More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1881 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1881  NADH dehydrogenase subunit E  100 
 
 
253 aa  513  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.54783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4485  NADH dehydrogenase subunit E  82.3 
 
 
287 aa  403  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256998  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1546  NADH dehydrogenase subunit E  75.21 
 
 
294 aa  364  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67963  normal  0.132733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1576  NADH dehydrogenase subunit E  74.79 
 
 
294 aa  361  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.685824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1600  NADH dehydrogenase subunit E  74.79 
 
 
294 aa  361  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.737975  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13170  NADH dehydrogenase subunit E  65.27 
 
 
252 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  60.18 
 
 
248 aa  276  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.941311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3172  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  64.41 
 
 
237 aa  275  7e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0285  NADH-quinone oxidoreductase subunit E  59.13 
 
 
231 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  60.27 
 
 
294 aa  268  5e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  58.64 
 
 
239 aa  263  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  71.28 
 
 
706 aa  263  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0271  NADH dehydrogenase subunit E  62.2 
 
 
269 aa  261  6e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3225  NADH dehydrogenase subunit E  59.45 
 
 
283 aa  261  6.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0065484 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0543  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  55.83 
 
 
269 aa  258  4e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07420  NADH dehydrogenase subunit E  57.41 
 
 
319 aa  258  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0368218 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0473  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  58.14 
 
 
302 aa  257  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0588  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit- like protein  56.02 
 
 
219 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4414  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  55.41 
 
 
240 aa  255  6e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  59.55 
 
 
228 aa  238  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4459  NADH dehydrogenase subunit E  54.35 
 
 
305 aa  236  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0524  NADH dehydrogenase subunit E  54.5 
 
 
263 aa  234  9e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1278  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  54.25 
 
 
230 aa  233  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.468909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4061  NADH dehydrogenase subunit E  55.24 
 
 
317 aa  231  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732889  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4554  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  52.1 
 
 
341 aa  231  9e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  52.91 
 
 
273 aa  229  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0978  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  55.24 
 
 
249 aa  216  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03200  NADH dehydrogenase subunit E  50.66 
 
 
253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  52.83 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6678  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  49.37 
 
 
254 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0367  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  50.66 
 
 
208 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  36.78 
 
 
239 aa  129  6e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1312  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.87 
 
 
160 aa  128  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.94 
 
 
170 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  38.51 
 
 
166 aa  122  4e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  34.45 
 
 
270 aa  122  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  38.31 
 
 
249 aa  122  7e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.79 
 
 
165 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2156  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.67 
 
 
224 aa  119  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.36 
 
 
174 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  40.26 
 
 
180 aa  119  6e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  40.4 
 
 
181 aa  117  9.999999999999999e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.5 
 
 
188 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.29 
 
 
163 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.1 
 
 
161 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.27 
 
 
170 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.29 
 
 
163 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4355  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.87 
 
 
171 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.87 
 
 
171 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4200  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.87 
 
 
171 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.32 
 
 
176 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.55 
 
 
174 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  39.38 
 
 
208 aa  113  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0482  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.06 
 
 
162 aa  112  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2703  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  39.16 
 
 
151 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.12 
 
 
175 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.14 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  38.71 
 
 
181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.5 
 
 
169 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0697  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.69 
 
 
157 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000280605  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0721  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.69 
 
 
157 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000389921  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0913  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.46 
 
 
203 aa  109  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  35.44 
 
 
260 aa  108  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.73 
 
 
385 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2809  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.26 
 
 
165 aa  108  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2986  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.12 
 
 
229 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0736686  normal  0.383268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.27 
 
 
163 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.27 
 
 
163 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1279  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.57 
 
 
183 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  32.65 
 
 
385 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4629  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.42 
 
 
229 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1873  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  36.73 
 
 
188 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3252  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.11 
 
 
166 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.36 
 
 
412 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.36 
 
 
412 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5176  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.27 
 
 
163 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.89 
 
 
230 aa  105  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0338  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.06 
 
 
165 aa  105  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113802  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0806  NADH dehydrogenase subunit E  31.63 
 
 
237 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0801  NADH dehydrogenase subunit E  31.63 
 
 
237 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.79 
 
 
166 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38 
 
 
457 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1924  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.52 
 
 
172 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.362282  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1176  NADH dehydrogenase subunit E  34.44 
 
 
395 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.99 
 
 
412 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1428  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.33 
 
 
165 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464968  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1016  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.11 
 
 
168 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.664946  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1497  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.18 
 
 
162 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.358345  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1717  NADH dehydrogenase subunit E  32.28 
 
 
266 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3083  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.01 
 
 
174 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0806  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  32.41 
 
 
149 aa  102  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.91557  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0893  NADH dehydrogenase subunit E  35.06 
 
 
273 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58748  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2236  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.55 
 
 
163 aa  102  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4394  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.67 
 
 
394 aa  101  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  35.71 
 
 
174 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  35.71 
 
 
174 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0096  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.92 
 
 
162 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108902 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1169  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  32.39 
 
 
160 aa  100  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.516989  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  36.24 
 
 
155 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3222  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.21 
 
 
208 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.237944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>