More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1016 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1016  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  100 
 
 
168 aa  353  3.9999999999999996e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.664946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1124  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  60.39 
 
 
154 aa  198  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3822  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  56.21 
 
 
154 aa  187  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.144781  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1356  NADH dehydrogenase subunit E  53.33 
 
 
157 aa  176  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1117  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  57.43 
 
 
165 aa  175  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28470  NADH dehydrogenase subunit E  52.94 
 
 
164 aa  171  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2547  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  52.6 
 
 
176 aa  170  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.15313  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1397  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  51.95 
 
 
176 aa  169  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231323  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1563  NADH dehydrogenase subunit E  51.97 
 
 
187 aa  168  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1870  NADH dehydrogenase subunit E  51.32 
 
 
165 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.142581 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4122  NADH dehydrogenase subunit E  51.32 
 
 
165 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1743  NADH dehydrogenase subunit E  51.32 
 
 
165 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.048618  normal  0.210443 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3305  NADH dehydrogenase subunit E  51.63 
 
 
183 aa  167  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00437107  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3694  NADH dehydrogenase subunit E  51.32 
 
 
165 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0959076  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3606  NADH dehydrogenase subunit E  50.66 
 
 
165 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1495  NADH dehydrogenase subunit E  51.3 
 
 
181 aa  164  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2567  NADH dehydrogenase subunit E  50.33 
 
 
166 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29980  NADH dehydrogenase subunit E  50.33 
 
 
166 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2769  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  50 
 
 
171 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217796  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2829  NADH dehydrogenase subunit E  51.63 
 
 
166 aa  163  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0584484  normal  0.465649 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3424  NADH dehydrogenase subunit E  50.98 
 
 
166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208277  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3368  NADH dehydrogenase I, E subunit  50.33 
 
 
165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3200  NADH dehydrogenase subunit E  50.66 
 
 
165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333269  normal  0.0237431 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1018  NADH dehydrogenase subunit E  50.33 
 
 
180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2509  NADH dehydrogenase subunit E  50.98 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2553  NADH dehydrogenase subunit E  50.98 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.788767  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2671  NADH dehydrogenase subunit E  50.98 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  0.621084 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2564  NADH dehydrogenase subunit E  50.98 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.401608  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2464  NADH dehydrogenase subunit E  50.98 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11895  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02210  NADH dehydrogenase subunit E  50.98 
 
 
166 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1372  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  50.98 
 
 
166 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00570397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02170  hypothetical protein  50.98 
 
 
166 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1367  NADH dehydrogenase subunit E  50.98 
 
 
166 aa  162  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.334565  normal  0.707376 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2578  NADH dehydrogenase subunit E  50.98 
 
 
166 aa  162  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2434  NADH dehydrogenase subunit E  50.98 
 
 
166 aa  162  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3129  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  50.33 
 
 
171 aa  162  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2661  NADH dehydrogenase subunit E  50.98 
 
 
166 aa  162  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0294149  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2439  NADH dehydrogenase subunit E  50.98 
 
 
166 aa  162  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0715  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  52.7 
 
 
164 aa  160  9e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2415  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
170 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144111  normal  0.147361 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0154  NADH dehydrogenase subunit E  42.33 
 
 
173 aa  159  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1696  NADH dehydrogenase subunit E  45.1 
 
 
170 aa  157  8e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.142144  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3443  NADH dehydrogenase subunit E  44.87 
 
 
162 aa  155  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0576  NADH dehydrogenase subunit E  45.75 
 
 
169 aa  155  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0378  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.71 
 
 
167 aa  152  2.9999999999999998e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.320338  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0587  NADH dehydrogenase subunit E  45.1 
 
 
169 aa  150  7e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2863  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  42.77 
 
 
179 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.088948  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0332  NADH dehydrogenase subunit E  40 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1692  NADH dehydrogenase subunit E  47.02 
 
 
157 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175779  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0103  NADH dehydrogenase subunit E  46.36 
 
 
157 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1739  NADH dehydrogenase subunit E  46.36 
 
 
157 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0177  NADH dehydrogenase subunit E  41.33 
 
 
156 aa  135  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0207  NADH dehydrogenase subunit E  41.03 
 
 
162 aa  133  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1350  NADH dehydrogenase subunit E  48.48 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.150858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1329  NADH dehydrogenase subunit E  46.97 
 
 
157 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116663  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4740  NADH dehydrogenase subunit E  44.7 
 
 
162 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40 
 
 
163 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40 
 
 
163 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0159  NADH dehydrogenase subunit E  42 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.458445 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.79 
 
 
176 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1956  NADH dehydrogenase subunit E  40.67 
 
 
163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131976  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.38 
 
 
169 aa  124  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4068  NADH dehydrogenase subunit E  44.7 
 
 
157 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50582  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  39.16 
 
 
167 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  39.16 
 
 
167 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  38.55 
 
 
167 aa  120  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0632  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.18 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1627  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.18 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3189  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.18 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.56 
 
 
168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.91 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.18 
 
 
174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  41.18 
 
 
175 aa  117  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  39.6 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  41.43 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0931  NADH dehydrogenase subunit E  39.39 
 
 
168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4554  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  39.62 
 
 
341 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.43 
 
 
174 aa  115  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1428  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.12 
 
 
165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464968  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.91 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0096  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.5 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108902 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3252  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.27 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  36.14 
 
 
270 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.01 
 
 
176 aa  112  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1960  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.01 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.44 
 
 
188 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.38 
 
 
166 aa  111  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0965  NADH dehydrogenase subunit E  42.45 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489365  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  41.73 
 
 
260 aa  109  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.65 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.18 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.65 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  38.16 
 
 
168 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0806  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  36.96 
 
 
149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.91557  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  36.6 
 
 
158 aa  107  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3860  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  36.94 
 
 
159 aa  107  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1312  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.03 
 
 
160 aa  107  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.67 
 
 
159 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0215  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.03 
 
 
154 aa  105  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4355  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.26 
 
 
171 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>