More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3822 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3822  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  100 
 
 
154 aa  321  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.144781  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1124  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  56.21 
 
 
154 aa  189  9e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1016  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  56.21 
 
 
168 aa  187  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.664946  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1117  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  59.4 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3424  NADH dehydrogenase subunit E  52.63 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208277  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3129  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  52.6 
 
 
171 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02210  NADH dehydrogenase subunit E  52.63 
 
 
166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1372  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  52.63 
 
 
166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00570397  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2439  NADH dehydrogenase subunit E  52.63 
 
 
166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2578  NADH dehydrogenase subunit E  52.63 
 
 
166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2434  NADH dehydrogenase subunit E  52.63 
 
 
166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02170  hypothetical protein  52.63 
 
 
166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1367  NADH dehydrogenase subunit E  52.63 
 
 
166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.334565  normal  0.707376 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2661  NADH dehydrogenase subunit E  52.63 
 
 
166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0294149  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2547  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  52.29 
 
 
176 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.15313  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2829  NADH dehydrogenase subunit E  52.63 
 
 
166 aa  170  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0584484  normal  0.465649 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1397  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  50.98 
 
 
176 aa  169  9e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231323  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2415  NADH dehydrogenase subunit E  51.97 
 
 
170 aa  169  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144111  normal  0.147361 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1495  NADH dehydrogenase subunit E  52.29 
 
 
181 aa  168  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1563  NADH dehydrogenase subunit E  51.97 
 
 
187 aa  168  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2564  NADH dehydrogenase subunit E  51.97 
 
 
166 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.401608  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2464  NADH dehydrogenase subunit E  51.97 
 
 
166 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11895  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2509  NADH dehydrogenase subunit E  51.97 
 
 
166 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2769  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  50.98 
 
 
171 aa  167  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217796  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2671  NADH dehydrogenase subunit E  51.97 
 
 
166 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  0.621084 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2553  NADH dehydrogenase subunit E  51.97 
 
 
166 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.788767  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28470  NADH dehydrogenase subunit E  51.63 
 
 
164 aa  167  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3305  NADH dehydrogenase subunit E  50.66 
 
 
183 aa  166  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00437107  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4122  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
165 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3694  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
165 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0959076  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29980  NADH dehydrogenase subunit E  49.02 
 
 
166 aa  164  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2567  NADH dehydrogenase subunit E  49.02 
 
 
166 aa  164  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1870  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
165 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.142581 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1743  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
165 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.048618  normal  0.210443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3606  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0576  NADH dehydrogenase subunit E  47.4 
 
 
169 aa  158  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1356  NADH dehydrogenase subunit E  49.67 
 
 
157 aa  157  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1018  NADH dehydrogenase subunit E  50.33 
 
 
180 aa  157  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0587  NADH dehydrogenase subunit E  47.4 
 
 
169 aa  157  7e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1696  NADH dehydrogenase subunit E  46.41 
 
 
170 aa  155  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.142144  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3368  NADH dehydrogenase I, E subunit  46.41 
 
 
165 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3200  NADH dehydrogenase subunit E  46.71 
 
 
165 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333269  normal  0.0237431 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0378  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  48.63 
 
 
167 aa  153  8e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.320338  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2863  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  45.1 
 
 
179 aa  148  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.088948  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0715  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  49.62 
 
 
164 aa  140  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4740  NADH dehydrogenase subunit E  44.37 
 
 
162 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0332  NADH dehydrogenase subunit E  43.42 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0207  NADH dehydrogenase subunit E  44.67 
 
 
162 aa  137  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0154  NADH dehydrogenase subunit E  42.11 
 
 
173 aa  135  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3443  NADH dehydrogenase subunit E  40.67 
 
 
162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1739  NADH dehydrogenase subunit E  50.86 
 
 
157 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0103  NADH dehydrogenase subunit E  50.86 
 
 
157 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1329  NADH dehydrogenase subunit E  42.38 
 
 
157 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116663  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1692  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175779  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1350  NADH dehydrogenase subunit E  44.7 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.150858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4068  NADH dehydrogenase subunit E  45.45 
 
 
157 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50582  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1956  NADH dehydrogenase subunit E  38.82 
 
 
163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131976  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.87 
 
 
159 aa  124  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0177  NADH dehydrogenase subunit E  37.5 
 
 
156 aa  124  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  40.91 
 
 
175 aa  120  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  39.73 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  39.73 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.31 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.97 
 
 
174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0159  NADH dehydrogenase subunit E  37.5 
 
 
155 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.458445 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.18 
 
 
176 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.11 
 
 
174 aa  108  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1960  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.18 
 
 
165 aa  107  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  36.3 
 
 
168 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0821  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.78 
 
 
164 aa  106  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.452585  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1746  NADH dehydrogenase subunit E  35.29 
 
 
159 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4200  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.12 
 
 
171 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.42 
 
 
153 aa  106  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4355  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.12 
 
 
171 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.12 
 
 
171 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.01 
 
 
163 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.01 
 
 
163 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2005  NADH dehydrogenase subunit E  35.44 
 
 
161 aa  104  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583559  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1339  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  37.88 
 
 
155 aa  104  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  33.99 
 
 
167 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  33.99 
 
 
167 aa  103  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  33.99 
 
 
167 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0953  NADH dehydrogenase subunit E  31.61 
 
 
157 aa  103  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.544073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5176  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.06 
 
 
163 aa  103  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.61 
 
 
165 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0931  NADH dehydrogenase subunit E  35.53 
 
 
168 aa  102  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1032  NADH dehydrogenase subunit E  33.54 
 
 
161 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0249192  normal  0.0947418 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  31.82 
 
 
158 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2269  NADH dehydrogenase subunit E  33.54 
 
 
161 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128082  normal  0.14114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3252  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.03 
 
 
166 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1633  NADH dehydrogenase subunit E  33.54 
 
 
161 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2245  NADH dehydrogenase subunit E  33.54 
 
 
161 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254081  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1428  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.99 
 
 
165 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464968  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  37.04 
 
 
239 aa  102  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0656  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  33.97 
 
 
182 aa  101  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0027799  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.29 
 
 
170 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2162  NADH dehydrogenase subunit E  32.91 
 
 
161 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5573  NADH dehydrogenase subunit E  32.5 
 
 
161 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0826314  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2283  NADH dehydrogenase subunit E  32.91 
 
 
161 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960667  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1439  NADH dehydrogenase subunit E  33.54 
 
 
161 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0487171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>