More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1924 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1924  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  100 
 
 
172 aa  356  8e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.362282  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.54 
 
 
176 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.03 
 
 
168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.48 
 
 
166 aa  123  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  38.67 
 
 
155 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  38.67 
 
 
155 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  40.38 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0821  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.452585  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1960  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.4 
 
 
165 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.96 
 
 
170 aa  117  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2827  NADH dehydrogenase subunit E  40.76 
 
 
175 aa  117  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.169197  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2156  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.51 
 
 
224 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  38.92 
 
 
168 aa  115  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  35.9 
 
 
166 aa  114  5e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  38.85 
 
 
158 aa  112  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01291  NADH dehydrogenase subunit E  38.92 
 
 
175 aa  111  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17741  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  36.42 
 
 
270 aa  111  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  36.53 
 
 
249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0482  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.33 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4167  bidirectional hydrogenase complex protein HoxE  42.75 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.99 
 
 
159 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0916  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  33.95 
 
 
162 aa  108  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0147  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  37.58 
 
 
174 aa  108  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  34.97 
 
 
239 aa  108  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1359  NADH dehydrogenase subunit E  36.94 
 
 
221 aa  108  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.127402  normal  0.0368394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2831  NADH dehydrogenase subunit E  38.18 
 
 
228 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147014  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0273  NADH dehydrogenase subunit E  38.16 
 
 
175 aa  108  5e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0244  NADH dehydrogenase subunit E  38.16 
 
 
175 aa  107  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  38.06 
 
 
208 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.2 
 
 
165 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.44 
 
 
230 aa  106  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.16 
 
 
174 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.69 
 
 
163 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.69 
 
 
163 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0367  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.01 
 
 
208 aa  105  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  38.12 
 
 
167 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0931  NADH dehydrogenase subunit E  42.86 
 
 
168 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.49 
 
 
174 aa  104  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.3 
 
 
163 aa  104  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.56 
 
 
161 aa  104  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0271  NADH dehydrogenase subunit E  35.95 
 
 
269 aa  104  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.3 
 
 
163 aa  104  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.55 
 
 
169 aa  104  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  38.12 
 
 
167 aa  104  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1881  NADH dehydrogenase subunit E  34.52 
 
 
253 aa  103  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.54783 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3292  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  33.55 
 
 
177 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1602  NADP-reducing hydrogenase chain A  38.78 
 
 
173 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3083  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.36 
 
 
174 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  37.42 
 
 
260 aa  102  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.62 
 
 
175 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  37.5 
 
 
167 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0953  NADH dehydrogenase subunit E  36.6 
 
 
157 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.544073 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1016  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  31.54 
 
 
168 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.664946  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0965  NADH dehydrogenase subunit E  38.06 
 
 
168 aa  101  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489365  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.22 
 
 
216 aa  101  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103945  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3518  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  35.66 
 
 
172 aa  101  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3599  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.87 
 
 
158 aa  101  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  32.72 
 
 
273 aa  100  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0285  NADH-quinone oxidoreductase subunit E  34.18 
 
 
231 aa  100  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1761  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.94 
 
 
170 aa  100  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5176  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.59 
 
 
163 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1312  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.54 
 
 
160 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  37.5 
 
 
174 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2809  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.36 
 
 
165 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  37.82 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1428  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.92 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464968  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1025  Fe-hydrogenase, gamma subunit  35.43 
 
 
148 aa  98.6  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4653  bidirectional hydrogenase complex protein HoxE  37.41 
 
 
164 aa  98.2  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0099  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  37.98 
 
 
179 aa  97.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  36.84 
 
 
174 aa  97.8  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1032  NADH dehydrogenase subunit E  35.62 
 
 
161 aa  97.8  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0249192  normal  0.0947418 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1636  NADP-reducing hydrogenase chain A  35.33 
 
 
172 aa  97.4  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000374752  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4053  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  37.4 
 
 
176 aa  97.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.199987 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  35.93 
 
 
239 aa  97.1  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5573  NADH dehydrogenase subunit E  35 
 
 
161 aa  97.1  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0826314  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0096  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  37.98 
 
 
179 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.598667 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  32.93 
 
 
706 aa  96.7  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3252  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.97 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3172  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.34 
 
 
237 aa  96.7  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2162  NADH dehydrogenase subunit E  35 
 
 
161 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1633  NADH dehydrogenase subunit E  35 
 
 
161 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2269  NADH dehydrogenase subunit E  35 
 
 
161 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128082  normal  0.14114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2283  NADH dehydrogenase subunit E  35 
 
 
161 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960667  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2245  NADH dehydrogenase subunit E  35 
 
 
161 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254081  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0108  hypothetical protein  35.62 
 
 
377 aa  96.7  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.996331  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0995  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  36.05 
 
 
164 aa  96.3  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.41379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.5 
 
 
170 aa  96.7  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1825  NADH dehydrogenase subunit E  35.62 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1439  NADH dehydrogenase subunit E  35.62 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0487171  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4485  NADH dehydrogenase subunit E  33.53 
 
 
287 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256998  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1303  NADH dehydrogenase subunit E  35.62 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1065  NADH dehydrogenase subunit E  35.62 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.331293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1294  NADH dehydrogenase subunit E  35.62 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0417  NADH dehydrogenase subunit E  35.62 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3210  NADH dehydrogenase subunit E  35 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2098  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.82 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.380739  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1829  Fe-hydrogenase, gamma subunit  35.43 
 
 
148 aa  96.3  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1134  NADH dehydrogenase subunit E  35.62 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0930546  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0733  NADH dehydrogenase subunit E  35.62 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1505  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.33 
 
 
175 aa  95.5  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00485138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>