More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0378 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0378  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  100 
 
 
167 aa  351  2.9999999999999997e-96  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.320338  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1563  NADH dehydrogenase subunit E  72.73 
 
 
187 aa  239  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2564  NADH dehydrogenase subunit E  72.73 
 
 
166 aa  237  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.401608  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2464  NADH dehydrogenase subunit E  72.73 
 
 
166 aa  237  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1495  NADH dehydrogenase subunit E  68.94 
 
 
181 aa  237  5.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2553  NADH dehydrogenase subunit E  72.73 
 
 
166 aa  237  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.788767  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2509  NADH dehydrogenase subunit E  72.73 
 
 
166 aa  237  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2671  NADH dehydrogenase subunit E  72.73 
 
 
166 aa  237  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  0.621084 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02210  NADH dehydrogenase subunit E  71.43 
 
 
166 aa  235  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1372  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  71.43 
 
 
166 aa  235  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00570397  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2578  NADH dehydrogenase subunit E  71.43 
 
 
166 aa  235  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2439  NADH dehydrogenase subunit E  71.43 
 
 
166 aa  235  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2661  NADH dehydrogenase subunit E  71.43 
 
 
166 aa  235  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0294149  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02170  hypothetical protein  71.43 
 
 
166 aa  235  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1367  NADH dehydrogenase subunit E  71.43 
 
 
166 aa  235  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.334565  normal  0.707376 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2434  NADH dehydrogenase subunit E  71.43 
 
 
166 aa  235  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2769  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  67.08 
 
 
171 aa  233  9e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3305  NADH dehydrogenase subunit E  71.43 
 
 
183 aa  233  9e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00437107  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2547  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  70.78 
 
 
176 aa  232  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.15313  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2829  NADH dehydrogenase subunit E  71.43 
 
 
166 aa  232  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0584484  normal  0.465649 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3424  NADH dehydrogenase subunit E  70.78 
 
 
166 aa  231  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208277  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1397  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  70.13 
 
 
176 aa  229  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231323  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1018  NADH dehydrogenase subunit E  60.38 
 
 
180 aa  208  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28470  NADH dehydrogenase subunit E  62.58 
 
 
164 aa  204  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29980  NADH dehydrogenase subunit E  56.89 
 
 
166 aa  204  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2567  NADH dehydrogenase subunit E  56.29 
 
 
166 aa  202  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4122  NADH dehydrogenase subunit E  57.69 
 
 
165 aa  201  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3694  NADH dehydrogenase subunit E  57.69 
 
 
165 aa  200  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0959076  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3200  NADH dehydrogenase subunit E  57.69 
 
 
165 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333269  normal  0.0237431 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1870  NADH dehydrogenase subunit E  57.69 
 
 
165 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.142581 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1743  NADH dehydrogenase subunit E  57.69 
 
 
165 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.048618  normal  0.210443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3606  NADH dehydrogenase subunit E  57.69 
 
 
165 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3368  NADH dehydrogenase I, E subunit  57.05 
 
 
165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2415  NADH dehydrogenase subunit E  53.94 
 
 
170 aa  193  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144111  normal  0.147361 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3129  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  55.84 
 
 
171 aa  185  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0576  NADH dehydrogenase subunit E  51.59 
 
 
169 aa  176  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0587  NADH dehydrogenase subunit E  52.23 
 
 
169 aa  175  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1696  NADH dehydrogenase subunit E  48.43 
 
 
170 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.142144  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1124  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  46.71 
 
 
154 aa  155  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3822  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  48.63 
 
 
154 aa  153  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.144781  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1016  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.71 
 
 
168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.664946  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1117  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  50.36 
 
 
165 aa  150  8e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0332  NADH dehydrogenase subunit E  44.3 
 
 
157 aa  147  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1356  NADH dehydrogenase subunit E  43.36 
 
 
157 aa  138  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3443  NADH dehydrogenase subunit E  40.69 
 
 
162 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1956  NADH dehydrogenase subunit E  42.86 
 
 
163 aa  137  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131976  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0715  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  40.79 
 
 
164 aa  133  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0154  NADH dehydrogenase subunit E  43.08 
 
 
173 aa  132  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4068  NADH dehydrogenase subunit E  39.74 
 
 
157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50582  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0103  NADH dehydrogenase subunit E  38.31 
 
 
157 aa  131  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1739  NADH dehydrogenase subunit E  38.31 
 
 
157 aa  131  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4740  NADH dehydrogenase subunit E  40.74 
 
 
162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1692  NADH dehydrogenase subunit E  37.01 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175779  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1329  NADH dehydrogenase subunit E  37.91 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116663  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1350  NADH dehydrogenase subunit E  36.6 
 
 
157 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.150858 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0207  NADH dehydrogenase subunit E  40 
 
 
162 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2863  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  36.08 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.088948  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1886  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.91 
 
 
159 aa  117  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.26 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.26 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0096  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.67 
 
 
162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108902 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0177  NADH dehydrogenase subunit E  39.69 
 
 
156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0159  NADH dehydrogenase subunit E  40.46 
 
 
155 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.458445 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0806  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.9 
 
 
149 aa  107  5e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.91557  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.78 
 
 
165 aa  106  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3506  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.26 
 
 
163 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0656  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  38.93 
 
 
182 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0027799  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1829  Fe-hydrogenase, gamma subunit  38.85 
 
 
148 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0158  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  36.43 
 
 
149 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.11 
 
 
169 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1025  Fe-hydrogenase, gamma subunit  37.41 
 
 
148 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2703  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  33.33 
 
 
151 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  36.71 
 
 
260 aa  102  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1339  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  36.43 
 
 
155 aa  102  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.18 
 
 
385 aa  101  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2156  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.36 
 
 
224 aa  100  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.51 
 
 
162 aa  100  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0916  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  33.58 
 
 
162 aa  100  9e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.18 
 
 
264 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_153  [Fe] hydrogenase, HymA subunit  39.39 
 
 
155 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.96 
 
 
153 aa  99.8  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0833  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit  37.23 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0783  NADH dehydrogenase I chain E  32.85 
 
 
148 aa  99  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0632  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.34 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1627  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.34 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3189  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.34 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.8 
 
 
174 aa  98.2  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.96 
 
 
166 aa  98.2  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_002936  DET0145  [Fe] hydrogenase, HymA subunit, putative  38.64 
 
 
155 aa  97.8  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.702609  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0226  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  38.64 
 
 
155 aa  97.4  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3134  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  29.94 
 
 
171 aa  97.4  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0282366  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1151  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.43 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.995235  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  36.84 
 
 
155 aa  96.7  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  36.84 
 
 
155 aa  96.7  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0697  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.14 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000280605  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4629  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.26 
 
 
229 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0721  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.14 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000389921  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1653  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  36.43 
 
 
158 aa  97.1  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.29 
 
 
168 aa  96.3  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0165  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  32.24 
 
 
175 aa  95.9  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>