More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0576 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0576  NADH dehydrogenase subunit E  100 
 
 
169 aa  353  8.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0587  NADH dehydrogenase subunit E  95.86 
 
 
169 aa  342  1e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1696  NADH dehydrogenase subunit E  81.55 
 
 
170 aa  300  7.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.142144  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4122  NADH dehydrogenase subunit E  59.21 
 
 
165 aa  210  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29980  NADH dehydrogenase subunit E  58.82 
 
 
166 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2567  NADH dehydrogenase subunit E  58.82 
 
 
166 aa  210  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3694  NADH dehydrogenase subunit E  59.21 
 
 
165 aa  210  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0959076  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1870  NADH dehydrogenase subunit E  59.21 
 
 
165 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.142581 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1743  NADH dehydrogenase subunit E  59.21 
 
 
165 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.048618  normal  0.210443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3606  NADH dehydrogenase subunit E  59.87 
 
 
165 aa  207  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2415  NADH dehydrogenase subunit E  60.53 
 
 
170 aa  207  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144111  normal  0.147361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3368  NADH dehydrogenase I, E subunit  57.52 
 
 
165 aa  205  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3200  NADH dehydrogenase subunit E  58.55 
 
 
165 aa  204  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333269  normal  0.0237431 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3129  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  57.83 
 
 
171 aa  204  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3305  NADH dehydrogenase subunit E  58.55 
 
 
183 aa  202  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00437107  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2829  NADH dehydrogenase subunit E  59.87 
 
 
166 aa  202  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0584484  normal  0.465649 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02210  NADH dehydrogenase subunit E  54.88 
 
 
166 aa  201  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1372  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  54.88 
 
 
166 aa  201  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00570397  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2661  NADH dehydrogenase subunit E  54.88 
 
 
166 aa  201  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0294149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3424  NADH dehydrogenase subunit E  54.88 
 
 
166 aa  201  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208277  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2434  NADH dehydrogenase subunit E  54.88 
 
 
166 aa  201  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2439  NADH dehydrogenase subunit E  54.88 
 
 
166 aa  201  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02170  hypothetical protein  54.88 
 
 
166 aa  201  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2578  NADH dehydrogenase subunit E  54.88 
 
 
166 aa  201  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1367  NADH dehydrogenase subunit E  54.88 
 
 
166 aa  201  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.334565  normal  0.707376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28470  NADH dehydrogenase subunit E  58.17 
 
 
164 aa  199  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2553  NADH dehydrogenase subunit E  54.88 
 
 
166 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.788767  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1563  NADH dehydrogenase subunit E  57.24 
 
 
187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2671  NADH dehydrogenase subunit E  54.88 
 
 
166 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  0.621084 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2464  NADH dehydrogenase subunit E  54.88 
 
 
166 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11895  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2509  NADH dehydrogenase subunit E  54.88 
 
 
166 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2564  NADH dehydrogenase subunit E  54.88 
 
 
166 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.401608  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2547  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  56.13 
 
 
176 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.15313  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1397  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  56.86 
 
 
176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231323  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2769  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  56.86 
 
 
171 aa  195  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217796  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1495  NADH dehydrogenase subunit E  55.15 
 
 
181 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1018  NADH dehydrogenase subunit E  56.21 
 
 
180 aa  189  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0378  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  51.59 
 
 
167 aa  176  2e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.320338  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1124  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  46.41 
 
 
154 aa  167  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1117  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  51.39 
 
 
165 aa  158  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3822  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.4 
 
 
154 aa  158  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.144781  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1016  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.75 
 
 
168 aa  155  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.664946  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1356  NADH dehydrogenase subunit E  44.97 
 
 
157 aa  147  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0207  NADH dehydrogenase subunit E  46.1 
 
 
162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0715  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  47.22 
 
 
164 aa  144  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0103  NADH dehydrogenase subunit E  44.74 
 
 
157 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1739  NADH dehydrogenase subunit E  44.74 
 
 
157 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1692  NADH dehydrogenase subunit E  43.42 
 
 
157 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175779  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2863  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  41.67 
 
 
179 aa  139  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.088948  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1350  NADH dehydrogenase subunit E  41.67 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.150858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4740  NADH dehydrogenase subunit E  40.97 
 
 
162 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1329  NADH dehydrogenase subunit E  40.28 
 
 
157 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116663  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0332  NADH dehydrogenase subunit E  44.62 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4068  NADH dehydrogenase subunit E  39.74 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50582  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0154  NADH dehydrogenase subunit E  44.62 
 
 
173 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3443  NADH dehydrogenase subunit E  42.22 
 
 
162 aa  124  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1956  NADH dehydrogenase subunit E  38.64 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131976  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0177  NADH dehydrogenase subunit E  40.15 
 
 
156 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.67 
 
 
174 aa  111  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0722  formate dehydrogenase subunit gamma  36.3 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0159  NADH dehydrogenase subunit E  40.15 
 
 
155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.458445 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0158  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.81 
 
 
149 aa  108  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.73 
 
 
174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.5 
 
 
165 aa  106  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.84 
 
 
163 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2703  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  38.46 
 
 
151 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.84 
 
 
163 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  33.77 
 
 
166 aa  105  4e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0096  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  29.81 
 
 
162 aa  105  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108902 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  38.56 
 
 
168 aa  104  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  33.77 
 
 
155 aa  104  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0617  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  43.33 
 
 
179 aa  103  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390132  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  33.77 
 
 
155 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1886  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.42 
 
 
159 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.01 
 
 
162 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1295  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.53 
 
 
160 aa  101  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.64 
 
 
159 aa  100  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  33.54 
 
 
249 aa  100  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  34.84 
 
 
174 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  34.84 
 
 
174 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0916  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  29.58 
 
 
162 aa  98.2  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2236  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.45 
 
 
163 aa  97.8  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.58 
 
 
188 aa  97.4  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0338  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  31.94 
 
 
165 aa  97.4  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113802  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02960  NADH dehydrogenase I subunit E  30.77 
 
 
136 aa  97.4  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.01 
 
 
230 aa  97.4  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1393  formate dehydrogenase subunit gamma  35.38 
 
 
159 aa  97.1  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2156  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.21 
 
 
224 aa  96.7  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.68 
 
 
176 aa  97.1  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0367  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  31.54 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3083  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.87 
 
 
174 aa  95.9  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3927  formate dehydrogenase subunit gamma  40.65 
 
 
159 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3506  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  31.72 
 
 
163 aa  96.3  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0558  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  31.69 
 
 
161 aa  95.5  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.808339  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0553  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  36.92 
 
 
169 aa  95.9  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469844  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2269  NADH dehydrogenase subunit E  33.12 
 
 
161 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128082  normal  0.14114 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0833  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit  31.94 
 
 
163 aa  95.1  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1633  NADH dehydrogenase subunit E  33.12 
 
 
161 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2245  NADH dehydrogenase subunit E  33.12 
 
 
161 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254081  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1339  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  36.51 
 
 
155 aa  95.1  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>