More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1739 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0103  NADH dehydrogenase subunit E  100 
 
 
157 aa  313  6e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1739  NADH dehydrogenase subunit E  100 
 
 
157 aa  313  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1692  NADH dehydrogenase subunit E  95.54 
 
 
157 aa  300  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175779  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4068  NADH dehydrogenase subunit E  62.18 
 
 
157 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50582  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1329  NADH dehydrogenase subunit E  62.09 
 
 
157 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116663  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4740  NADH dehydrogenase subunit E  62.09 
 
 
162 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1350  NADH dehydrogenase subunit E  61.44 
 
 
157 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.150858 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1117  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  57.25 
 
 
165 aa  153  9e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3129  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  52.05 
 
 
171 aa  152  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3606  NADH dehydrogenase subunit E  52.24 
 
 
165 aa  145  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0576  NADH dehydrogenase subunit E  44.74 
 
 
169 aa  144  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3200  NADH dehydrogenase subunit E  51.49 
 
 
165 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333269  normal  0.0237431 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0587  NADH dehydrogenase subunit E  44.74 
 
 
169 aa  142  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1696  NADH dehydrogenase subunit E  51.13 
 
 
170 aa  142  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.142144  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4122  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
165 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2567  NADH dehydrogenase subunit E  50.75 
 
 
166 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1743  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
165 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.048618  normal  0.210443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1870  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
165 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.142581 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3694  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
165 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0959076  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29980  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
166 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3368  NADH dehydrogenase I, E subunit  50.75 
 
 
165 aa  140  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1124  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  46.36 
 
 
154 aa  140  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2415  NADH dehydrogenase subunit E  50.75 
 
 
170 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144111  normal  0.147361 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1356  NADH dehydrogenase subunit E  45.71 
 
 
157 aa  138  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1016  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.36 
 
 
168 aa  135  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.664946  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28470  NADH dehydrogenase subunit E  45.83 
 
 
164 aa  134  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3822  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  50.86 
 
 
154 aa  133  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.144781  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0378  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.31 
 
 
167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.320338  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1018  NADH dehydrogenase subunit E  45.52 
 
 
180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0715  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  46.94 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2769  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.36 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217796  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3424  NADH dehydrogenase subunit E  44.03 
 
 
166 aa  124  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208277  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02210  NADH dehydrogenase subunit E  44.03 
 
 
166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1372  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.03 
 
 
166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00570397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2434  NADH dehydrogenase subunit E  44.03 
 
 
166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1367  NADH dehydrogenase subunit E  44.03 
 
 
166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.334565  normal  0.707376 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2578  NADH dehydrogenase subunit E  44.03 
 
 
166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02170  hypothetical protein  44.03 
 
 
166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2439  NADH dehydrogenase subunit E  44.03 
 
 
166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2661  NADH dehydrogenase subunit E  44.03 
 
 
166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0294149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1495  NADH dehydrogenase subunit E  45.11 
 
 
181 aa  123  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2829  NADH dehydrogenase subunit E  43.28 
 
 
166 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0584484  normal  0.465649 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3305  NADH dehydrogenase subunit E  42.54 
 
 
183 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00437107  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2564  NADH dehydrogenase subunit E  40.97 
 
 
166 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.401608  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2509  NADH dehydrogenase subunit E  40.97 
 
 
166 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2553  NADH dehydrogenase subunit E  40.97 
 
 
166 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.788767  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2671  NADH dehydrogenase subunit E  40.97 
 
 
166 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  0.621084 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2464  NADH dehydrogenase subunit E  40.97 
 
 
166 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11895  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2547  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.36 
 
 
176 aa  120  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.15313  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1563  NADH dehydrogenase subunit E  43.61 
 
 
187 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2863  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  43.48 
 
 
179 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.088948  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0177  NADH dehydrogenase subunit E  45.52 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1397  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.86 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231323  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0332  NADH dehydrogenase subunit E  43.61 
 
 
157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0207  NADH dehydrogenase subunit E  44.03 
 
 
162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1956  NADH dehydrogenase subunit E  40.82 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131976  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0154  NADH dehydrogenase subunit E  41.67 
 
 
173 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0159  NADH dehydrogenase subunit E  46.27 
 
 
155 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.458445 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.36 
 
 
169 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3443  NADH dehydrogenase subunit E  42.11 
 
 
162 aa  103  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  38.22 
 
 
262 aa  101  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.98 
 
 
163 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.98 
 
 
163 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.77 
 
 
230 aa  99  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.18 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  34.59 
 
 
166 aa  97.1  8e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2236  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.53 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  38.81 
 
 
260 aa  96.3  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  39.42 
 
 
273 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5573  NADH dehydrogenase subunit E  37.96 
 
 
161 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0826314  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2162  NADH dehydrogenase subunit E  37.96 
 
 
161 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2283  NADH dehydrogenase subunit E  37.96 
 
 
161 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960667  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1347  NADH dehydrogenase subunit E  37.23 
 
 
161 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00701728  normal  0.0175389 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  35.07 
 
 
158 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2269  NADH dehydrogenase subunit E  37.96 
 
 
161 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128082  normal  0.14114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1633  NADH dehydrogenase subunit E  37.96 
 
 
161 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2245  NADH dehydrogenase subunit E  37.96 
 
 
161 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254081  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3210  NADH dehydrogenase subunit E  37.23 
 
 
161 aa  94.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4459  NADH dehydrogenase subunit E  39.71 
 
 
305 aa  94.4  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.69 
 
 
174 aa  94  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2005  NADH dehydrogenase subunit E  37.23 
 
 
161 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583559  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0285  NADH-quinone oxidoreductase subunit E  32.7 
 
 
231 aa  93.2  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0158  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  36.23 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4061  NADH dehydrogenase subunit E  38.97 
 
 
317 aa  92.8  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732889  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  36.57 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  36.57 
 
 
167 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.76 
 
 
165 aa  92  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1032  NADH dehydrogenase subunit E  36.5 
 
 
161 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0249192  normal  0.0947418 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  36.57 
 
 
167 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.69 
 
 
176 aa  91.7  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.11 
 
 
294 aa  91.7  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.78 
 
 
161 aa  91.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1339  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  33.55 
 
 
155 aa  91.7  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0806  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  29.17 
 
 
149 aa  91.3  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.91557  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3922  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  36.15 
 
 
169 aa  90.5  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02960  NADH dehydrogenase I subunit E  35.07 
 
 
136 aa  90.5  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  37.93 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.92 
 
 
174 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_153  [Fe] hydrogenase, HymA subunit  34.13 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1378  NADH dehydrogenase I chain E  37.82 
 
 
177 aa  90.1  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.41658  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>