More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1356 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1356  NADH dehydrogenase subunit E  100 
 
 		 157 aa  324  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1016  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  53.33 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.664946  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1117  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  57.53 
 
 		 165 aa  174  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1124  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  51.68 
 
 		 154 aa  167  8e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3129  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  50.99 
 
 		 171 aa  163  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3822  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  49.67 
 
 		 154 aa  157  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.144781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0576  NADH dehydrogenase subunit E  44.97 
 
 		 169 aa  147  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3606  NADH dehydrogenase subunit E  45.7 
 
 		 165 aa  147  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0154  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 		 173 aa  147  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3443  NADH dehydrogenase subunit E  46.98 
 
 		 162 aa  147  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3305  NADH dehydrogenase subunit E  44.97 
 
 		 183 aa  146  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00437107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4122  NADH dehydrogenase subunit E  44.37 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0587  NADH dehydrogenase subunit E  44.97 
 
 		 169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1870  NADH dehydrogenase subunit E  44.37 
 
 		 165 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.142581 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3694  NADH dehydrogenase subunit E  44.37 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0959076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1743  NADH dehydrogenase subunit E  44.37 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.048618  normal  0.210443 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1397  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.03 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231323  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2567  NADH dehydrogenase subunit E  45.14 
 
 		 166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29980  NADH dehydrogenase subunit E  45.14 
 
 		 166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3368  NADH dehydrogenase I, E subunit  43.71 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3200  NADH dehydrogenase subunit E  43.71 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333269  normal  0.0237431 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2829  NADH dehydrogenase subunit E  45.64 
 
 		 166 aa  144  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0584484  normal  0.465649 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2415  NADH dehydrogenase subunit E  45.83 
 
 		 170 aa  144  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144111  normal  0.147361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28470  NADH dehydrogenase subunit E  45.03 
 
 		 164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3424  NADH dehydrogenase subunit E  44.97 
 
 		 166 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1563  NADH dehydrogenase subunit E  43.62 
 
 		 187 aa  142  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1696  NADH dehydrogenase subunit E  42.95 
 
 		 170 aa  141  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.142144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1495  NADH dehydrogenase subunit E  45.03 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02210  NADH dehydrogenase subunit E  44.3 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1372  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.3 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00570397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1367  NADH dehydrogenase subunit E  44.3 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.334565  normal  0.707376 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2769  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.37 
 
 		 171 aa  141  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217796  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0715  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  49.31 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2434  NADH dehydrogenase subunit E  44.3 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2661  NADH dehydrogenase subunit E  44.3 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0294149  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2439  NADH dehydrogenase subunit E  44.3 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2578  NADH dehydrogenase subunit E  44.3 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02170  hypothetical protein  44.3 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0332  NADH dehydrogenase subunit E  43.71 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2671  NADH dehydrogenase subunit E  43.62 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  0.621084 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0207  NADH dehydrogenase subunit E  44 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2509  NADH dehydrogenase subunit E  43.62 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2464  NADH dehydrogenase subunit E  43.62 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11895  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2553  NADH dehydrogenase subunit E  43.62 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.788767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2564  NADH dehydrogenase subunit E  43.62 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.401608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0103  NADH dehydrogenase subunit E  45.71 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2547  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.05 
 
 		 176 aa  138  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.15313  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1739  NADH dehydrogenase subunit E  45.71 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0378  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.36 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.320338  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1329  NADH dehydrogenase subunit E  43.59 
 
 		 157 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1018  NADH dehydrogenase subunit E  43.54 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1692  NADH dehydrogenase subunit E  45 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1350  NADH dehydrogenase subunit E  45.33 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4740  NADH dehydrogenase subunit E  44 
 
 		 162 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0177  NADH dehydrogenase subunit E  42.75 
 
 		 156 aa  133  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2863  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  40.79 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.088948  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4068  NADH dehydrogenase subunit E  42.67 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0159  NADH dehydrogenase subunit E  43.51 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.458445 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1956  NADH dehydrogenase subunit E  40.85 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.22 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.22 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.73 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.86 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.33 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.1 
 
 		 174 aa  110  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.18 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.18 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  37.5 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  37.86 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  37.5 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  37.86 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  37.86 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.46 
 
 		 176 aa  106  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1428  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.51 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464968  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  36.36 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  36.36 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.01 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.92 
 
 		 175 aa  104  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3252  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.71 
 
 		 166 aa  104  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.19 
 
 		 166 aa  103  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2156  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.87 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2809  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.32 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  32.43 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3506  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.59 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2269  NADH dehydrogenase subunit E  35.97 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128082  normal  0.14114 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1032  NADH dehydrogenase subunit E  34.39 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0249192  normal  0.0947418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1633  NADH dehydrogenase subunit E  35.97 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.06 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2245  NADH dehydrogenase subunit E  35.97 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254081  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.88 
 
 		 188 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5573  NADH dehydrogenase subunit E  35.97 
 
 		 161 aa  100  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0826314  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2162  NADH dehydrogenase subunit E  35.97 
 
 		 161 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2283  NADH dehydrogenase subunit E  35.97 
 
 		 161 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960667  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.76 
 
 		 230 aa  100  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4355  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.4 
 
 		 171 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  35.04 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4200  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.4 
 
 		 171 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.4 
 
 		 171 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1746  NADH dehydrogenase subunit E  35.06 
 
 		 159 aa  100  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1497  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.72 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.358345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>