More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0632 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0632  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  100 
 
 
154 aa  322  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1627  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  100 
 
 
154 aa  322  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3189  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  100 
 
 
154 aa  322  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.9 
 
 
163 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.9 
 
 
163 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.89 
 
 
176 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  45.32 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  45.32 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.95 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.97 
 
 
168 aa  128  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0821  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.72 
 
 
164 aa  124  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.452585  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4355  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40 
 
 
171 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40 
 
 
171 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4200  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40 
 
 
171 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  44.37 
 
 
175 aa  121  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45 
 
 
159 aa  121  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  43.26 
 
 
158 aa  120  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1016  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.18 
 
 
168 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.664946  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.86 
 
 
176 aa  119  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.54 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5573  NADH dehydrogenase subunit E  44.52 
 
 
161 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0826314  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40 
 
 
163 aa  118  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40 
 
 
163 aa  118  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  38.26 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2162  NADH dehydrogenase subunit E  44.52 
 
 
161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2283  NADH dehydrogenase subunit E  44.52 
 
 
161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960667  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2269  NADH dehydrogenase subunit E  44.52 
 
 
161 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128082  normal  0.14114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1633  NADH dehydrogenase subunit E  44.52 
 
 
161 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2245  NADH dehydrogenase subunit E  44.52 
 
 
161 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254081  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1825  NADH dehydrogenase subunit E  43.92 
 
 
161 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1439  NADH dehydrogenase subunit E  43.92 
 
 
161 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0487171  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0417  NADH dehydrogenase subunit E  43.92 
 
 
161 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1065  NADH dehydrogenase subunit E  43.92 
 
 
161 aa  116  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.331293  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0733  NADH dehydrogenase subunit E  43.92 
 
 
161 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1303  NADH dehydrogenase subunit E  43.92 
 
 
161 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1294  NADH dehydrogenase subunit E  43.92 
 
 
161 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1134  NADH dehydrogenase subunit E  43.92 
 
 
161 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0930546  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1347  NADH dehydrogenase subunit E  43.92 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00701728  normal  0.0175389 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  43.66 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1032  NADH dehydrogenase subunit E  43.84 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0249192  normal  0.0947418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.86 
 
 
166 aa  116  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1960  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.96 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1761  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.18 
 
 
170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2005  NADH dehydrogenase subunit E  43.24 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583559  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.68 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3210  NADH dehydrogenase subunit E  43.24 
 
 
161 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1497  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.19 
 
 
162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.358345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3252  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.51 
 
 
166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.58 
 
 
170 aa  114  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3506  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.06 
 
 
182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2809  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.51 
 
 
165 aa  113  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.33 
 
 
188 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  40.85 
 
 
167 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5176  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.33 
 
 
163 aa  111  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1505  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.93 
 
 
175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00485138 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1279  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.33 
 
 
183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1378  NADH dehydrogenase I chain E  37.41 
 
 
177 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.41658  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  40.14 
 
 
167 aa  110  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.33 
 
 
169 aa  110  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  41.26 
 
 
174 aa  110  6e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  41.26 
 
 
174 aa  110  6e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  38.46 
 
 
270 aa  110  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  40.14 
 
 
167 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1746  NADH dehydrogenase subunit E  41.26 
 
 
159 aa  110  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1428  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.73 
 
 
165 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464968  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.41 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  39.04 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0931  NADH dehydrogenase subunit E  40.85 
 
 
168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0154  NADH dehydrogenase subunit E  48.57 
 
 
173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0913  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.1 
 
 
203 aa  108  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2827  NADH dehydrogenase subunit E  41.26 
 
 
175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.169197  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  34.72 
 
 
262 aa  106  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0332  NADH dehydrogenase subunit E  49.04 
 
 
157 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1312  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.14 
 
 
160 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0273  NADH dehydrogenase subunit E  38.46 
 
 
175 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  37.41 
 
 
249 aa  105  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1117  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.17 
 
 
165 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0244  NADH dehydrogenase subunit E  38.46 
 
 
175 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.33 
 
 
170 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28470  NADH dehydrogenase subunit E  42.74 
 
 
164 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.13 
 
 
174 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2769  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.32 
 
 
171 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3200  NADH dehydrogenase subunit E  38.4 
 
 
165 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333269  normal  0.0237431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3368  NADH dehydrogenase I, E subunit  38.4 
 
 
165 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  40.85 
 
 
181 aa  104  4e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01291  NADH dehydrogenase subunit E  39.86 
 
 
175 aa  104  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3443  NADH dehydrogenase subunit E  48.08 
 
 
162 aa  104  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.49 
 
 
174 aa  104  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1397  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.32 
 
 
176 aa  104  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231323  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0953  NADH dehydrogenase subunit E  36.73 
 
 
157 aa  103  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.544073 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  38.57 
 
 
239 aa  103  8e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1563  NADH dehydrogenase subunit E  40.32 
 
 
187 aa  103  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1124  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  39.01 
 
 
154 aa  103  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  33.97 
 
 
273 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4485  NADH dehydrogenase subunit E  36.55 
 
 
287 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256998  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0965  NADH dehydrogenase subunit E  38.73 
 
 
168 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489365  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1743  NADH dehydrogenase subunit E  38.4 
 
 
165 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.048618  normal  0.210443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1870  NADH dehydrogenase subunit E  38.4 
 
 
165 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.142581 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4122  NADH dehydrogenase subunit E  38.4 
 
 
165 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  38.69 
 
 
180 aa  102  2e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>