More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0821 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0821  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  100 
 
 
164 aa  342  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.452585  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  56.6 
 
 
175 aa  209  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  62.07 
 
 
155 aa  202  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  62.07 
 
 
155 aa  202  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  60.53 
 
 
176 aa  193  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  57.59 
 
 
168 aa  192  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1960  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  55.15 
 
 
165 aa  191  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  50 
 
 
166 aa  177  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  51.23 
 
 
174 aa  174  5e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  57.72 
 
 
168 aa  174  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  51.23 
 
 
174 aa  174  7e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  51.7 
 
 
163 aa  167  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  51.7 
 
 
163 aa  167  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01291  NADH dehydrogenase subunit E  48.1 
 
 
175 aa  165  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17741  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  52.67 
 
 
159 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2827  NADH dehydrogenase subunit E  48.1 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.169197  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0273  NADH dehydrogenase subunit E  44.3 
 
 
175 aa  155  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1761  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.27 
 
 
170 aa  156  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0244  NADH dehydrogenase subunit E  44.3 
 
 
175 aa  155  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.95 
 
 
161 aa  155  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  48 
 
 
158 aa  148  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3252  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.1 
 
 
166 aa  147  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2809  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.67 
 
 
165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.86 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.86 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1378  NADH dehydrogenase I chain E  45.58 
 
 
177 aa  145  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.41658  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.97 
 
 
165 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  48.23 
 
 
170 aa  143  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1347  NADH dehydrogenase subunit E  47.06 
 
 
161 aa  141  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00701728  normal  0.0175389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3506  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.23 
 
 
182 aa  141  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1303  NADH dehydrogenase subunit E  49.02 
 
 
161 aa  141  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2005  NADH dehydrogenase subunit E  47.06 
 
 
161 aa  141  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583559  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0417  NADH dehydrogenase subunit E  49.02 
 
 
161 aa  141  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0733  NADH dehydrogenase subunit E  49.02 
 
 
161 aa  141  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1825  NADH dehydrogenase subunit E  49.02 
 
 
161 aa  141  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1439  NADH dehydrogenase subunit E  49.02 
 
 
161 aa  141  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0487171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1294  NADH dehydrogenase subunit E  49.02 
 
 
161 aa  141  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1065  NADH dehydrogenase subunit E  49.02 
 
 
161 aa  141  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.331293  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1428  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.14 
 
 
165 aa  141  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464968  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1134  NADH dehydrogenase subunit E  49.02 
 
 
161 aa  141  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0930546  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.45 
 
 
176 aa  140  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.3 
 
 
175 aa  140  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1497  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.31 
 
 
162 aa  140  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.358345  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3210  NADH dehydrogenase subunit E  46.41 
 
 
161 aa  140  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1505  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.03 
 
 
175 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00485138 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  44.59 
 
 
181 aa  139  9.999999999999999e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  43.59 
 
 
167 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1032  NADH dehydrogenase subunit E  47.71 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0249192  normal  0.0947418 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1746  NADH dehydrogenase subunit E  45.03 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  43.59 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2269  NADH dehydrogenase subunit E  47.06 
 
 
161 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128082  normal  0.14114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0931  NADH dehydrogenase subunit E  42.14 
 
 
168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1633  NADH dehydrogenase subunit E  47.06 
 
 
161 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2245  NADH dehydrogenase subunit E  47.06 
 
 
161 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254081  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  42.95 
 
 
167 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2283  NADH dehydrogenase subunit E  47.06 
 
 
161 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960667  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2162  NADH dehydrogenase subunit E  47.06 
 
 
161 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5573  NADH dehydrogenase subunit E  45.75 
 
 
161 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0826314  normal  0.259752 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  45.1 
 
 
270 aa  136  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5176  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.31 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  48.57 
 
 
181 aa  135  4e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0965  NADH dehydrogenase subunit E  40.51 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489365  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  42.18 
 
 
260 aa  131  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  42.38 
 
 
249 aa  131  5e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  45 
 
 
180 aa  130  9e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1407  putative NADH dehydrogenase I (chain E) oxidoreductase protein  43.92 
 
 
162 aa  130  9e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0953  NADH dehydrogenase subunit E  42.57 
 
 
157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.544073 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.79 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2296  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.23 
 
 
222 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.45 
 
 
166 aa  128  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  41.72 
 
 
166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2395  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.76 
 
 
222 aa  128  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0717093  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44 
 
 
170 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.76 
 
 
412 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.76 
 
 
412 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  39.33 
 
 
239 aa  125  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0632  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.72 
 
 
154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1627  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.72 
 
 
154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3189  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.72 
 
 
154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.06 
 
 
412 aa  124  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2986  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.2 
 
 
229 aa  124  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0736686  normal  0.383268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.36 
 
 
385 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_7050  predicted protein  36.2 
 
 
217 aa  121  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000378621  hitchhiker  0.000000494703 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.82 
 
 
264 aa  120  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4394  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.28 
 
 
394 aa  120  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1924  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40 
 
 
172 aa  119  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.362282  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2831  NADH dehydrogenase subunit E  42.86 
 
 
228 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147014  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  40.67 
 
 
208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4200  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.61 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.61 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4355  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.61 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1359  NADH dehydrogenase subunit E  42.38 
 
 
221 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.127402  normal  0.0368394 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.26 
 
 
188 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1306  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.27 
 
 
222 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  0.728232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4558  NADH dehydrogenase subunit E  40.97 
 
 
203 aa  117  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1883  NADH dehydrogenase subunit E  40.28 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.84 
 
 
457 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4629  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.36 
 
 
229 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1313  NADH dehydrogenase subunit E  40 
 
 
402 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0324148  normal  0.032376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2406  NADH dehydrogenase subunit E  38.36 
 
 
265 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>