 
 
 
248 aa  111  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.941311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4122  NADH dehydrogenase subunit E  38.16 
 
 
165 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0587  NADH dehydrogenase subunit E  41.67 
 
 
169 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4061  NADH dehydrogenase subunit E  37.66 
 
 
317 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732889  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3694  NADH dehydrogenase subunit E  38.73 
 
 
165 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0959076  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0588  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit- like protein  35.9 
 
 
219 aa  110  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1439  NADH dehydrogenase subunit E  41.18 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0487171  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2395  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.07 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0717093  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4414  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.26 
 
 
240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1870  NADH dehydrogenase subunit E  38.16 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.142581 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0733  NADH dehydrogenase subunit E  41.18 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1303  NADH dehydrogenase subunit E  41.18 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1428  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.19 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464968  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>