More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1124 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1124  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  100 
 
 		 154 aa  317  3.9999999999999996e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1016  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  60.39 
 
 		 168 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.664946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3822  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  56.21 
 
 		 154 aa  189  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.144781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3129  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  53.59 
 
 		 171 aa  176  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4122  NADH dehydrogenase subunit E  50.66 
 
 		 165 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1743  NADH dehydrogenase subunit E  50.66 
 
 		 165 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.048618  normal  0.210443 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1563  NADH dehydrogenase subunit E  52.63 
 
 		 187 aa  170  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1870  NADH dehydrogenase subunit E  50.66 
 
 		 165 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.142581 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3694  NADH dehydrogenase subunit E  50.66 
 
 		 165 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0959076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1117  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  58.09 
 
 		 165 aa  167  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0576  NADH dehydrogenase subunit E  46.41 
 
 		 169 aa  167  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3305  NADH dehydrogenase subunit E  50.33 
 
 		 183 aa  167  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00437107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3606  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 		 165 aa  167  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29980  NADH dehydrogenase subunit E  48.37 
 
 		 166 aa  167  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1356  NADH dehydrogenase subunit E  51.68 
 
 		 157 aa  167  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2567  NADH dehydrogenase subunit E  48.37 
 
 		 166 aa  166  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3368  NADH dehydrogenase I, E subunit  48.37 
 
 		 165 aa  165  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2564  NADH dehydrogenase subunit E  50.33 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.401608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1397  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  49.35 
 
 		 176 aa  165  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231323  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2553  NADH dehydrogenase subunit E  50.33 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.788767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2509  NADH dehydrogenase subunit E  50.33 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3424  NADH dehydrogenase subunit E  50.33 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2671  NADH dehydrogenase subunit E  50.33 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  0.621084 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2464  NADH dehydrogenase subunit E  50.33 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11895  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02210  NADH dehydrogenase subunit E  50.33 
 
 		 166 aa  164  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1372  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  50.33 
 
 		 166 aa  164  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00570397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2434  NADH dehydrogenase subunit E  50.33 
 
 		 166 aa  164  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2439  NADH dehydrogenase subunit E  50.33 
 
 		 166 aa  164  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02170  hypothetical protein  50.33 
 
 		 166 aa  164  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2661  NADH dehydrogenase subunit E  50.33 
 
 		 166 aa  164  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0294149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1367  NADH dehydrogenase subunit E  50.33 
 
 		 166 aa  164  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.334565  normal  0.707376 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2578  NADH dehydrogenase subunit E  50.33 
 
 		 166 aa  164  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0587  NADH dehydrogenase subunit E  46.41 
 
 		 169 aa  164  5e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1696  NADH dehydrogenase subunit E  45.75 
 
 		 170 aa  164  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.142144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3200  NADH dehydrogenase subunit E  48.03 
 
 		 165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333269  normal  0.0237431 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2829  NADH dehydrogenase subunit E  50.33 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0584484  normal  0.465649 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2415  NADH dehydrogenase subunit E  48.03 
 
 		 170 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144111  normal  0.147361 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1495  NADH dehydrogenase subunit E  49.35 
 
 		 181 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2547  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  48.7 
 
 		 176 aa  160  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.15313  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2769  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  48.05 
 
 		 171 aa  160  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28470  NADH dehydrogenase subunit E  49.02 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1018  NADH dehydrogenase subunit E  47.06 
 
 		 180 aa  156  9e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0378  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.71 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.320338  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0715  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  54.17 
 
 		 164 aa  151  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2863  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  46 
 
 		 179 aa  150  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.088948  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3443  NADH dehydrogenase subunit E  48.34 
 
 		 162 aa  147  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1692  NADH dehydrogenase subunit E  47.02 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0103  NADH dehydrogenase subunit E  46.36 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1739  NADH dehydrogenase subunit E  46.36 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0332  NADH dehydrogenase subunit E  49.62 
 
 		 157 aa  140  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4740  NADH dehydrogenase subunit E  43.79 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0154  NADH dehydrogenase subunit E  43.05 
 
 		 173 aa  134  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1350  NADH dehydrogenase subunit E  43.79 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1329  NADH dehydrogenase subunit E  43.05 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1956  NADH dehydrogenase subunit E  44.37 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4068  NADH dehydrogenase subunit E  41.83 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0207  NADH dehydrogenase subunit E  42 
 
 		 162 aa  120  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0177  NADH dehydrogenase subunit E  41.33 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.67 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.46 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1428  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.96 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464968  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  36.13 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  37.66 
 
 		 167 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  37.66 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0158  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  41.86 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  36.13 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0159  NADH dehydrogenase subunit E  41.33 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.458445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  37.66 
 
 		 167 aa  110  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  41.18 
 
 		 175 aa  110  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  35.95 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  38.16 
 
 		 168 aa  110  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.28 
 
 		 169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.22 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.22 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0806  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  40.16 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.91557  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24660  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit  38.69 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0931  NADH dehydrogenase subunit E  39.46 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1633  NADH dehydrogenase subunit E  36.54 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.38 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1339  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  39.23 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2269  NADH dehydrogenase subunit E  36.54 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128082  normal  0.14114 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2245  NADH dehydrogenase subunit E  36.54 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254081  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.24 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5573  NADH dehydrogenase subunit E  36.54 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0826314  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2283  NADH dehydrogenase subunit E  36.54 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960667  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2162  NADH dehydrogenase subunit E  36.54 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0953  NADH dehydrogenase subunit E  35.29 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.544073 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2005  NADH dehydrogenase subunit E  37.18 
 
 		 161 aa  103  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583559  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.16 
 
 		 163 aa  103  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.16 
 
 		 163 aa  103  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1032  NADH dehydrogenase subunit E  36.54 
 
 		 161 aa  103  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0249192  normal  0.0947418 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0632  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.01 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1627  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.01 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3189  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.01 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1746  NADH dehydrogenase subunit E  36.36 
 
 		 159 aa  102  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.46 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3252  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.74 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0965  NADH dehydrogenase subunit E  39.42 
 
 		 168 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489365  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1303  NADH dehydrogenase subunit E  36.54 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1065  NADH dehydrogenase subunit E  36.54 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.331293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>